Job Description P24555 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:41:42 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 397 % Identity 19% Template d1qfma1 SCOP info 7-bladed beta-propeller Peptidase/esterase 'gauge' domain Prolyl oligopeptidase, N-terminal domain Resolution 1.40

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		2	.	.	.	.	.	.	.		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		L	P	K	A	A	R	I	P	.	H	A	M	T	L	H	G	D	T	R	I	D	N	Y	Y	W	L	R	D	D	T	R	S	Q	P	E	V	L	D	Y	L	Q	Q	E	N	S	Y	G	H	R	V	M	A	S	Q	Q	A	L	Q	D	R	I	L	K	E	I	I	D	R	I	P	Q	R	E	V	S	A	P	Y	I	K
Query Conservation										.
Alig confidence										.											.									.	.																								.	.
Template Conservation																					.									.	.																								.	.
Template Sequence		Y	P	D	V	Y	R	D	E	T	A	I	Q	D	Y	H	G	H	K	V	.	D	P	Y	A	W	L	E	D	.	.	P	D	S	E	Q	T	K	A	F	V	E	A	Q	N	K	I	T	V	P	F	L	E	Q	.	.	P	I	R	G	L	Y	K	E	R	M	T	E	L	Y	D	Y	P	K	Y	S	C	H	F	K	K
Template Known Secondary structure									T	T						T	T				.		T	T	G	G	G	G		.	.	T	T	S																					.	.														T		S
Template Predicted Secondary structure																					.									.	.																								.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.		.	.	.	.	.	30	.	.			.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.			.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	Y	R	Y	R	H	I	Y	E	P	G	C	E	Y	A	I	Y	Q	R	Q	S	A	F	S	E	E	W	D	E	W	E	T	L	L	D	A	N	K	R	A	A	H	S	E	F	Y	S	M	G	G	M	A	I	T	P	D	N	T	I	M	A	L	A	E	D	F	L	S	R	R	Q	Y	G	I	R	F	R	N	L
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.																	.
Template Conservation																											.	.	.																	.
Template Sequence		G	K	R	Y	F	Y	F	Y	N	T	G	L	Q	N	Q	R	V	L	Y	V	Q	D	S	L	E	.	.	.	G	E	A	R	V	F	L	D	P	N	I	L	S	D	D	G	.	T	V	A	L	R	G	Y	A	F	S	E	D	G	E	Y	F	A	Y	G	L	S	A	S	G	S	D	W	V	T	I	K	F	M	K	V
Template Known Secondary structure		T	T									S	S		S	S							S	S	S	S	.	.	.	S								G	G	G	G		S	S	S	.											T	T	S	S									T	T		S									T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.																	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.				.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.		.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.											.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query Sequence		E	T	G	N	W	Y	P	E	L	L	D	N	V	E	P	S	F	V	W	A	N	D	S	W	I	F	Y	Y	V	R	K	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	L	L	P	Y	Q	V	W	R	H	A	I	G	T	P	A	S	Q	D	K	L	I	Y	E	E	K	D	D	T	Y	Y	V	.	S	L	H
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	A	K	E	L	P	D	V	L	E	R	V	K	F	S	M	A	W	T	H	D	G	K	G	M	F	Y	N	A	Y	P	Q	Q	D	G	K	S	D	G	T	E	T	S	T	N	L	H	Q	K	L	Y	Y	H	V	L	G	T	D	Q	S	E	D	I	L	C	A	E	F	P	D	E	P	K	W	M	G	G	A	E
Template Known Secondary structure		T	T	T																		T	T	S	S											S	S			S	S	S															T	T	S		G	G	G								T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.		.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.							.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure														.																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	T	T	S	K	H	Y	V	V	I	H	L	.	A	S	A	T	T	S	E	V	R	L	L	D	A	E	M	A	D	A	E	P	.	.	.	.	.	.	F	V	F	L	P	R	R	K	D	H	E	Y	S	L	D	H	Y	Q	H	R	F	Y	L	R	S	N	R	H	G	K	N	F	G	L	Y	R	T	R	M	R	D
Query Conservation														.																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	D	D	G	R	Y	V	L	L	S	I	R	E	G	D	P	V	N	R	L	W	Y	C	D	L	Q	Q	E	S	N	G	I	T	G	I	L	K	W	V	K	L	I	D	N	F	E	G	E	Y	D	Y	V	T	N	E	G	T	V	F	T	F	K	T	N	R	H	S	P	N	Y	R	L	I	N	I	D	F	T	D
Template Known Secondary structure				T	T	S																					G	G	G	S	S	S	S	S		S	S									S	S	S	S									T	T								T	T		T	T								T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		303	.	.			.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.		.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.																				.
Query SS confidence					.	.																				.
Query Sequence		E	Q	Q	.	.	W	E	E	L	I	P	P	R	E	N	I	M	L	E	G	F	T	L	F	.	T	D	W	L	V	V	E	E	R	Q	R	G	L	T	S	L	R	Q	I	N	R	K	T	R	E	V	I	G	I	A	F	D	D	P	A	Y	V	T	W	I	A	Y	N	P	E	P	E	T	A	R	L	R	Y	G	Y
Query Conservation					.	.																				.
Alig confidence					.	.																				.																																							.	.
Template Conservation																																																																	.	.
Template Sequence		P	E	E	S	K	W	K	V	L	V	P	E	H	E	K	D	V	L	E	W	V	A	C	V	R	S	N	F	L	V	L	C	Y	L	H	D	V	K	N	T	L	Q	L	H	D	L	A	T	G	A	L	L	K	I	F	P	L	E	V	G	S	V	V	.	.	G	Y	S	G	Q	K	K	D	T	E	I	F	Y	Q	F
Template Known Secondary structure				G	G	G									S	S										T	T	T									T	T									T	T	T											S	S				.	.						T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.			.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.			.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.
Query SS confidence																					.	.
Query Sequence		S	S	M	T	T	P	D	T	L	F	E	L	D	M	D	T	G	E	R	.	.	R	V	L	K	Q	T	E	V	P	G	F
Query Conservation																					.	.
Alig confidence																					.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	S	F	L	S	P	G	I	I	Y	H	C	D	L	T	K	E	E	L	E	P	R	V	F	R	E	V	T	V	K	G	I
Template Known Secondary structure				S	S										T	T	S	S	S												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430