Job Description P31677 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 348 % Identity 15% Template c2jjmH_ PDB info PDB header:transferase Chain: H: PDB Molecule:glycosyl transferase, group 1 family protein; PDBTitle: crystal structure of a family gt4 glycosyltransferase from2 bacillus anthracis orf ba1558. Resolution 3.10 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.					.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.
Query Sequence		M	S	R	L	V	V	V	S	N	R	I	A	P	P	D	E	H	A	A	S	A	G	G	L	A	V	G	I	L	G	A	L	K	A	A	.	.	.	.	G	G	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	K	V	K	K	G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q	D	L	D	E	Y
Query Conservation																																					.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	I	G	I	T	C	.	.	.	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	G	V	V	G	T	E	L	G	K	Q	L	A	E	R	G	H	E	I	H	F	I	T	S	G	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	Y	P	N	I	Y	F	H	E	V	T	V	N	F	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T								S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T											.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.				10	.										.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40										.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	N	Q	F	S	N	A	V	L	W	P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Y	P	P	Y	D	L	A	L	A	S	K	M	A	E	V	A	Q	R	E	.	.	.	.	.	.	N	L	D	I	L	H	V	H	Y	A	I	P	H	A	I	C	A	Y	L	A	K	Q	M	I	G	E	R	I	K	I	V	T	T	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S																			.	.	.	.	.	.	T		S						S	S	T	T												T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																						66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.							.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.		.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		P	F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	.	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	G	T	D	I	T	V	L	G	S	D	P	S	L	N	N	L	I	R	F	G	I	E	Q	S	D	V	V	T	A	V	S	H	S	L	I	N	E	T	H	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	K	P	N	K	D	I	Q	T	V	Y	N	F	I	D	E	R	V	Y	F	K
Template Known Secondary structure								T	T	T	T		T	T	T											S	S					S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T			S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	A	G	P	L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	D	M	T	Q	L	K	.	.	.	.	.	.	.	K	E	Y	G	I	S	K	I	L	I	H	I	S	N	F	R	K	V	K	R	V	Q	D	V	V	Q	A	F	A	K	I	V	T	E	.	.	.	.	.	V	D	A	K	L	L	L	V	G	D	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.			T	T													G	G	G	T														S	.	.	.	.	.	S											T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.								190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.						.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	F	A	G	A	A	N	E	L
Query Conservation
Alig confidence		.																							.	.																																						.	.	.	.	.
Template Conservation		.																							.	.																																						.	.	.	.	.
Template Sequence		.	E	F	C	T	I	L	Q	L	V	K	N	L	H	I	E	D	R	V	L	F	L	G	.	.	K	Q	D	N	V	A	E	L	L	A	M	S	D	L	M	L	L	L	S	E	K	E	S	F	G	L	V	L	L	E	A	M	A	C	G	V	P	.	.	.	.	.	C	I	G	T	R	V	G	G	I	P	E	V	I
Template Known Secondary structure		.	T										T	T	T		G	G	G	B				B	.	.	S		S		T						T		S							S			S											T	T			.	.	.	.	.							T	T	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.																							.	.																																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
			239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260			.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.						.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		396	.				.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.																																							.
Query SS confidence				.	.	.																																							.
Query Sequence		T	S	.	.	.	A	L	I	V	N	P	Y	D	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	.	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L	K	Q	I
Query Conservation				.	.	.																																							.
Alig confidence				.	.	.																						.																	.
Template Conservation																												.
Template Sequence		Q	H	G	D	T	G	Y	L	C	E	V	G	D	T	T	G	V	A	D	Q	A	I	Q	L	L	K	.	D	E	E	L	H	R	N	M	G	E	R	A	R	E	S	V	Y	E	Q	F	R	S	E	K	I	V	S	Q	Y	E	T	I	Y	Y	D	V
Template Known Secondary structure			B	T	T	T						T	T															.																				S																T
Template Predicted Secondary structure																												.
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.