Job Description P31677 Confidence 99.94% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 313 % Identity 14% Template c2iv3B_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:glycosyltransferase; PDBTitle: crystal structure of avigt4, a glycosyltransferase involved2 in avilamycin a biosynthesis Resolution 2.3 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10									.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.		.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Query Sequence		M	S	R	L	V	V	V	S	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	P	P	D	E	H	A	A	S	A	G	G	L	A	V	G	I	L	G	A	L	K	A	A	G	G	.	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	K	V	K	K	G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.																												.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template Sequence		L	K	V	A	L	V	N	I	P	L	R	V	P	G	S	D	A	W	I	S	V	P	P	Q	G	Y	G	G	I	Q	W	V	V	A	N	L	M	D	G	L	L	E	L	G	H	E	V	F	L	L	G	A	P	S	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	G	L	T	V	V	P	A	G	E	.	.	.
Template Known Secondary structure												B		T	T	S	S	S	B			S	S		S	S	S																	T	T							S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T					S			S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.											70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	D	E	Y	Y	N	Q	F	S	N	A	V	L	W	P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	N	R	I	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.															.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.															.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	E	I	E	R	W	L	R	T	A	D	V	.	D	V	V	H	D	H	S	G	G	V	I	G	P	A	.	.	.	.	G	L	P	P	G	T	A	F	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	S						S	S	S	S	S		S	T	.	.	.	.	T			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.															.	.	.	.
Template SS confidence
																																									83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.		.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.					110	.	.	.	.	.	.	.	.
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	F	L	H	I	P	F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	S	H	H	F	T	T	R	P	V	N	P	V	G	C	T	Y	S	S	R	A	Q	R	A	H	C	G	G	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	P	V	I	P	I	P	V	D	P	A
Template Known Secondary structure						S	S	S			S			T	T				S									T			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S		B					B		G	G
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	I	A	K	Q	A	A	G	P	L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Sequence		R	Y	R	S	A	A	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	K	E	D	F	L	L	F	M	G	R	V	S	P	H	K	G	A	L	E	A	A	A	F	A	H	A	C	G	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	L	A	G	P	A	.	.	W	E	P	E	Y	F	D	E	I	T
Template Known Secondary structure		G	S			G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S						S			S	G	G	G	T											T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.					S			.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.													.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200										.	.	.	.	.	.	.			.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.							.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	Q	L	E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	.	.	.	.	.	.	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		R	R	Y	G	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	P	I	G	E	V	G	G	E	R	R	L	D	L	L	A	S	A	H	A	V	L	A	M	S	Q	A	V	T	G	I	W	C	E	P	G	A	T	V	V	S	E	A	A	V	S	G	T	P	.	.	.	.	.	V	V	G
Template Known Secondary structure					T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S														S																	S										T	T			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.						.	.	.
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.		.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.																																							.
Query SS confidence														.																																							.
Query Sequence		S	Q	F	A	G	A	A	N	E	L	T	S	.	A	L	I	V	N	P	Y	D	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	.	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L	K	Q	I	V	P	R	S
Query Conservation														.																																							.
Alig confidence														.																								.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	N	G	C	L	A	E	I	V	P	S	V	G	E	V	V	G	Y	G	T	D	F	A	P	D	E	A	R	R	T	L	A	G	L	P	.	.	.	.	.	.	A	S	D	E	V	R	R	A	A	V	R	L	W	G	H	V	T	I	A	E	R	Y	V	E	Q	Y	R	R	L	L	A	G	A
Template Known Secondary structure				S	T	T					G	G	G	T						S	S	S													T	S		.	.	.	.	.	.														B																		T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.							.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.