Job Description P31677 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 352 % Identity 15% Template d1v4va_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase Resolution 1.80

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.						.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.
Query Sequence		S	R	L	V	V	V	S	N	R	I	A	P	P	D	E	H	A	A	S	A	G	G	L	A	V	G	.	.	.	.	.	I	L	G	A	L	K	A	A	G	G	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	K	V	K	K	G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q	D	L	D	E	Y
Query Conservation																												.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	R	V	V	L	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	R	P	E	A	T	K	X	A	P	V	Y	L	A	L	R	G	I	P	G	L	K	P	L	V	L	L	T	G	Q	H	R	E	Q	L	R	Q	A	L	S	L	F	G	I	Q	E	D	R	N	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S																T	S	T	T									S	S											T	T	T				S					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.														.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	N	Q	F	S	N	A	V	L	W	P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	X	Q	E	R	Q	A	L	P	D	L	A	A	R	I	L	P	Q	A	A	R	A	L	K	E	X	.	.	.	.	.	.	G	A	D	Y	V	L	V	H	G	D	T	L	T	T	F	A	V	A	W	A	A	F	L	E	G	I	P	V	G	H	V	E	A	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S																						T	.	.	.	.	.	.	T		S						S	S														T	T							T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90							.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K	Q
Query Conservation
Alig confidence				.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	.	S	G	N	L	K	E	P	F	P	E	E	A	N	R	R	L	T	D	V	L	T	D	L	D	F	A	P	T	P	L	A	K	A	N	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	G	K	R	E	E	G	I	L	V	T	G	Q	T	G	V	D	A	V	L	L	A	A
Template Known Secondary structure				.		S		T	T	S	S	T	T													S					S	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure				.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		125	.		.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	G	P	L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E	N
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	G	R	L	P	.	.	.	.	.	.	E	G	L	P	E	G	P	Y	V	T	V	T	X	H	R	R	E	N	W	P	L	L	S	D	L	A	Q	A	L	K	R	V	A	E	A	F	P	H	L	T	.	.	.	.	F	V	Y	P	V	H	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	T	T			S	S										G	G	G	G	G	G																T	T	S		.	.	.	.							S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.							.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.					.	.	.	.	.	.	.	240
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	F	A	G	A	A	N	E	L	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence		.																																											.	.	.	.	.														.	.	.	.	.														.
Template Conservation		.																																											.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template Sequence		.	P	V	V	R	E	A	V	F	P	V	L	K	G	V	R	N	F	V	L	L	D	P	L	E	Y	G	S	X	A	A	L	X	R	A	S	L	L	L	V	T	D	S	.	.	.	.	.	G	G	L	Q	E	E	G	A	A	L	G	V	P	.	.	.	.	.	V	V	V	L	R	N	V	T	E	R	P	E	G	L
Template Known Secondary structure		.												T	T		T	T																		T							S		.	.	.	.	.										T	T			.	.	.	.	.					S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure		.																																											.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
			241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.						.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.						.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	T	S	A	L	I	V	N	P	Y	D	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.									.															.
Template Conservation												.															.
Template Sequence		K	A	G	I	L	K	L	A	G	T	.	D	P	E	G	V	Y	R	V	V	K	G	L	L	E	.	N	P	E	E	L	S	R	X	R	K	A	K	N	P	Y	G	D	G	K	A	G	L	X	V	A	R	G	V	A	W	R	L
Template Known Secondary structure				T	S						S	.														T	.											S			S	S			S														T
Template Predicted Secondary structure												.															.
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.		.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.