Job Description P31677 Confidence 98.26% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 316 % Identity 17% Template d1ygpa_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Oligosaccharide phosphorylase Resolution 2.80

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		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.															.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.								.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Query Sequence		L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P	.	.	.	.	.	.	.	F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	.	.
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	T	E	F	P	D	Q	V	A	I	Q	L	N	D	T	H	P	T	L	A	I	V	E	L	Q	R	V	L	V	D	L	E	K	L	D	W	H	E	A	W	D	I	V	T	K	T	F	A	Y	T	N	H	T	V	M	Q	E	A	L	E	K	W	P	R	R	L	F	G	H	L	L	P	R	H	L	E	I	I	Y	D
Template Known Secondary structure		G	G	G											S	S	T	T	T													T	T																							S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
																																									175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	N	W	F	F	L	E	D	V	A	K	K	F	P	K	D	V	D	L	L	S	R	I	S	I	I	E	E	N	S	P	E	R	Q	I	R	M	A	F	L	A	I	V	G	S	H	K	V	N	G	V	V	E	L	H	S	E	L	I	K	T	T	I	F	K	D	F	I	K	F	Y	G	P	S	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														S	T	T		T								S					S	S	S																			S	S										T	T	T									G	G	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K	Q	A	A	G	P	L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	K	F	V	N	V	T	N	G	I	T	P	R	R	W	L	K	Q	A	N	P	S	L	A	K	L	I	S	E	T	L	N	D	P	T	E	E	Y	L	L	D	M	A	K	L	T	Q	L	E	K	Y	V	E	D	K	E	F	L	K	K	W	N	Q	V	K	L	N	N	K	I	R	L	V	D	L	I	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	G								B						T	T	T	T												T	T		T	T		G	G	G	T		G	G	G	G	G	G	G	G	G	G	G	G		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
														251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.		.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.													290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	.	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	N	D	G	V	D	I	I	N	R	E	Y	L	D	D	T	L	F	D	M	Q	V	K	R	I	H	E	Y	K	R	Q	Q	L	N	V	F	G	I	I	Y	R	Y	L	A	M	K	N	M	L	K	N	G	A	S	I	E	E	V	A	R	K	Y	P	R	K	V	S	I	F	G	G	K	S	A	P	G	Y	Y	M
Template Known Secondary structure			T	T	T	T				S		S	T	T	G	G	G								S				G	G	G	T																					T	T										S													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360			.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.
Query SS confidence																																																									.	.
Query Sequence		A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	.	.	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L
Query Conservation																																																									.	.
Alig confidence				.																	.																																				.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.																	.																																																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	K	.	L	I	I	K	L	I	N	C	V	A	D	I	V	N	N	D	.	E	S	I	E	H	L	L	K	V	V	F	V	A	D	Y	N	V	S	K	A	E	I	I	I	P	A	S	D	L	S	E	H	I	S	T	A	G	T	E	A	S	G	T	S	N	M	K	F	V	M	N	G	G	.	.	.	.	.	.	L
Template Known Secondary structure				.														T	T		.	G	G	G	T	T	S							T	T										G	G	G		S								T	T			S										T	T	T		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.																	.																																																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		616	.		.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.		.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.							.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.							.	.	.	.	400	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query Sequence		V	L	S	Q	F	A	G	A	A	N	E	L	.	.	.	.	.	.	T	S	A	L	I	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	Y	D	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	.	.	.	.
Query Conservation														.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	I	G	T	V	D	G	A	N	V	E	I	T	R	E	I	G	E	D	N	V	F	L	F	G	N	L	S	E	N	V	E	E	L	R	Y	N	H	Q	Y	H	P	Q	D	L	P	S	S	L	D	S	V	L	S	Y	I	E	Q	F	S	P	E	N	P	N	E	F	K	P	L	V	D	S	I	K	Y	H	G	D	Y
Template Known Secondary structure						S		T											G	G	G	S				S																S															T					T	T	S	T	T	T	T										S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		688	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.
																					416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	L	V	S	D	D	F	E	S	Y	L	A	T	H	E	L	V	D	Q	E	F	H	N	Q	R	S	E	W	L	K	K	S	V	L	S	L	A	N	V	G	F	F	S	S	D	R	C	I	E	E	Y	S	D	T	I
Template Known Secondary structure		T																																							G	G	G	B												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		771	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.