Job Description P31677 Confidence 99.13% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 42 Aligned Residues 367 % Identity 12% Template d1pn3a_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Gtf glycosyltransferase Resolution 2.80

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.				30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.
Query Sequence		M	S	R	L	V	V	V	S	N	R	I	A	P	P	D	E	H	A	A	S	A	G	G	L	A	V	G	I	L	.	.	.	G	A	L	K	A	A	G	G	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	K	V	K	K	G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q	D	L	D	E	Y	Y
Query Conservation																															.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.															.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Sequence		M	R	V	L	I	T	G	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	R	G	D	T	E	P	L	V	A	L	A	A	R	L	R	E	L	G	A	D	A	R	M	C	L	P	.	.	.	.	.	.	P	D	Y	V	E	R	C	A	E	V	G	V	P	M	V	P	V	G	R	A	V	R	A	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																	T	T									.	.	.	.	.	.	G	G	G								T							S	S		S	S	G	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.											.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.							.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	Q	F	S	N	A	V	L	W	P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	R	E	P	G	E	L	P	P	G	A	A	E	V	V	T	E	V	V	A	E	W	F	D	K	V	P	A	A	I	E	G	C	D	A	V	V	T	T	G	L	L	P	A	A	V	A	V	R	S	M	A	E	K	L	G	I	P	Y	R	Y	T	V	L	S	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S		T	T				T	T		G	G	G																	T	T		S																						T								S	S	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.						.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.
Query Sequence		F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	.	.	.	.	.	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E
Query Conservation																																											.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	H	L	P	S	E	Q	S	Q	A	E	R	D	M	Y	N	Q	G	A	D	R	L	F	.	.	.	.	.	.	.	G	D	A	V	N	S	H	R	A	S	I	G	L	P	P	V	E	H	L	Y	D	Y	G	Y	T	D	Q	P	W	L	A	A	D	P	V	L	S	P	L	R	P	T	D	L	G	T	V	Q	T	G
Template Known Secondary structure		G	G	S	G	G	G	S																T	.	.	.	.	.	.	.										T	T	S														S	S					S		T	T	T	S				T	T			S			B
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.								150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	K	Q	A	A	G	P	L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	W	I	L	P	D	E	R	P	L	S	A	E	L	E	A	F	L	A	A	G	S	T	P	V	Y	V	G	F	G	S	S	S	R	P	A	T	A	D	A	A	K	M	A	I	K	A	V	R	A	S	.	.	.	.	.	.	G	R	R	I	V	L	S	R	G	W	A	D	L	V	L	P	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																			T	T	S	S	S								T	T			S	T																T	.	.	.	.	.	.	T								T	T	T	T				S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250							.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		Q	L	E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	F	A	G	A	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.	.	.	.																		.	.	.	.	.										.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	G	A	D	C	F	V	V	G	E	V	N	L	Q	E	L	.	.	.	F	G	R	V	A	A	A	I	.	.	.	.	H	H	D	S	A	G	T	T	L	L	A	M	R	A	G	I	P	.	.	.	.	.	Q	I	V	V	R	R	V	V	D	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			T	T					S	S							.	.	.		T	T	S	S				.	.	.	.			S												T			.	.	.	.	.						S	S			B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.									.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.				.	.	.	.	.	.	290	.					.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.						.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
												392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.			.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	E	L	T	S	A	L	I	V	N	P	Y	D	.	.	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.
Template Sequence		V	V	E	Q	A	Y	H	A	D	R	V	A	E	L	G	V	G	V	A	V	D	G	P	V	P	T	I	D	S	L	S	A	A	L	D	T	A	L	A	P	E	.	.	.	I	R	A	R	A	T	T	V	A	D	T	I	R	A	D	G	T	T	V	A	A	Q	L	L	F	D	A	V	S
Template Known Secondary structure		T	T	B												T	S							S	S														T	S	T	T	.	.	.									G	G	G	S		S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.				360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.