Job Description P31677 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 362 % Identity 13% Template c3dzcA_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:udp-n-acetylglucosamine 2-epimerase; PDBTitle: 2.35 angstrom resolution structure of wecb (vc0917), a udp-n-2 acetylglucosamine 2-epimerase from vibrio cholerae. Resolution 2.35 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	R	L	V	V	V	S	N	R	I	A	P	P	D	E	H	A	A	S	A	G	G	L	A	V	G	I	L	G	A	L	K	A	A	G	G	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	K	V	K	K	G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q	D	L	D	E	Y	Y	N	Q	F
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	K	V	L	I	V	F	G	T	R	P	E	A	.	.	.	.	.	.	.	I	K	M	A	P	L	V	Q	Q	L	C	Q	D	N	R	F	V	A	K	V	C	V	T	G	Q	H	R	E	M	L	D	Q	V	L	E	L	F	S	I	T	P	D	F	D	L	N	I	M	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											S					.	.	.	.	.	.	.														T	T										S	S	S										T	T				S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.								.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	N	A	V	L	W	P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P	F	P	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																																			.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																																			.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	Q	T	L	N	G	V	T	S	K	I	L	L	G	M	Q	Q	V	L	S	S	E	.	.	Q	P	D	V	V	L	V	H	G	D	T	A	T	T	F	A	A	S	L	A	A	Y	Y	Q	Q	I	P	V	G	H	V	E	A	G	.	L	R	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																						.	.			S						T	T	S												T	T	T							T			.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																																			.
Template SS confidence
																			64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.			.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120		.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K	Q	A	A	G	P
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	I	Y	S	P	W	P	E	E	G	N	R	K	L	T	A	A	L	T	Q	Y	H	F	A	P	T	D	T	S	R	A	N	L	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	Y	N	A	E	N	I	F	V	T	G	N	T	V	I	D	A	L	L	A	V	R	E	K	I	H	T
Template Known Secondary structure		S		T	T	S	S	T	T											T		S					S	S										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.							.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	.	.	.	.	.	.	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L
Query Conservation														.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	M	D	L	Q	A	T	L	E	S	Q	F	P	M	L	D	A	S	K	K	L	I	L	V	T	G	H	R	R	E	S	F	G	G	G	F	E	R	I	C	Q	A	L	I	T	T	A	E	Q	H	P	E	C	Q	.	.	.	.	I	L	Y	P	V	H	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T		T	T			T	T	S								S		B				T	T																	T	T			.	.	.	.							B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.					.	.	.	.	.	.	.	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	F	A	G	A	A	N	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																																								.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																								.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	P	N	V	R	E	P	V	N	K	L	L	K	G	V	S	N	I	V	L	I	E	P	Q	Q	Y	L	P	F	V	Y	L	M	D	R	A	H	I	I	L	.	.	.	.	.	T	D	S	G	G	I	Q	E	E	A	P	S	L	G	K	P	.	.	.	.	.	V	L	V	M	R	E	T	T	E	R	P	E
Template Known Secondary structure		.	.	.											T	T	T		T	T																				S				.	.	.	.	.		S		S	G	G	G	T	T	G	G	G	G	T			.	.	.	.	.						S	S		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																								.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.						.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.						.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
		395				.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.
Query SS confidence			.	.	.
Query Sequence		L	.	.	.	T	S	A	L	I	V	N	P	Y	D	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I
Query Conservation			.	.	.
Alig confidence			.	.	.									.															.
Template Conservation														.															.
Template Sequence		A	V	A	A	G	T	V	K	L	V	G	T	.	N	Q	Q	Q	I	C	D	A	L	S	L	L	L	T	.	D	P	Q	A	Y	Q	A	M	S	Q	A	H	N	P	Y	G	D	G	K	A	C	Q	R	I	A	D	I	L	A
Template Known Secondary structure						T	S					T	T	.															.										T	S			T	T			S
Template Predicted Secondary structure														.															.
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.		.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.		.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.