Job Description P77538 Confidence 98.68% Date Thu Jan 5 12:30:21 GMT 2012 Rank 231 Aligned Residues 224 % Identity 21% Template d1wpxa1 SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Serine carboxypeptidase-like Resolution 2.70

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		53	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	F	T	A	K	D	.	G	T	R	L	Q	G	W	F	I	P	S	S	T	G	P	A	D	N	A	I	A	T	I	I	H	A	H	G	N	A	G	N	M	S	A	H	W	P	L	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	L	P	E	R	N	F	N	V	F	M	F	D	Y	R
Query Conservation								.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.														.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Template Conservation																						.	.																																																	.
Template Sequence		Y	L	D	V	E	D	E	D	K	H	F	F	F	W	T	F	E	S	R	N	.	.	D	P	A	K	D	P	V	I	L	W	L	N	G	G	P	G	C	S	S	L	T	G	L	F	F	E	L	G	P	S	S	I	G	P	D	L	K	P	I	G	N	P	Y	S	W	N	S	N	.	A	T	V	I	F	L	D	Q	P
Template Known Secondary structure						T	T	S												S	S	.	.		T	T	T	S									T	T	T	B		T							T	T	S	S					T	T	S						T	T		G	G	G	S	.	S								S
Template Predicted Secondary structure																						.	.																																																	.
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.			40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.		.	.	90	.	.	.	.	.	.
			115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.								.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.						170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure		.																																.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																																.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query Sequence		.	G	F	G	K	S	K	G	T	P	S	Q	A	G	L	L	D	D	T	Q	S	A	I	N	V	V	R	H	R	S	D	V	.	.	.	.	.	.	.	N	P	Q	R	L	V	L	F	G	Q	S	I	G	G	A	N	I	L	D	V	I	G	R	G	.	.	.	.	.	D	R	E	G	I	R	A	V	I	L	D	S
Query Conservation		.																																.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	V	G	F	S	Y	S	G	S	S	G	V	S	N	T	V	A	A	G	K	D	V	Y	N	F	L	E	L	F	F	D	Q	F	P	E	Y	V	N	K	G	Q	D	F	H	I	A	G	E	S	Y	A	G	H	Y	I	P	V	F	A	S	E	I	L	S	H	K	D	R	N	F	N	L	T	S	V	L	I	G	N
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T		B		S	S					S																				T					T										T	T																S	S		S	S									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	F	A	S	Y	A	T	I	A	N	Q	M	I	P	G	S	G	Y	L	L	D	E	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	T	D	P	L	T	Q	Y	N	Y	Y	E	P	M	A	C	G	E	G	G	E	P	S	V	L	P	S	E	E	C	S	A	M	E	D	S	L	E	R	C	L	G	L	I	E	S	C	Y	D	S	Q	S	V	W	S	C	V	P	A	T	I	Y	C	N	N	A	Q	L	A	P	Y	Q	R	T	G	R	N	V	Y
Template Known Secondary structure										G	G	G						T	T		S	S	S				S																																											T						T	T	B		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
																																																														206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	E	N	Y	I	A	S	V	S	P	I	P	L	L	L	I	H	G	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	R	K	D	C	E	G	G	N	L	C	Y	P	T	L	Q	D	I	D	D	Y	L	N	Q	D	Y	V	K	E	A	V	G	A	E	V	D	H	Y	E	S	C	N	F	D	I	N	R	N	F	L	F	A	G	D	W	M	K	P	Y	H	T	A	V	T	D	L	L	N	Q	D	L	P	I	L	V	Y	A	G	D
Template Known Secondary structure			T	T	S	B			S	S	T	T	S		T	T									T	S								T			S	S	S			S	B										T	T	T		T	T			T	T									T	T									T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	D	H	V	I	P	W	Q	H	S	E	K	L	Y	S	L	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	K	R	L	I	L	I	P	D	G	E	H	I	D	A	F	S	D	R	H	G	D	V	Y	R	E	Q	M	V	D	F
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation																																																															.	.
Template Sequence		K	D	F	I	C	N	W	L	G	N	K	A	W	T	D	V	L	P	W	K	Y	D	E	E	F	A	S	Q	K	V	R	N	W	T	A	S	I	T	D	E	V	A	G	E	V	K	S	Y	K	H	F	T	Y	L	R	V	F	N	G	G	H	.	.	M	V	P	F	D	V	P	E	N	A	L	S	M	V	N	E	W
Template Known Secondary structure		T		S	T	T														S	T	T							S								T	T	T		S									T	T							T	T			S	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.			.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		276	.	.	.	280	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	S	A	L	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	H	G	G	F	S
Template Known Secondary structure			T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		415	.	.	.	.	420

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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