Job Description P76585 Confidence 99.94% Date Thu Jan 5 12:24:52 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 356 % Identity 17% Template c3iegB_ PDB info PDB header:chaperone Chain: B: PDB Molecule:dnaj homolog subfamily c member 3; PDBTitle: crystal structure of p58(ipk) tpr domain at 2.5 a Resolution 2.51 Å

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		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	G	Q	A	S	L	I	R	A	S	A	Y	E	R	Q	G	Q	Y	Q	Q	A	E	E	D	F	W	R	A	V	W	S	G	N	S	K	A	G	G	Y	Y	G	L	A	R	L	A	A	R	N	G	N	F	D	A	G	L	D	F	C	Q	Q	S	L	R	A	C	P	T	N	Q	E	V	L	C	L	H	N	L	L	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	V	E	K	H	L	E	L	G	K	K	L	L	A	A	G	Q	L	A	D	A	L	S	Q	F	H	A	A	V	D	G	D	P	D	N	Y	I	A	Y	Y	R	R	A	T	V	F	L	A	X	G	K	S	K	A	A	L	P	D	L	T	K	V	I	A	L	K	X	D	F	T	A	A	R	L	Q	R	G	H	L	L
Template Known Secondary structure																T	T																	T	T															T	T																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		614	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	S	G	R	Q	D	N	A	R	V	Q	R	E	K	L	L	R	D	Y	P	L	N	A	T	L	W	W	L	N	W	F	D	G	R	S	E	S	A	L	A	Q	W	R	G	L	C	Q	G	R	D	V	N	A	L	M	T	A	G	Q	L	I	N	W	G	M	P	T	L	A	A	E	M	L	N	A	L	D	C	Q
Query Conservation
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	Q	G	K	L	D	E	A	E	D	D	F	K	K	V	L	K	S	N	P	S	E	Q	E	E	K	E	A	E	S	Q	L	V	K	A	D	E	X	Q	R	L	R	S	Q	A	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T														T	T																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	T	L	P	L	Y	L	Q	A	S	L	L	P	K	A	E	R	G	E	L	V	A	K	A	I	D	V	F	P	Q	F	V	R	F	P	N	T	L	E	E	V	A	A	L	E	S	I	E	E	C	W	F	A	R	H	L	L	A	C	F	Y	Y	N	K	R	S	Y	N	K	A	I	A	F	W	Q	R	C	V	E	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	D	G	A	D	Y	T	A	A	I	T	F	L	D	K	I	L	E	V	C	V	W	D	A	E	L	R	E	L	R	A	E	C	F	I	K	E	G	E	P	R	K	A	I	S	D	L	K	A	A	S	K	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T														T	T	S	T	T																T															S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																												164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
		774	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	E	F	A	D	G	W	R	G	L	A	I	H	A	W	N	K	Q	H	D	Y	E	L	A	A	R	Y	L	D	N	A	Y	Q	L	A	P	Q	D	A	R	L	L	F	E	R	D	L	L	D	K	L	S	G	A	T	P	E	K	R	L	A	R	L	E	N	N	L	E	I	A	L	K	R	D	D	M	T	A	E
Query Conservation
Alig confidence														.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	S	D	N	T	E	A	F	Y	K	I	S	.	T	L	Y	Y	Q	L	G	D	H	E	L	S	L	S	E	V	R	E	C	L	K	L	D	Q	D	H	K	R	C	F	A	H	Y	K	Q	V	K	K	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	I	E
Template Known Secondary structure			S											.							T																	T	T																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								270	.	.	.
		854	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	N	L	W	H	L	T	G	Q	A	D	K	A	A	D	I	L	A	T	R	K	F	H	P	W	E	G	G	E	G	K	V	T	S	Q	F	I	L	N	Q	L	L	R	A	W	Q	H	L	D	A	R	Q	P	Q	Q	A	C	E	L	L	H	A	A	L	H	Y	P	E	N	L	S	E	G	R	L	P	G	Q	T
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	E	E	L	I	R	D	G	R	Y	T	D	A	T	S	K	Y	E	S	V	X	K	T	.	.	.	.	.	E	P	S	V	A	E	Y	T	V	R	S	K	E	R	I	C	H	C	F	S	K	D	E	K	P	V	E	A	I	R	I	C	S	E	V	L	Q	X	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	D
Template Known Secondary structure									T	T																.	.	.	.	.	S		S																			T	T																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.						.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.											.	.	.
		934	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	N	D	I	W	F	W	Q	A	I	C	A	N	A	Q	G	D	E	T	E	A	T	R	C	L	R	L	A	A	T	G	D	R	T	I	N	I	H	S	Y	Y	N	D	Q	P	V	D	Y	L	F	W	Q	G	M	A	L	R	L	L	G	E	Q	Q
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	V	N	A	L	K	D	R	A	E	A	Y	L	I	E	E	X	Y	D	E	A	I	Q	D	Y	E	A	A	Q	E	H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	D	Q	Q	I	R	E	G	L	E	K	A	Q	R	L	L	K	Q	S	Q
Template Known Secondary structure																T	T														T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370											.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.