Job Description P24555 Confidence 96.72% Date Thu Jan 5 11:41:42 GMT 2012 Rank 310 Aligned Residues 237 % Identity 17% Template d1wpxa1 SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Serine carboxypeptidase-like Resolution 2.70

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		420	.	.	.	.	.		.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.																					.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	I	V	A	R	D	.	G	V	E	V	P	V	S	L	V	Y	H	R	K	H	F	R	K	G	H	N	P	L	L	V	Y	G	Y	G	S	Y	G	A	S	I	D	A	D	F	S	F	S	R	L	S	L	L	D	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	V	Y	A
Query Conservation								.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.														.	.																					.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	D	V	E	D	E	D	K	H	F	F	F	W	T	F	E	S	R	N	.	.	D	P	A	K	D	P	V	I	L	W	L	N	G	G	P	G	C	S	S	L	.	.	.	.	.	.	T	G	L	F	F	E	L	G	P	S	S	I	G	P	D	L	K	P	I	G	N	P	Y	S	W	N	S	N	A	T	V	I
Template Known Secondary structure						T	T	S												S	S	.	.		T	T	T	S									T	T	T	B		T		.	.	.	.	.	.						T	T	S	S					T	T	S						T	T		G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.			40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.							60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.		.	.	.	.	.	.	520	.			.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.					.	.	.	.	540	.	.	.	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.									.	.															.	.	.	.										.	.
Query SS confidence																																					.									.	.															.	.	.	.										.	.
Query Sequence		I	V	H	V	R	G	G	G	E	L	G	Q	Q	W	Y	E	D	G	K	F	L	K	K	K	N	T	F	N	D	Y	L	D	A	C	D	.	A	L	L	K	L	G	Y	G	.	.	S	P	S	L	C	Y	A	M	G	G	S	A	G	G	.	.	.	.	M	L	M	G	V	A	I	N	Q	.	.	R	P	E	L	F
Query Conservation																																					.									.	.															.	.	.	.										.	.
Alig confidence														.	.																						.									.	.															.	.	.	.										.	.
Template Conservation														.	.
Template Sequence		F	L	D	Q	P	V	N	V	G	F	S	Y	.	.	S	G	S	S	G	V	S	N	T	V	A	A	G	K	D	V	Y	N	F	L	E	L	F	F	D	Q	F	P	E	Y	V	N	K	G	Q	D	F	H	I	A	G	E	S	Y	A	G	H	Y	I	P	V	F	A	S	E	I	L	S	H	K	D	R	N	F	N	L
Template Known Secondary structure						S	T	T	S	T	T		B	.	.		S	S					S																				T					T										T	T																S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.			.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	G	V	I	A	Q	V	P	F	V	D	V	V	T	T	M	L	D	E	S	I	P	L	T	T	G	E	F	E	E	W	G	N	P	Q	D	P	Q	Y	Y	E	Y	M	K	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.
Template Sequence		T	S	V	L	I	G	N	G	L	T	D	P	L	T	Q	Y	.	.	N	Y	Y	E	P	M	A	C	G	E	G	G	E	P	S	V	L	P	S	E	E	C	S	A	M	E	D	S	L	E	R	C	L	G	L	I	E	S	C	Y	D	S	Q	S	V	W	S	C	V	P	A	T	I	Y	C	N	N	A	Q	L	A	P
Template Known Secondary structure								S									G	.	.	G	G						T	T		S	S	S				S																																											T
Template Predicted Secondary structure																		.	.
Template SS confidence
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.			.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
																																																																								596	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	Y	D	N	V	T	A	Q	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Q	R	T	G	R	N	V	Y	D	I	R	K	D	C	E	G	G	N	L	C	Y	P	T	L	Q	D	I	D	D	Y	L	N	Q	D	Y	V	K	E	A	V	G	A	E	V	D	H	Y	E	S	C	N	F	D	I	N	R	N	F	L	F	A	G	D	W	M	K	P	Y	H	T	A	V	T	D	L	L	N	Q	D
Template Known Secondary structure					T	T	B		S	S		T	T	S	B			S	S	T	T	S		T	T									T	S								T			S	S	S			S	B										T	T	T		T	T			T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.																.	.	.	.	.	.	640	.	.										.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	P	H	L	L	V	T	T	G	L	H	D	S	Q	V	Q	Y	W	E	P	A	K	W	V	A	K	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	K	T	D	D	H	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	C	T	D	M	D	S	G	H	G	G	K	S	G	R	F	K	S
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.
Template Sequence		L	P	.	I	L	V	Y	A	G	D	K	D	F	I	C	N	W	L	G	N	K	A	W	T	D	V	L	P	W	K	Y	D	E	E	F	A	S	Q	K	V	R	N	W	T	A	S	I	T	D	E	V	A	G	E	V	K	S	Y	K	H	F	T	Y	L	R	V	F	N	G	G	H	M	V	P	F	D	V	P	E	N
Template Known Secondary structure				.							T	T		S	T	T														S	T	T							S								T	T	T		S									T	T							T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure				.
Template SS confidence
		328	.		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		662	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	E	G	V	A	M	E	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	L	S	M	V	N	E	W
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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