Job Description P32138 Confidence 98.23% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 39 Aligned Residues 360 % Identity 13% Template c1jibA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:neopullulanase; PDBTitle: complex of alpha-amylase ii (tva ii) from thermoactinomyces2 vulgaris r-47 with maltotetraose based on a crystal soaked3 with maltohexaose. Resolution 3.30 Å

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		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.			.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.
Predicted Secondary structure																												.																											.	.																							.
Query SS confidence																												.																											.	.																							.
Query Sequence		G	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y	P	.	.	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	.	Y	V
Query Conservation																												.																											.	.																							.
Alig confidence																					.	.						.																.	.										.	.																							.
Template Conservation																					.	.																						.	.
Template Sequence		G	D	L	K	G	V	I	D	R	L	P	Y	L	E	E	L	G	V	T	.	.	A	L	Y	F	T	P	I	F	A	S	P	S	H	H	K	Y	D	T	A	D	Y	.	.	L	A	I	D	P	Q	F	G	D	L	P	T	F	R	R	L	V	D	E	A	H	R	R	G	I	K	I	I	L	D	A	V	F	N	H	A
Template Known Secondary structure										T								T		S	.	.											S	S	S	S			S		S			.	.					T	T	T															T	T	T										S	B
Template Predicted Secondary structure																					.	.																						.	.
Template SS confidence
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.			.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.			210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.								.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.								.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	S	D	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	H	G	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G	V	.	.	.	.	.	.	.	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Conservation																																																																								.
Template Sequence		G	D	Q	F	F	A	F	R	D	V	L	Q	K	G	E	Q	S	R	Y	K	D	W	F	F	I	E	D	F	P	V	S	K	T	S	R	T	N	Y	E	T	F	A	V	Q	V	P	A	M	P	K	L	R	T	E	N	P	E	V	K	E	Y	L	F	D	V	A	R	F	W	M	.	E	Q	G	I	D	G	W	R	L
Template Known Secondary structure			T	T	S										G	G	G		T	T	G	G	G	S		B		S	S	S				S	S	S		S	B		B	S	S	S	S		T	T		B	B			T	T	S																.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																								.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	G	E	Y	L	P	T	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	L	A
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.																		.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.																		.
Template Sequence		N	V	A	N	E	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	A	F	W	R	E	F	R	R	L	V	K	S	L	N	P	D	.	.	.	A	L	I	V	G	E	I	W	H	D	A	S	G	W	L	M	G	.	D	Q	F	D	S	V	M	N	Y	L	F	R	E	S	V	I
Template Known Secondary structure		T	T	G	G	G	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T	T	.	.	.								S	S			T	T	T	T	T	T	.	T	S		S			B
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.																		.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.				.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.		.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		485	.	.											.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.											500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T	L	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C	D	F	S	A	F	T	.	P	M	M	R	T	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	F	F	A	T	G	E	I	H	A	E	R	F	D	A	E	L	T	R	A	R	M	L	Y	P	E	Q	A	A	Q	G	L	W	N	L	L	D	S	H	D	T	E	R	F	L	T	S	C	G	G	N	E	A	K	F	R	L	A	V	L	F	Q	M	T	Y	L	G	T	P	L	I	Y	Y	G	D	E	I	G	M	A
Template Known Secondary structure					T	S			S														T	T	S						T	T					S			T	T	S							T	T	T													T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
			537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.				.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
Predicted Secondary structure		.													.	.	.
Query SS confidence		.													.	.	.
Query Sequence		.	H	E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	.	.	.	D	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D
Query Conservation		.													.	.	.
Alig confidence		.													.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																					.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																					.	.	.
Template Sequence		G	A	T	D	P	D	C	R	R	P	M	I	W	E	E	K	E	Q	N	R	G	L	F	E	F	Y	K	E	L	I	R	L	R	H	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	L	T	R	G	N	.	.	V	R	S	W	H	A	D	K	Q	A	N	L	Y	A	F	V	R	T	V	Q	.	.	.	D	Q	H
Template Known Secondary structure				S	T	T	T	T								G	G	G	S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							.	.								T	T	T	T									T	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																					.	.	.
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.										.	.	500	.	.	.	.			.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.				.	.	.
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.				.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.			.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.														.	.
Query SS confidence																					.	.	.														.	.
Query Sequence		I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	.	.	.	E	D	N	W	V	H	A	W	T	G	E	A	F	.	.	R	G	G	E	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F	Y	R	A
Query Conservation																					.	.	.														.	.
Alig confidence																					.	.	.														.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	G	V	V	L	N	N	R	G	E	K	Q	T	V	L	L	Q	V	P	E	S	G	G	K	T	W	L	D	C	L	T	G	E	E	V	H	G	K	Q	G	Q	L	K	L	T	L	R	P	Y	Q	G	M	I	L	W	N	G
Template Known Secondary structure									S	S	S										T	T	S		S					T	T	S								T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.