Job Description P31677 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 403 % Identity 14% Template d1rzua_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Glycosyl transferases group 1 Resolution 2.30

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.					.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.																			.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	S	R	L	V	V	V	S	N	R	I	A	P	P	D	E	H	A	A	S	A	G	G	L	A	V	G	I	L	G	A	L	K	A	A	.	.	.	.	G	G	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	K	K
Query Conservation																																					.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.																	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.
Template Sequence		M	N	V	L	S	V	S	S	E	I	Y	P	L	I	.	.	.	.	.	K	T	G	G	L	A	D	V	V	G	A	L	P	I	A	L	E	A	H	G	V	R	T	R	T	L	I	P	G	Y	P	A	V	K	A	A	V	T	D	P	V	K	C	F	E	F	T	D	L	L	G	E	K	A	D	L	L	E	V	Q	H
Template Known Secondary structure									S		B	T	T	T	B	.	.	.	.	.		S	S															T	T	T																			S								S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.						.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.			.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.
Query SS confidence																																																																		.	.
Query Sequence		G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q	D	L	D	E	Y	Y	N	Q	F	S	N	A	V	L	W	P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	.	.	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P
Query Conservation																																																																		.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	R	L	D	L	L	I	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	A	Y	Y	E	R	S	G	G	P	Y	L	G	Q	T	G	K	D	Y	P	D	N	W	K	R	F	A	A	L	S	L	A	A	A	R	I	G	A	G	V	L	P	G	W	R	P	D	M	V	H	A	H	D	W	Q	A	A	M
Template Known Secondary structure		T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S	S		S	S	B		T	T	S	S	B		T	T																	T	T		S	S	S				S										T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.													.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.		.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	.	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P	F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	L	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D
Query Conservation												.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	V	Y	M	R	Y	A	E	T	P	E	I	P	S	L	L	T	I	H	N	I	A	F	Q	G	Q	F	G	A	N	I	F	S	K	L	A	L	P	A	H	A	F	G	M	E	G	I	E	Y	Y	N	D	V	S	F	L	K	G	G	L	Q	T	A	T	A	L	S	T	V	S	P	S	Y	A	E	E	I	L	T
Template Known Secondary structure									S	S	S										S		T	T							G	G	G	G	G	G	S				G	G	G	S	S	T	T	T	T			T	T													S					S								T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K	Q	A	A	G	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	F	G	M	G	L	E	G	V	I	G	S	.	.	.	.	.	.	.	R	A	H	V	L	H	G	I	V	N	G	I	D	A	D	V	W	N	P	A	T	D	H	L	I	H	D	N	Y	S	A	A	N	L	K	N	R	A	L	N	K	K	A	V	A	E	H	F	R	I	D	D	D	G	S	P	L	F	C	V
Template Known Secondary structure						T	T							T	.	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G								B		T	T	T	S		T	T	T		T	T	S	S	S			B	T	T	B		T	T													T				S	S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.								.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	S	R	L	T	W	Q	K	G	I	D	L	M	A	E	A	V	D	E	I	V	S	L	G	G	R	.	.	.	.	.	.	L	V	V	L	G	A	G	D	V	A	L	E	G	A	L	L	A	A	A	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	H	G	R	V	G	V	A	I	G	Y
Template Known Secondary structure			S		B	S	T	T	T	T						T	T							T	T			.	.	.	.	.	.							B															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T						S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.							.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.													.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	F	A	G	A	A	N	E	L	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	I	V	N	P	Y	D	R	D	E
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.
Template Sequence		N	E	P	L	S	H	L	M	Q	A	G	C	D	A	I	I	I	P	S	R	F	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	A	L	R	Y	G	C	I	.	.	.	.	.	P	V	V	A	R	T	G	G	L	A	D	T	V	I	D	A	N	H	A	A	L	A	S	K	A	A	T	G	V	Q	F	S	P	V	T	L	D	G
Template Known Secondary structure														S							S			S	S		S									T			.	.	.	.	.					S	S									B								T	T				B				S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.						.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.			420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.
Query SS confidence													.	.
Query Sequence		V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	.	.	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L	K	Q	I	V	P
Query Conservation													.	.
Alig confidence													.	.															.	.
Template Conservation																													.	.
Template Sequence		L	K	Q	A	I	R	R	T	V	R	Y	Y	H	D	P	K	L	W	T	Q	M	Q	K	L	G	M	K	.	.	S	D	V	S	W	E	K	S	A	G	L	Y	A	A	L	Y	S	Q	L	I	S
Template Known Secondary structure														T														T	.	.				B																T
Template Predicted Secondary structure																													.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.			.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.