Job Description P31677 Confidence 99.84% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 335 % Identity 15% Template d1f0ka_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Peptidoglycan biosynthesis glycosyltransferase MurG Resolution 1.90

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.				.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.		.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.												.
Query SS confidence																											.	.	.												.
Query Sequence		S	R	L	V	V	V	S	N	R	I	A	P	P	D	E	H	A	A	S	A	G	G	L	A	V	.	.	.	G	I	L	G	A	L	K	A	A	G	G	.	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	K	V	K	K	G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q	D	L	D	E	Y	Y
Query Conservation																											.	.	.												.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.												.				.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Sequence		K	R	L	M	V	M	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T	G	G	H	V	F	P	G	L	A	V	A	H	H	L	M	A	Q	G	W	Q	V	R	W	.	.	.	.	L	G	T	A	D	R	M	E	A	D	L	V	P	K	H	G	I	E	I	D	F	I	R	I	S	G	L	R	G	K	G	I	K
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S																T	T	T						.	.	.	.				T	T	S	T					G	G	G	G	T												T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.											.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.					40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	Q	F	S	N	A	V	L	W	P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																								.
Template Sequence		A	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	P	L	R	I	F	N	A	W	R	Q	A	R	A	I	M	K	A	Y	.	.	.	.	.	.	K	P	D	V	V	L	G	M	G	G	Y	V	S	G	P	G	G	L	A	A	W	S	L	.	G	I	P	V	V	L	H	E	Q	N	G
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																				.	.	.	.	.	.			S						S	S	T	T											T	.	T									S	S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		73	.	.																	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.							.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.		.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K	Q	A
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Template Sequence		I	A	G	L	T	N	K	W	L	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	T	K	V	M	Q	A	F	P	G	A	F	P	N	A	E	V	V	G	N	P	V	R	T	D	V	L	A	L	.	.
Template Known Secondary structure		S									T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S					S	S	T	T	S	S	S	S														T	S	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	P	L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E	N	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	P	L	P	Q	Q	R	L	A	G	R	E	G	P	V	R	V	L	V	V	G	G	S	Q	G	A	R	I	L	N	Q	T	M	P	Q	V	A	A	K	L	G	D	.	.	.	.	.	.	S	V	T	I	W	H	Q	S	G	K	G	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.								T	T			S	S								T	T	T																	G	G	.	.	.	.	.	.	G									T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.							.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	F	A	G	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																										.	.	.												.	.	.	.																	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																										.	.	.												.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	Q	S	V	E	Q	A	Y	A	E	A	G	Q	P	Q	H	K	V	T	E	F	I	D	D	M	A	.	.	.	A	A	Y	A	W	A	D	V	V	V	C	.	.	.	.	R	S	G	A	L	T	V	S	E	I	A	A	A	G	L	P	.	.	.	.	.	A	L	F	V	P	F	Q	H	K	D	R	Q	Q	Y	W
Template Known Secondary structure		.										T	T		T	T	S				S			S				.	.	.							S					.	.	.	.														T			.	.	.	.	.									T	T
Template Predicted Secondary structure		.																										.	.	.												.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.				250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260					.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.						.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
					391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.			.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																.	.
Query SS confidence		.	.	.																.	.
Query Sequence		.	.	.	A	A	N	E	L	T	S	A	L	I	V	N	P	Y	D	.	.	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L	K	Q	I
Query Conservation		.	.	.																.	.
Alig confidence		.	.	.																.	.												.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.
Template Sequence		N	A	L	P	L	E	K	A	G	A	A	K	I	I	E	Q	P	Q	L	S	V	D	A	V	A	N	T	L	A	G	W	.	.	.	S	R	E	T	L	L	T	M	A	E	R	A	R	A	A	S	I	P	D	A	T	E	R	V	A	N	E	V	S	R	V	A	R	A	L
Template Known Secondary structure									T	T	S						G	G	G												T		.	.	.															T			T	T														T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.
Template SS confidence
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.				.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.