Job Description P34211 Confidence 98.12% Date Thu Jan 5 11:53:05 GMT 2012 Rank 170 Aligned Residues 179 % Identity 22% Template d1jfra_ SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Lipase Resolution 1.90

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		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.		.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure																																												.
Query SS confidence																																												.
Query Sequence		M	T	K	L	P	A	K	S	K	R	K	G	S	V	I	I	I	S	G	G	P	G	L	P	G	I	N	P	Y	I	N	F	D	W	P	V	T	N	L	R	E	S	.	W	D	I	I	G	F	D	P	R	G	V	G	Q	S	F	P	A	I	N	C	Q	Q	S	N	Q	E	R	L	V	N	V	S	E	K	Q	L	I
Query Conservation																																												.
Alig confidence																												.	.	.	.	.												.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	Y	P	T	S	T	A	D	G	T	F	G	A	V	V	I	S	P	G	F	T	A	Y	Q	S	S	.	.	.	.	.	I	A	W	L	G	P	R	L	A	S	Q	G	F	V	V	F	T	I	D	T	N	T	T	L	D	Q	P	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S			T	T												T	T			G	G	G	.	.	.	.	.	T	T	T							T	T	T									S	S	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.						70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	K	I	N	A	C	I	H	N	T	G	A	E	V	I	R	H	I	G	S	H	E	A	V	Y	D	I	E	R	I	R	Q	A	L	G	D	K	Q	L	T	A	V	A	Y	S	Y	G	T	Q	I	A	A	L	Y	A	E	R	F	P	S	S	I	R	S	I	V	F	D	G	V	V	D	I	D	D	L	N	D	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	R	Q	L	L	S	A	L	D	Y	L	T	Q	R	S	S	V	R	T	R	V	D	A	T	R	L	G	V	M	G	H	S	M	G	G	G	G	S	L	E	A	A	K	S	R	T	S	L	K	A	A	I	P	L	T	G	W	N	T	D	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	S	T	T	G	G	G												T														T	T		S						S				S		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	S	W	K	L	R	Q	A	H	S	Y	Q	E	T	F	D	R	F	A	A	W	C	A	R	T	K	S	C	P	L	S	S	D	R	N	Q	A	I	H	Q	F	H	Q	L	L	L	K	L	H	N	S	P	L	T	D	S	R	G	E	S	I	S	S	D	D	L	I	S	L	T	T	E	L	L	L	W	R	S	S	W
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	T	L	A	T	A	V	R	Q	F	S	Q	G	I	V	S	N	E	I	E	T	A	L	N	S	S	I	A	S	E	K	V	S	D	A	L	G	V	I	L	C	V	D	Q	S	D	E	Q	L	S	Q	E	Q	R	K	S	R	K	K	A	L	A	D	A	F	P	A	V	N	F	E	R	E	Q	S	D	L	P	E	F
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450					.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.												.	.	.	.
Query SS confidence																																								.												.	.	.	.
Query Sequence		C	E	L	W	P	I	H	R	D	L	Q	Q	T	R	L	K	N	T	V	L	P	S	G	L	L	F	V	A	H	K	Y	D	P	T	T	P	W	I	.	N	A	R	K	M	A	D	K	F	S	A	.	.	.	.	P	L	L	T	I	N	G	D	G	H	T	L	A	L	A	G	T	N	L	C	V	D	E	A	V	V
Query Conservation																																								.												.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.												.	.	.	.												.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	W	P	E	L	R	T	P	T	L	V	V	G	A	D	G	D	T	V	A	P	V	A	T	H	S	K	P	F	Y	E	S	L	P	G	S	L	D	K	A	Y	L	E	L	R	G	A	S	H	F	.	T	P	N	T	S	D	T	T	I	A	K	Y	S	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T			S								T	T		S	S	S		T	T	T	T								S		T	T	S								T	T			T	T	.	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.
Template SS confidence
																160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210		.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		477	.	.	480
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	H	L	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	W	L	K
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		225	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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