Job Description P32138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 427 % Identity 13% Template c1zy9A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of alpha-galactosidase (ec 3.2.1.22) (melibiase)2 (tm1192) from thermotoga maritima at 2.34 a resolution Resolution 2.34 Å

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		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.											.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.					.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Query Sequence		I	S	A	D	D	Q	G	R	L	L	L	E	L	Q	N	D	N	L	N	H	N	R	I	W	L	R	L	A	A	Q	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	I	Y	G	C	G	E	Q	F	S	Y	.	.	.	.	F	D	L	R	G	K	P	F	P	L	W	T	S	E	Q	G	V	G	R	N	K	Q
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Alig confidence																							.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation																							.
Template Sequence		V	L	K	E	K	N	F	T	V	E	F	A	V	E	K	I	H	L	G	W	K	.	I	S	G	R	V	K	G	S	P	G	R	L	E	V	L	R	T	K	A	P	E	K	V	L	V	N	N	W	Q	S	W	G	P	C	R	V	V	D	A	F	S	F	K	P	P	E	I	D	P	N	W	R	Y	T	A	S	V	V
Template Known Secondary structure						S	S											T	T				.																					S							S	B	T	T	S							G	G	G								G	G	G						S	S
Template Predicted Secondary structure																							.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.		.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.							.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Y	V	T	W	Q	A	D	C	K	E	N	A	G	G	D	Y	Y	W	T	F	F	P	Q	.	.	.	.	.	.	P	T	F	V	S	T	Q	K	Y	Y	C	H	V	D	N	S	C	Y	M	N	F	D	F	S	A	P	E	Y	H	E	L	A	L	W	E	D	K	A	T	L	R	F	E	C	A	D	T	Y	I	S
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	D	V	L	E	R	N	L	Q	S	D	Y	F	V	A	E	E	G	K	V	Y	G	F	L	S	S	K	I	A	H	P	F	F	A	V	E	D	G	E	L	V	A	Y	L	E	Y	F	D	V	E	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	V	P	L	E	P	L	V	V	L	E	D	P	N	T	P	L
Template Known Secondary structure						T	T	S					S					T	T						S			S	S	S								T	T									T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														S
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.											.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.			.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.					.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.																				.	.	.	.
Query SS confidence												.	.																				.	.	.	.
Query Sequence		L	L	E	K	L	T	A	L	L	G	.	.	R	Q	P	E	L	P	D	W	I	Y	D	G	V	T	L	G	I	Q	G	.	.	.	.	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W
Query Conservation												.	.																				.	.	.	.
Alig confidence												.	.																				.	.	.	.															.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	E	K	Y	A	E	L	V	G	X	E	N	N	A	R	V	P	K	H	T	P	T	G	W	C	S	W	Y	H	Y	F	L	D	L	T	W	E	E	T	L	K	N	L	K	L	A	K	N	.	.	F	P	F	E	V	F	Q	I	D	D	A	Y	E	K	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	W	L	V
Template Known Secondary structure														T	T					S	S							S					G	G	G													G	G	G	.	.	T	T		S						T	T	S				T	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.			.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.									.	.	230	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.		.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.
Query SS confidence																															.
Query Sequence		N	S	E	N	Y	P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	Y	.	V	A	S	D	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K
Query Conservation																															.
Alig confidence																															.											.	.
Template Conservation																																										.	.
Template Sequence		T	R	G	D	F	P	S	V	E	E	X	A	K	V	I	A	E	N	G	F	I	P	G	I	W	T	A	P	F	S	V	S	E	T	S	D	V	F	N	E	.	.	H	P	D	W	V	V	K	E	N	G	E	P	K	X	A	Y	R	N	W	N	K	K	I	Y	A	L	D	L	S	K	D	E	V	L	N	W	L	F
Template Known Secondary structure				T	T														T	T									T	T				T	T							.	.		G	G	G	B				T	T									T	T						B		T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.
Template SS confidence
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.			.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	I	K	K	N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	Y	L	P	T	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M
Query Conservation
Alig confidence							.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	F	S	S	.	L	R	K	X	G	Y	R	Y	F	K	I	D	F	L	F	A	G	A	V	P	G	E	R	K	K	N	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	Q	A	F	R	K	G	I	E	T	I	R	K	A	V	G	E	D	S	F	I	L	G	C	G	S	P	L	L	P	A	V	G	C	V	D	G
Template Known Secondary structure							.				T	T									G	G	G	G	G		S	S	B		S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.																		T	T	S						S		B	S	G	G	G	T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure							.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		311	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.									.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		468	.			470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.							.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.						.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.		.	.
Predicted Secondary structure				.	.														.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.																												.
Query SS confidence				.	.														.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.																												.
Query Sequence		M	W	.	.	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	.	.	.	.	.	.	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	.	.	.	.	.	I	G	G	Y	T	T	L	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C	D	F	S	A	F	T	.	P	M
Query Conservation				.	.														.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.																												.
Alig confidence		.		.	.														.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.					.	.	.																					.
Template Conservation		.																																																						.	.	.
Template Sequence		.	X	R	I	G	P	D	T	A	P	F	W	G	E	H	I	E	D	N	G	A	P	A	A	R	W	A	L	R	N	A	I	T	R	Y	F	X	H	D	R	F	W	L	N	D	P	D	C	L	I	L	R	E	E	.	.	.	K	T	D	L	T	Q	K	E	K	E	L	Y	S	Y	T	C	G	V	L	D	N	X	I
Template Known Secondary structure		.				S	S				S	S			T	T	S		S	S	S	S	S												T	G	G	G	B	T	T	T	B							B				S	S	.	.	.	S																		T	T
Template Predicted Secondary structure		.																																																						.	.	.
Template SS confidence
			382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.				.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	R	T	H	E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	D	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	E	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	S	L	V	R	D	H	G	K	K	V	L	K	E	T	L	E	L	L
Template Known Secondary structure					S	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G														T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		458	.	460	.									.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.