Job Description P32138 Confidence 98.84% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 30 Aligned Residues 355 % Identity 15% Template c1gviA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:maltogenic amylase; PDBTitle: thermus maltogenic amylase in complex with beta-cd Resolution 3.3 Å

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		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.	.	340
Predicted Secondary structure																												.																																																	.
Query SS confidence																												.																																																	.
Query Sequence		G	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y	P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	.	Y	V	A	S
Query Conservation																												.																																																	.
Alig confidence																			.	.								.																																																	.
Template Conservation																			.	.
Template Sequence		G	D	L	Q	G	I	I	D	H	L	D	Y	L	A	D	L	G	.	.	I	T	G	I	Y	L	T	P	I	F	R	A	P	S	N	H	K	Y	D	T	A	D	Y	F	E	I	D	P	H	F	G	D	K	E	T	L	K	T	L	V	K	R	C	H	E	K	G	I	R	V	M	L	D	A	V	F	N	H	C	G	Y
Template Known Secondary structure										T								T	.	.										B	S		S	S	S	S	T	T	S		S		T	T	S	B		T	T	T																	T										S	B			T
Template Predicted Secondary structure																			.	.
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.			190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350														.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	F	A	P	F	Q	D	V	L	K	N	G	A	A	S	R	Y	K	D	W	F	H	I	R	E	F	P	L	Q	T	E	P	R	P	N	Y	D	T	F	A	F	V	P	H	M	P	K	L	N	T	A	H	P	E	V	K	R	Y	L	L	D	V	A	T	Y	W	I	R	E	F	D	I	D	G	W	R	L	D	V	A
Template Known Secondary structure		T											G	G	G		T	T	G	G	G	B		B	S	S	S	S				S	S	S		S	B		B	S	S	S		T	T	S	B	B	B		T	T	S																		S								T	T	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Y	L	P	T	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.															.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.															.	.	.	.
Template Sequence		N	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	Q	F	W	R	E	F	R	Q	A	V	K	A	L	K	P	D	.	.	.	V	Y	I	L	G	L	I	W	H	D	A	M	P	W	.	.	.	.	L	R	G	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	L	A	D	A	A	L
Template Known Secondary structure		G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T	.	.	.								S	S			T	T	T	.	.	.	.	T	T	T	T	S		S			B
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.															.	.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.																				.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.				.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.					.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
				477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.											500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	W	S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T	L	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C	D	F	S	A	F	T	.	P	M	M	R	T	H	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.							.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.							.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	F	F	A	K	E	D	M	S	A	S	E	F	A	D	R	L	M	H	V	L	H	S	Y	P	K	Q	V	N	E	A	A	F	N	L	L	G	S	H	D	T	P	R	L	L	T	V	C	G	G	D	V	R	K	V	K	L	L	F	L	F	Q	L	T	F	T	G	S	P	C	I	Y	Y	G	D	E	I	G	M	T
Template Known Secondary structure					T	S			S														T	T	S							T		B		B	S			S	S	S								T	T														T	S	S	S						T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
		538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.						.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.
Query Sequence		E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	.	.	.	.	.	D	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D
Query Conservation													.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																					.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																					.	.	.
Template Sequence		G	G	N	D	P	E	C	R	K	C	M	V	W	D	P	E	K	Q	N	K	E	L	Y	E	H	V	K	Q	L	I	A	L	R	K	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	L	R	R	G	D	.	.	V	A	F	L	T	A	D	D	E	V	N	H	L	V	Y	A	K	T	D	G	.	.	.	N	E	T
Template Known Secondary structure				S	T	T	G	G	G							T	T	T	S																	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	B	.	.			B				S	S		T	T									T	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																					.	.	.
Template SS confidence
		465	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500										.	.	.	.	.	.	.			.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.				.	.	530
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.					.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.			.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.														.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.														.	.
Query Sequence		I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	.	.	.	.	E	D	N	W	V	H	A	W	T	G	E	A	F	.	.	R	G	G	E	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F
Query Conservation																					.	.	.	.														.	.
Alig confidence					.	.															.	.	.	.														.	.
Template Conservation					.	.
Template Sequence		V	M	I	.	.	I	I	N	R	S	N	E	A	A	E	I	P	M	P	I	D	A	R	G	K	W	L	V	N	L	L	T	G	E	R	F	A	A	E	A	E	T	L	C	V	S	L	P	P	Y	G	F	V	L	Y
Template Known Secondary structure					.	.					S	S	S										T	T							T	T	T								S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.
Template SS confidence
		531	.	.			.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.