Job Description P31677 Confidence 98.94% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 43 Aligned Residues 376 % Identity 11% Template d1rrva_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Gtf glycosyltransferase Resolution 2.00

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.				30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.
Query Sequence		M	S	R	L	V	V	V	S	N	R	I	A	P	P	D	E	H	A	A	S	A	G	G	L	A	V	G	I	L	.	.	.	G	A	L	K	A	A	G	G	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	K	V	K	K	G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q	D	L	D	E	Y	Y
Query Conservation																															.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.															.	.	.	.	.	.																											.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.																											.	.
Template Sequence		M	R	V	L	L	S	V	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	R	G	D	V	E	I	G	V	A	L	A	D	R	L	K	A	L	G	V	Q	T	R	M	C	A	P	.	.	.	.	.	.	P	A	A	E	E	R	L	A	E	V	G	V	P	H	V	P	V	G	L	P	Q	H	M	M	L	Q	.	.
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																		T	T									.	.	.	.	.	.	G	G	G								T							S			G	G	G				.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.																											.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.											.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.							.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	Q	F	S	N	A	V	L	W	P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	M	P	P	P	P	P	E	E	E	Q	R	L	A	A	M	T	V	E	M	Q	F	D	A	V	P	G	A	A	E	G	C	A	A	V	V	A	V	G	D	L	A	A	A	T	G	V	R	S	V	A	E	K	L	G	L	P	F	F	Y	S	V	P	S	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S																											T	T	T		S																						T								S	S	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
															158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	L	A	S	P	H	L	P	P	A	Y	D	E	P	T	T	P	G	V	T	D	I	R	V	L	W	E	E	R	A	A	R	F	A	D	R	Y	G	P	T	L	N	R	R	R	A	E	I	G	L	P	P	V	E	D	V	F	G	Y	G	H	G	E	R	P	L	L	A	A	D	P	V	L	A	P	L	Q	P	D
Template Known Secondary structure		G	G	S			S	S	S				B		S				T	T																														T	T					S						T	T		S	S					S		T	T	T	S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K	Q	A	A	G	P	L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V
Query Conservation
Alig confidence																													.	.																																			.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	A	V	Q	T	G	A	W	L	L	S	D	E	R	P	L	P	P	E	L	E	A	F	L	A	A	.	.	G	S	P	P	V	H	I	G	F	G	S	S	S	G	R	G	I	A	D	A	A	K	V	A	V	E	A	I	R	A	Q	G	R	R	.	.	.	.	.	V	I	L	S	R	G	W	T	E	L	V	L
Template Known Secondary structure																												S	.	.	S	S								T	T			S																	T	T			.	.	.	.	.						T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.			.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.						270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	R	D	D	C	F	A	I	D	E	V	N	F	Q	A	L	.	.	.	F	R	R	V	A	A	V	I	.	.	.	.	H	H	G	S	A	G	T	E	H	V	A	T	R	A	G	V	P	.	.	.	.	.	Q	L
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T					S	S							.	.	.	G	G	G	S	S				.	.	.	.															T			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		282																								.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.				300	.	.	.	.	.	.	.					.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.						.	.
		385	.	.	.	.	390					.	.	.	.	.				.	.	.	.	400	.	.	.	.	.			.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.						.	.	.											.	.
Query SS confidence								.	.	.	.						.	.	.											.	.
Query Sequence		L	S	Q	F	A	G	.	.	.	.	A	A	N	E	L	.	.	.	T	S	A	L	I	V	N	P	Y	D	.	.	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L	K	Q
Query Conservation								.	.	.	.						.	.	.											.	.
Alig confidence								.	.	.	.						.	.	.											.	.														.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.
Template Sequence		V	I	P	R	N	T	D	Q	P	Y	F	A	G	R	V	A	A	L	G	I	G	V	A	H	D	G	P	T	P	T	F	E	S	L	S	A	A	L	T	T	V	L	A	.	.	.	P	E	T	R	A	R	A	E	A	V	A	G	M	V	L	T	D	G	A	A	A	A	A	D	L	V	L	A	A	V	G	R
Template Known Secondary structure						S	B	T												T	S					S	S	S															T	S	.	.	.											T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.				370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.