Job Description P07813 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:33 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 701 % Identity 27% Template c1wz2B_ PDB info PDB header:ligase/rna Chain: B: PDB Molecule:leucyl-trna synthetase; PDBTitle: the crystal structure of leucyl-trna synthetase and trna(leucine)2 complex Resolution 3.21 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.			.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.
Query SS confidence																								.	.
Query Sequence		R	P	E	E	I	E	S	K	V	Q	L	H	W	D	E	K	R	T	F	E	V	T	.	.	E	D	E	S	K	E	K	Y	Y	C	L	S	M	L	P	Y	P	S	G	R	L	H	M	G	H	V	R	N	Y	T	I	G	D	V	I	A	R	Y	Q	R	M	L	G	K	N	V	L	Q	P	I	G	W	D	A	F	G
Query Conservation																								.	.
Alig confidence																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	F	K	A	I	E	E	K	W	Q	K	R	W	L	E	A	K	I	F	E	P	N	I	R	D	K	P	K	E	K	K	F	Y	I	T	V	A	F	P	Y	L	S	G	H	L	H	V	G	H	A	R	T	Y	T	I	P	D	V	I	A	R	F	K	R	M	Q	G	Y	N	V	L	F	P	M	A	W	H	I	T	G
Template Known Secondary structure																		T	T	T	S			S	T	T	S		G	G	G			B							B		S	S			B																				T	T				B					B	B			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		84	.	.	.	.	.	90																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.			130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Query Sequence		L	P	A	E	G	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	N	N	T	A	P	A	P	W	T	Y	D	N	I	A	Y	M	K	N	Q	L	K	M	L	G	F	G	Y	D	W	S	R	E	L	A	T	C	T	.	.	P	E	Y	Y	R	W	E	Q
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	P	I	V	G	I	A	E	R	I	K	N	R	D	P	K	T	I	W	I	Y	R	D	V	Y	K	V	P	E	E	I	L	W	T	F	E	D	P	I	N	I	V	K	Y	F	M	K	A	A	K	E	T	F	I	R	A	G	F	S	V	D	W	S	R	E	F	Y	T	T	S	L	F	P	P	F	S	K	F	I	E
Template Known Secondary structure		S											T	T										T	T	S									G	G	G	S																		T	T	T					T	T	S			B		S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	F	F	T	E	L	Y	K	K	G	L	V	Y	K	K	T	S	A	V	N	W	C	P	N	D	Q	T	V	L	A	N	E	Q	V	I	D	G	C	C	W	R	C	D	T	K	V	E	R	K	E	I	P	Q	W	F	I	K	I	T	A	Y	A	D	E	L	L	N	D	L	D	K	L	D	H	W	P	D	T	V	K
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	Q	F	W	K	L	K	E	K	G	Y	I	V	K	G	A	H	R	V	R	W	D	P	V	V	G	T	P	L	G	D	H	D	L	M	E	G	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T	T	T	T													T	T	T	S		B			S	S	S		S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240			.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.						.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure																									.	.																																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.																																	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	M	Q	R	N	W	I	G	R	S	E	G	V	E	I	T	F	N	V	N	D	Y	D	.	.	N	T	L	T	V	Y	T	T	R	P	D	T	F	M	G	C	T	Y	L	A	V	A	A	G	H	P	L	A	Q	K	A	A	.	.	.	.	.	E	N	N	P	E	L	A	A	F	I	D	E	C	R	N	T	K	V
Query Conservation																									.	.																																	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																		.	.																																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	V	P	I	L	D	Y	I	I	I	K	F	E	L	R	E	N	G	E	V	I	Y	L	P	A	A	T	L	R	P	E	T	V	Y	G	V	T	N	M	W	V	N	P	N	A	T	Y	V	K	A	K	V	R	R	K	D	K	E	E	T	W	I	V	S	K	E	A	A	Y	K	L	S	F	Q	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.																S	S	S									S		G	G	G	G	G	G								S	S	S										S	S																		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	A	E	M	A	T	M	E	K	K	G	V	D	T	G	F	K	A	V	H	P	L	T	G	E	E	I	P	V	W	A	A	N	F	V	L	M	E	Y	G	T	G	A	V	M	A	V	P	G	H	D	Q	R	D	Y	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	S	K	Y	G	L
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	I	E	V	I	E	E	F	K	G	E	K	L	I	G	K	Y	V	R	N	P	V	S	G	D	E	V	I	I	L	P	A	E	F	V	D	P	D	N	A	T	G	V	V	M	S	V	P	A	H	A	P	F	D	H	V	A	L	E	D	L	K	R	E	T	E	I	L	E	K	Y	D	I	D	P	R	I	V	F
Template Known Secondary structure												S	S	T	T	S	S						S	S	S	S									S	S			S	S	S	T	T	S						T	T	S		T	T	T	T	T	T	T	S			S			S					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	I	K	P	V	I	L	A	A	D	G	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	L	S	Q	Q	A	L	T	E	K	G	V	L	F	N	S	G	E	F	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	V	E	E	V	N	K	L	G	I	K	S	Q	K	D	K	E	K	L	E	Q	A	T	K	T	I	Y	K	A	E	Y	H	K	G	I	F	K	V	P	P	Y	E	G	K	P	V	Q	E	V	K	E	A	I	A	K	E	M	L	E	K	G	I	A	E	I	M	Y	E	F	A	E	K	N	V	I	S	R	F	G
Template Known Secondary structure			S	S			T	T	T	S	S	S				S	S		T	T					T	T									S		B			S	S	S	S		S	S	B					T	T	T	T								T	S								S	S	S			B		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
								390	.	.	.	.	.	.	.	.	.			400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.															.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.				.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.											.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.											.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	L	D	H	E	A	A	F	N	A	I	.	.	A	D	K	L	T	A	M	G	V	G	E	R	K	V	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	R	D	W	G	V	S	R	Q	R	Y	W	G	A	P	I	P	M	.	.	.	V	T	L	E	D	G	T	V	M	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.											.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.											.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	R	A	V	I	K	I	I	H	D	Q	W	F	I	D	Y	G	N	P	E	W	K	E	K	A	R	K	A	L	E	R	M	K	I	L	P	E	T	R	R	A	Q	F	E	A	I	I	D	W	L	D	K	K	A	C	A	R	K	I	G	L	G	T	P	L	P	W	D	P	E	W	V	I	E	S	L	S	D	S	T
Template Known Secondary structure		S	B							S	S						S			T	T										T	T	S				S	S	T	T										S								B	S	S	S	S	S				T	T		T	T	S								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
		445	.	.	.		.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		T	P	D	D	.	Q	L	P	V	I	L	P	E	D	V	V	M	D	G	I	T	S	P	I	K	A	D	P	E	W	A	K	T	T	V	N	G	M	P	A	L	R	E	T	D	T	F	D	T	F	M	E	S	S	W	Y	Y	A	R	Y	T	C	P	Q	Y	K	E	G	M	L	D	S	E	A	A	N	Y	W	L	P
Query Conservation						.
