Job Description P31677 Confidence 98.34% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 47 Aligned Residues 317 % Identity 18% Template d2gj4a1 SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Oligosaccharide phosphorylase Resolution 1.60

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		126	.	.	.	130	.	.	.		.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.														.	.	150	.	.	.	.	.	.	.								.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence										.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	W	I	H	D	Y	H	.	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P	.	.	.	.	.	.	.	F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	D	.	.	.	.	.
Query Conservation										.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Alig confidence										.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	Q	L	N	D	T	H	P	S	L	A	I	P	E	L	M	R	V	L	V	D	L	E	R	L	D	W	D	K	A	W	E	V	T	V	K	T	C	A	Y	T	N	H	T	V	L	P	E	A	L	E	R	W	P	V	H	L	L	E	T	L	L	P	R	H	L	Q	I	I	Y	E	I	N	Q	R	F	L	N	R
Template Known Secondary structure							S	S	T	T	T	T												T	S																								G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
																						180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.					.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	.	.	.	.	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	A	A	F	P	G	D	V	D	R	L	R	R	M	S	L	V	E	E	G	A	V	K	R	I	N	M	A	H	L	C	I	A	G	S	H	A	V	N	G	V	A	R	I	H	S	E	I	L	K	K	T	I	F	K	D	F	Y	E	L	E	P	H	K	F	Q	N	K	T	N	G	I	T	P	R	R	W	L	V
Template Known Secondary structure						S	T	T										S				S	S	S												T		S					S	S										T	T	T								G	G	G								B		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	A	A	G	P	L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	C	N	P	G	L	A	E	I	I	A	E	R	I	G	E	E	Y	I	S	D	L	D	Q	L	R	K	L	L	S	Y	V	D	D	E	A	F	I	R	D	V	A	K	V	K	Q	E	N	K	L	K	F	A	A	Y	L	E	R	E	Y	K	V	H	I	N	P	N	S	L	F	D	V	Q	V	K	R	I	H	E	Y
Template Known Secondary structure			T														S	G	G	G	G		G	G	G	G	G	G	G	G	G	G	T	T																																	T	T	S							S				G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		494	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
		268	.	270	.	.		.	.	.	.	.	.	.	280			.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.			.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
Predicted Secondary structure							.									.	.																																																					.	.
Query SS confidence							.									.	.																																																					.	.
Query Sequence		K	G	L	P	E	.	R	F	L	A	Y	E	A	L	.	.	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	.	.	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R
Query Conservation							.									.	.																																																					.	.
Alig confidence							.									.	.																																													.	.	.						.	.
Template Conservation																																																														.	.	.
Template Sequence		K	R	Q	L	L	N	C	L	H	V	I	T	L	Y	N	R	I	K	K	E	P	N	K	F	V	V	P	R	T	V	M	I	G	G	K	A	A	P	G	Y	H	M	A	K	M	I	I	K	L	I	T	A	I	G	D	V	V	N	H	D	.	.	.	P	V	V	G	D	R	L	R	V	I	F	L	E	N	Y	R	V
Template Known Secondary structure		G	T																			T	T	S															T	T																			T	T		.	.	.	T	T	T	G	G	G							T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.
Template SS confidence
		574	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.				.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360			.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.							.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure																				.	.																																				.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.																																				.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	.	.	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	F	A	G	A	A	N	E	L	.	.	.	.	.	.	T	S	A	L	I	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.																																				.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.																	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	A	E	K	V	I	P	A	A	D	L	S	E	Q	I	S	T	A	G	T	E	A	S	G	T	G	N	M	K	F	M	L	N	G	A	.	.	.	.	.	.	L	T	I	G	T	M	D	G	A	N	V	E	M	A	E	E	A	G	E	E	N	F	F	I	F	G	M	R	V	E	D	V	D	R	L	D	Q	R
Template Known Secondary structure								G	G	G		S								T	T	S		S			S								T	T		.	.	.	.	.	.						S		T	T										G	G	G	S				S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		651	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.							.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
																															402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	Y	D	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Y	N	A	Q	E	Y	Y	D	R	I	P	E	L	R	Q	I	I	E	Q	L	S	S	G	F	F	S	P	K	Q	P	D	L	F	K	D	I	V	N	M	L	M	H	H	D	R	F	K	V	F	A	D	Y	E	E	Y	V	K	C	Q	E	R	V	S	A	L	Y	K	N	P	R	E	W	T	R	M	V	I	R	N
Template Known Secondary structure																									T	T	T		T	T	S	T	T	T	T												T	T		T	G	G	G																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		725	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	A	T	S	G	K	F	S	S	D	R	T	I	A	Q	Y	A	R	E	I
Template Known Secondary structure			T	T		G	G	G	B												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		805	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.