Job Description P32138 Confidence 97.55% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 91 Aligned Residues 367 % Identity 14% Template c2d0gA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-amylase i; PDBTitle: crystal structure of thermoactinomyces vulgaris r-47 alpha-2 amylase 1 (tvai) mutant d356n/e396q complexed with p5, a3 pullulan model oligosaccharide Resolution 2.60 Å

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		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.		.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.			.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.					.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.												.																								.	.																	.	.	.	.
Query SS confidence																	.												.																								.	.																	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	.	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	.	.	N	Y	P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	.	.	.	.	V	Q	F	L	A	Y	I
Query Conservation																	.												.																								.	.																	.	.	.	.
Alig confidence																	.				.	.							.																.	.							.	.																	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.																							.	.
Template Sequence		G	D	L	A	G	I	D	Q	K	L	G	Y	I	K	K	T	L	G	A	.	.	N	I	L	Y	L	N	P	I	F	K	A	P	T	N	H	K	Y	D	T	Q	D	Y	.	.	M	A	V	D	P	A	F	G	D	N	S	T	L	Q	T	L	I	N	D	I	H	S	T	A	N	G	P	K	G	Y	L	I	L	D	G
Template Known Secondary structure										T						T	T	T			.	.						S						S	S	S	S			S		S			.	.					T	T	T																S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.																							.	.
Template SS confidence
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.			.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.			.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
		335	.		.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.															.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.			380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.																	.	.
Query SS confidence				.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.																	.	.
Query Sequence		N	P	.	Y	V	A	S	D	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	.	.	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	.	.
Query Conservation				.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.																	.	.
Alig confidence				.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	F	N	H	T	G	D	S	H	P	W	F	D	K	Y	N	N	F	S	S	Q	G	A	Y	E	S	Q	S	S	P	W	Y	N	Y	Y	T	F	Y	T	W	P	D	S	Y	A	S	F	L	G	F	N	S	L	P	K	L	N	Y	G	N	S	G	S	A	V	R	G	V	I	Y	N	N	S	N	S	V	A	K	T	Y
Template Known Secondary structure				S	B			T	T	S	T	T	T		T	T			S	S	S			T	T	T		T	T		T	T	G	G	G	B					T	T	T						T	T						B	B				S	T	T								T	T	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
					396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	Y	L	P	T	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.																.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.																.	.	.
Template Sequence		L	N	P	P	Y	S	V	D	G	W	R	L	N	A	A	Q	Y	V	D	A	N	G	N	N	G	S	D	V	T	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	Q	I	W	S	E	F	R	N	A	V	K	G	V	N	S	N	.	.	.	A	A	I	I	G	Q	Y	W	G	N	A	N	P	W	T	.	.	.	A	Q	G	N
Template Known Secondary structure			S	T	T	T								T	T	G	G	G			S	T	T				S	S			.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T	.	.	.								S	S			G	G	G	T	.	.	.	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.																.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.									.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390				.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.				.	.	.	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.			.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query Sequence		Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	L	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	.	.	R	W	C	D	F	S
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	W	D	A	A	T	N	F	D	G	F	T	Q	P	V	S	E	W	I	T	G	K	D	Y	Q	N	N	S	A	S	I	S	T	T	Q	F	D	S	W	L	R	G	T	R	A	N	Y	P	T	N	V	Q	Q	S	M	M	N	F	L	S	N	H	D	I	T	R	F	A	T	R	S	G	G	D	L	W	K	T	Y	L
Template Known Secondary structure		S		S			B		T	T	T	T										S	B		T	T	S		B																	T	T	S						T	T					S			T	T	S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		529	530	.	.	.	.	.	.	.	.															.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.						550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.
Query Sequence		A	F	T	P	M	M	R	T	H	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	D	.	.	.	.	.	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Sequence		A	L	I	F	Q	M	T	Y	V	G	T	P	T	I	Y	Y	G	D	E	Y	G	M	Q	G	G	A	D	P	D	N	R	R	S	F	D	W	S	Q	A	T	P	S	N	S	A	V	A	L	T	Q	K	L	I	T	I	R	N	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	L	R	T	G	S	.	.	F	M	T
Template Known Secondary structure							T	T	S	S	S						T	T	T	T	T	T					S	T	T	T	T	S					T	T	T	S	S	T	T	S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.										.	550	.	.	.	.	.			.	.	.
		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.									.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.			.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query Sequence		L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D	I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	N	W	V	H	A	W	T	G	E	A	F	.	.	R	G	G	E	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Alig confidence																			.	.	.							.	.															.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation																			.	.	.							.	.
Template Sequence		L	I	T	D	D	T	N	K	I	Y	S	Y	G	R	F	D	N	.	.	.	V	N	R	I	A	V	.	.	V	L	N	N	D	S	V	S	H	T	V	N	V	P	V	W	Q	L	S	M	P	N	G	S	T	V	T	D	K	I	T	G	H	S	Y	T	V	Q	N	G	M	V	T	V	A	V	D	G	H	Y	G	A
Template Known Secondary structure						T	T	T	T									S	.	.	.	S						.	.					S	S	S								G	G	G	G	T			T	T						T	T	T							B	T	T	B							T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.							.	.
Template SS confidence
		559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.				.	.	.	.	580	.			.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.
		660	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	Y	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	L	A	Q
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		634	.	.	.