Alig confidence						.																																	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	Y	M	A	Y	Y	T	I	S	R	H	I	N	K	L	R	Q	E	G	K	L	D	P	E	K	L	T	P	E	F	F	D	Y	I	F	L	E	.	.	E	F	S	E	D	K	E	K	E	L	E	K	K	T	G	I	P	A	E	I	I	H	E	M	K	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	F	E	Y	W	Y	P
Template Known Secondary structure		S	T																T	T				G	G	G									T	T	T	S	.	.															T											.	.	.	.	.	.	.	.								S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570			.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.									.	.	.	.	600	.	.	.
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560		.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure																																							.
Query SS confidence																																							.
Query Sequence		V	D	I	Y	I	G	G	I	E	H	A	I	M	H	L	L	Y	F	R	F	F	H	K	L	M	R	D	A	G	M	V	N	S	D	E	P	A	.	K	Q	L	L	C	Q	G	M	V	L	A	D	A	F	Y	Y	V	G	E	N	G	E	R	N	W	V	S	P	V	D	A	I	V	E	R	D	E	K	G	R	I	V
Query Conservation																																							.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.																			.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	W	R	C	S	G	K	D	L	I	P	N	.	.	.	.	.	.	H	L	T	F	F	I	F	N	H	V	A	I	F	R	E	E	H	W	P	K	G	I	A	V	N	G	F	G	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S						G	G	G	T	T	T	.	.	.	.	.	.													S		S	T	T	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		604	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.							.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
		603	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	K	D	A	A	G	H	E	L	V	Y	T	G	M	S	K	M	S	K	S	K	N	N	G	I	D	P	Q	V	M	V	E	R	Y	G	A	D	T	V	R	L	F	M	M	F	A	S	P	A	D	M	T	L	E	W	Q	E	S	G	V	E	G	A	N	R	F	L	K	R	V	W	K	L	V	Y	E	H	T	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	Q	K	M	S	K	S	K	G	N	V	L	N	F	I	D	A	I	E	E	N	G	A	D	V	V	R	L	Y	I	M	S	L	A	E	H	D	S	D	F	D	W	R	R	K	E	V	G	K	L	R	K	Q	I	E	R	F	Y	E	L	I	S	Q	F	A	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S				T	T	T					B							T	T															T	T																													.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Template SS confidence
															647	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.
		683	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.							.	.	750	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	D	V	A	A	L	N	V	D	A	L	T	E	N	Q	K	A	L	R	R	D	V	H	K	T	I	A	K	V	T	D	D	I	G	R	R	Q	T	F	N	T	A	I	A	A	I	M	E	L	M	N	K	L	A	K	A	P	T	D	G	E	Q	D	R	.	.	.	.	.	.	A	L	M	Q	E	A	L	L	A
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																						.																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																						.
Template Sequence		.	.	E	Y	E	V	K	G	N	V	E	L	K	D	I	D	R	W	M	L	H	R	L	N	K	A	I	K	E	T	T	N	A	L	E	E	F	R	T	.	R	T	A	V	Q	W	A	F	Y	S	I	M	N	D	L	R	W	Y	L	R	R	T	E	G	R	D	D	E	A	K	R	Y	V	L	R	T	L	A	D	V
Template Known Secondary structure		.	.	S	S																																T	T			.								T														T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.																																						.
Template SS confidence
				713	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.		750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		757	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.							.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	R	M	L	N	P	F	T	P	H	I	C	F	T	L	W	Q	E	L	K	G	E	G	D	I	D	N	A	P	W	P	V	A	D	E	K	A	M	V	E	.	.	.	.	.	.	D	S	T	L	V	V	V	Q	V	N	G	K	V	R	A	K	I	T	V	P
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	V	R	L	M	A	P	F	T	P	H	I	C	E	E	L	W	E	K	L	G	G	E	G	F	V	S	L	A	K	W	P	E	P	V	E	E	W	W	N	E	T	I	E	A	E	E	E	F	I	R	S	V	M	E	D	I	K	E	I	I	E	V	A	K	I	E
Template Known Secondary structure							T	T	T	S											S	S			S		G	G	G	S							S	S																										T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.