Job Description P24555 Confidence 99.43% Date Thu Jan 5 11:41:42 GMT 2012 Rank 103 Aligned Residues 248 % Identity 19% Template d1k8qa_ SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Gastric lipase Resolution 2.70

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.			.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.					.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.																																								.	.	.	.																						.
Query SS confidence															.	.																																								.	.	.	.																						.
Query Sequence		Y	R	S	E	H	L	W	I	V	A	R	D	G	.	.	V	E	V	P	V	S	L	V	Y	H	R	K	H	F	R	K	G	H	N	P	L	L	V	Y	G	Y	G	S	Y	G	A	S	I	D	A	D	F	S	F	.	.	.	.	S	R	L	S	L	L	D	R	G	F	V	Y	A	I	V	H	V	R	G	G	G	.
Query Conservation															.	.																																								.	.	.	.																						.
Alig confidence															.	.																																								.	.	.	.																						.
Template Conservation
Template Sequence		Y	P	A	E	E	Y	E	V	V	T	E	D	G	Y	I	L	G	I	D	R	I	P	Y	G	R	K	N	S	E	N	I	G	R	R	P	V	A	F	L	Q	H	G	L	L	A	S	A	T	N	W	I	S	N	L	P	N	N	S	L	A	F	I	L	A	D	A	G	Y	D	V	W	L	G	N	S	R	G	N	T	W
Template Known Secondary structure												T	T	S										S		S	S			T	T	T	T	T										T	T			G	G	G	G	S	S	S		T	T	T									T	T									T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.
							487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.				.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																															.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																																															.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	E	L	G	Q	Q	W	Y	E	D	G	K	F	L	K	K	K	N	T	F	N	D	Y	L	D	A	C	D	A	L	L	K	L	G	Y	G	S	P	S	L	C	Y	A	M	G	G	S	A	G	G	M	L	M	G	V	A	I	N	Q	R	P	E	L	.	.	.	F	H	G	V	I	A	Q	V	P	F
Query Conservation		.	.	.	.	.																																																															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																					.	.																									.	.	.
Template Conservation																																											.	.
Template Sequence		A	R	R	N	L	Y	Y	S	P	D	S	V	E	F	W	A	F	S	F	D	E	M	A	K	Y	D	L	P	A	T	I	D	F	I	L	K	K	T	G	Q	D	.	.	K	L	H	Y	V	G	H	S	Q	G	T	T	I	G	F	I	A	F	S	T	N	P	K	L	A	K	R	I	K	T	F	Y	A	L	A	P	V
Template Known Secondary structure		S				S	S	S		T	T	S	T	T	T	T										T																S	.	.								T																		T	T								S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.			.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
		559	560	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	D	V	V	T	T	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	E	S	I	P	L	T	T	G	E	F	E	E
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	T	V	K	Y	T	E	T	L	I	N	K	L	M	L	V	P	S	F	L	F	K	L	I	F	G	N	K	I	F	Y	P	H	H	F	F	D	Q	F	L	A	T	E	V	C	S	R	E	T	V	D	L	L	C	S	N	A	L	F	I	I	C	G	F	D	T	M	N	L	N	M	S	R	L	D	V	Y	L	S	H
Template Known Secondary structure		S			S	S			S	G	G	G	G	G	G	T	S									S		S	S			S													T	T	T	B	T	T	T																G	G	G	S		G	G	G						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	N	P	Q	D	P	Q	Y	Y	E	Y	M	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	P	Y	D	N	V	T	A	Q	A	Y	P	H	L	L	V	T	T	G	L	H	D	S	Q	V	Q	Y	W	E	P	A	K	W	V	A	K	L	R	E
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation																																																							.
Template Sequence		N	P	A	G	T	S	V	Q	N	V	L	H	W	S	Q	A	V	K	S	G	K	F	Q	A	F	D	W	G	S	P	V	Q	N	M	M	H	Y	H	Q	S	M	P	P	Y	Y	N	L	T	D	M	H	V	P	.	I	A	V	W	N	G	G	N	D	L	L	A	D	P	H	D	V	D	L	L	L	S	K	L	P	N
Template Known Secondary structure																						S		B					S	S									S	S	S	S			B			G	G	G			S		.							T	T		S	S	S										T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.
Template SS confidence
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
		635	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.				.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.
Query Sequence		L	K	T	D	D	H	L	L	L	L	C	T	D	M	D	S	G	H	G	.	.	.	G	K	S	G	R	F	K	S	Y	E	G	V	A	M	E	Y	A	F	L
Query Conservation																					.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.													.	.	.										.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		L	.	.	.	.	.	.	I	Y	H	R	K	I	P	P	Y	N	H	L	D	F	I	W	A	M	D	A	P	Q	A	V	.	.	Y	N	E	I	V	S	M	M
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.							T	T			T	T						T	T					T	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
		342							.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.			.	.	.	370	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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