Job Description P76585 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 12:24:52 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 500 % Identity 8% Template d2ooea1 SCOP info alpha-alpha superhelix TPR-like HAT/Suf repeat Resolution 3.00

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		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	G	V	A	L	D	P	L	D	Y	R	C	N	L	A	L	A	M	L	E	Y	N	R	A	D	F	P	Q	A	V	A	Y	A	T	Q	A	L	K	R	A	H	A	L	N	K	N	P	Q	C	G	Q	A	S	L	I	R	A	S	A	Y	E	R	Q	G	Q	Y	Q	Q	A	E	E	D	F	W	R	A	V	W	S
Query Conservation
Alig confidence																					.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	K	L	E	E	N	P	Y	D	L	D	A	W	S	I	L	I	R	.	E	A	Q	N	Q	P	I	D	K	A	R	K	T	Y	E	R	L	V	A	Q	F	.	.	.	.	.	.	P	S	S	G	R	F	W	K	L	Y	I	E	A	E	I	K	A	K	N	Y	D	K	V	E	K	L	F	Q	R	C	L	M	K
Template Known Secondary structure									T	T											.				S	S														T	T		.	.	.	.	.	.	T	T															T	T													T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.							.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	S	K	A	G	G	Y	Y	G	L	A	R	L	A	A	R	N	G	N	F	D	A	G	L	D	F	C	Q	Q	S	L	R	A	C	P	T	N	Q	E	V	L	C	L	H	N	L	L	L	V	L	S	G	R	Q	D	N	A	R	V	Q	R	E	K	L	L	R	D	Y	P	L	N	A	T	L	W	W	L	N	W
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	L	H	I	D	L	W	K	C	Y	L	S	Y	V	R	E	T	K	G	K	L	P	S	Y	K	E	K	M	A	Q	A	Y	D	F	A	L	D	K	I	G	M	E	I	M	S	Y	Q	I	W	V	D	Y	I	N	F	L	K	G	V	E	A	V	G	S	Y	A	E	N	Q	R	I	T	A	V	R	R	V	Y	Q	R
Template Known Secondary structure																			T	T	T	S	T	T																T	T	T	S	T	T															S				S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	D	G	R	S	E	S	A	L	A	Q	W	R	G	L	C	Q	G	R	D	V	N	A	L	M	T	A	G	Q	L	I	N	W	G	M	P	T	L	A	A	E	M	L	N	A	L	D	C	Q	R	T	L	P	L	Y	L	Q	A	S	L	L	P	K	A	E	R	G	E	L	V	A	K	A	I	D	V	F	P	Q	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	C	V	N	P	M	I	N	I	E	Q	L	W	R	D	Y	N	K	Y	E	E	G	I	N	I	H	L	A	K	K	M	I	E	D	R	S	R	D	Y	M	N	A	R	R	V	A	K	E	Y	E	T	V	M	K	G	L	D	R	N	A	P	S	V	P	P	Q	P	Q	E	A	Q	Q	V	D	M	W	K	K	Y	I
Template Known Secondary structure			T	T	S			T	T																										T	T																							S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
		725	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	R	F	P	N	T	L	E	E	V	A	A	L	E	S	I	E	E	C	W	F	A	R	H	L	L	A	C	F	Y	Y	N	K	R	S	Y	N	K	A	I	A	F	W	Q	R	C	V	E	M	S	P	E	F	A	D	G	W	R	G	L	A	I	H	A	W	N	K	Q	H	D	Y	E	L	A	A	R	Y	L	D	N
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.																																																					.
Template Conservation						.	.	.	.	.																																																					.
Template Sequence		Q	W	E	K	.	.	.	.	.	S	N	P	L	R	T	E	D	Q	T	L	I	T	K	R	V	M	F	A	Y	E	Q	C	L	L	V	L	G	H	H	P	D	I	W	Y	E	A	A	Q	Y	L	E	Q	S	S	K	L	L	A	E	K	G	.	D	M	N	N	A	K	L	F	S	D	E	A	A	N	I	Y	E	R
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.			S	S			S		S																			T	T																					T	T	T	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.																																																					.
Template SS confidence
		257	.	.	260						.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.		.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		805	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.		.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.
Query SS confidence																																													.
Query Sequence		A	Y	Q	L	A	P	Q	D	A	R	L	L	F	E	R	D	L	L	D	K	L	S	G	A	T	P	E	K	R	L	A	R	L	E	N	N	L	E	I	A	L	K	R	.	D	D	M	T	A	E	L	L	N	L	W	H	L	T	G	Q	A	D	K	A	A	D	I	L	A	T	R	K	F	H	P	W	E	G	G	E
Query Conservation																																													.
Alig confidence																																													.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	I	S	T	L	L	K	K	N	M	L	L	Y	F	A	Y	A	D	Y	E	E	S	R	M	K	Y	E	K	V	H	S	I	Y	N	R	L	L	A	I	E	D	I	D	P	T	L	V	Y	I	Q	Y	M	K	F	A	R	R	A	E	G	I	K	S	G	R	M	I	F	K	K	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	T	T		S	S															T	T															S	S	S	S																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		884	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.
Predicted Secondary structure																			.
Query SS confidence																			.
Query Sequence		G	K	V	T	S	Q	F	I	L	N	Q	L	L	R	A	W	Q	.	H	L	D	A	R	Q	P	Q	Q	A	C	E	L	L	H	A	A	L	H	Y	P	E	N	L	S	E	G	R	L	P	G	Q	T	D	N	D	I	W	F	W	Q	A	I	C	A	N	A	Q	G	D	E	T	E	A	T	R	C	L	R	L	A	A
Query Conservation																			.
Alig confidence		.																	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	E	D	A	R	T	R	H	H	V	Y	V	T	A	A	L	M	E	Y	Y	C	S	K	D	K	S	V	A	F	K	I	F	E	L	G	L	K	K	Y	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	E	Y	V	L	A	Y	I	D	Y	L	S	H	L	N	E	D	N	N	T	R	V	L	F	E	R	V	L
Template Known Secondary structure		.	T		T	T			T														T																		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.											.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
		963	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	D	R	T	I	N	I	H	S	Y	Y	N	D	Q	P	V	D	Y	L	F	W	Q	G	M	A	L	R	L	L	G	E	Q	Q	T	A	Q	Q	L	F	S	E	M	K	Q	W	A	Q	E	M	A	K	T	S	I	E	A	D	F	F
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	S	G	S	L	.	.	.	.	.	.	P	P	E	K	S	G	E	I	W	A	R	F	L	A	F	E	S	N	I	G	D	L	A	S	I	L	K	V	E	K	R	R	F	T	A	F	R	E	E	Y	E	G	K	E	T	A	L	L	V
Template Known Secondary structure			S			S	.	.	.	.	.	.		G	G	G															S	S																T					T	T							G
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		472	.	.	.	.							.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.