Job Description P31677 Confidence 98.67% Date Thu Jan 5 11:48:33 GMT 2012 Rank 44 Aligned Residues 306 % Identity 14% Template c2c4mA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycogen phosphorylase; PDBTitle: starch phosphorylase: structural studies explain oxyanion-2 dependent kinetic stability and regulatory control. Resolution 1.9 Å

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		126	.	.	.	130	.	.	.		.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.														.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.								.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	W	I	H	D	Y	H	.	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P	.	.	.	.	.	.	.	F	P	T	P	E	I	F	N	A	L	P	T	Y	D	T	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	V	Q	L	N	D	T	H	P	V	L	A	I	P	E	L	M	R	L	L	M	D	E	H	D	M	G	W	E	E	S	W	A	I	V	S	K	T	F	A	Y	T	N	H	T	V	L	T	E	A	L	E	Q	W	D	E	Q	I	F	Q	Q	L	F	W	R	V	W	E	I	I	A	E	I	D	R	R	F	R	L	E
Template Known Secondary structure							S	S	T	T	T	T													S																						S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
																												175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	A	A	D	G	L	D	E	E	T	I	N	R	M	A	P	I	Q	H	G	T	V	H	M	A	W	I	A	C	Y	A	A	Y	S	I	N	G	V	A	A	L	H	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	I	K	A	E	T	L	A	D	W	Y	A	L	W	P	E	K	F	N	N	K	T	N	G	V
Template Known Secondary structure					T	T											S			T	T													S					S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T								G	G	G								B
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.												.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	P	K	E	I	A	K	Q	A	A	G	P	L	P	P	K	L	A	Q	L	K	A	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	V	Q	N	I	F
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	R	R	W	L	R	M	I	N	P	G	L	S	D	L	L	T	R	L	S	G	S	D	D	W	V	T	D	L	D	E	L	K	K	L	R	S	Y	A	D	D	K	S	V	L	E	E	L	R	A	I	K	A	A	N	K	Q	D	F	A	E	W	I	L	E	R	Q	G	I	E	I	D	P	E	S	I	F	D	V
Template Known Secondary structure			T						T	T													S	S	S	G	G	G	G		G	G	G	G	G	G	G	G	G	G	G	G																																	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.		.	.	.	.	.	.	.	280			.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.			.	.
Predicted Secondary structure															.									.	.																																																					.	.
Query SS confidence															.									.	.																																																					.	.
Query Sequence		S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	.	R	F	L	A	Y	E	A	L	.	.	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G	Q	L	G	W	T	P	.	.	L	Y
Query Conservation															.									.	.																																																					.	.
Alig confidence															.									.	.																																													.	.	.						.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.
Template Sequence		Q	I	K	R	L	H	E	Y	K	R	Q	L	M	N	A	L	Y	V	L	D	L	Y	F	R	I	K	E	D	G	L	T	D	I	P	A	R	T	V	I	F	G	A	K	A	A	P	G	Y	V	R	A	K	A	I	I	K	L	I	N	S	I	A	D	L	V	N	N	D	.	.	.	P	E	V	S	P	L	L	K	V
Template Known Secondary structure								G	G	G	T																	T	S				S	S													T	T																				T		.	.	.	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.
Template SS confidence
		520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.				.	.	590	.	.	.	.	.	.
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360			.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.							.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure																												.	.																																				.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.																																				.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	.	.	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	F	A	G	A	A	N	E	L	.	.	.	.	.	.	T	S	A	L	I	V	.	.	.	.	.
Query Conservation																												.	.																																				.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.																	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	F	V	E	N	Y	N	V	S	P	A	E	H	I	L	P	A	S	D	V	S	E	Q	I	S	T	A	G	K	E	A	S	G	T	S	N	M	K	F	M	M	N	G	A	.	.	.	.	.	.	L	T	L	G	T	M	D	G	A	N	V	E	I	V	D	S	V	G	E	E	N	A	Y	I	F	G	A	R	V	E
Template Known Secondary structure					T	T										G	G	G		S								T	T	S		S											T	T		.	.	.	.	.	.						S	S	T											G	G	G	S				S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640							.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
																																			402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	Y	D	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	L	P	A	L	R	E	S	Y	K	P	Y	E	L	Y	E	T	V	P	G	L	K	R	A	L	D	A	L	D	N	G	T	L	N	D	N	N	S	G	L	F	Y	D	L	K	H	S	L	I	H	G	Y	G	K	D	A	S	D	T	Y	Y	V	L	G	D	F	A	D	Y	R	E	T	R	D	R	M	A	A	D	Y
Template Known Secondary structure		T							T										S	T	T							T	T	T	S	S	S	S			T	T													S			G	G	G		S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		671	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750
				420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	S	D	P	L	G	W	A	R	M	A	W	I	N	I	C	E	S	G	R	F	S	S	D	R	T	I	R	D	Y	A	T	E	I
Template Known Secondary structure																			G	G	G	G	B												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		751	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.