Job Description P24555 Confidence 99.51% Date Thu Jan 5 11:41:42 GMT 2012 Rank 95 Aligned Residues 247 % Identity 19% Template d1hlga_ SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Gastric lipase Resolution 3.00

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		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.					.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.																					.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.																					.	.	.
Query Sequence		Y	R	S	E	H	L	W	I	V	A	R	D	G	V	E	V	P	V	S	L	V	Y	H	R	K	H	F	R	K	G	H	N	P	L	L	V	Y	G	Y	G	S	Y	G	A	S	I	D	A	D	F	S	F	S	.	.	.	.	R	L	S	L	L	D	R	G	F	V	Y	A	I	V	H	V	R	G	G	G	.	.	.
Query Conservation																																																							.	.	.	.																					.	.	.
Alig confidence																					.																																		.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation																					.
Template Sequence		Y	P	N	E	E	Y	E	V	V	T	E	D	G	Y	I	L	E	V	N	.	R	I	P	Y	G	K	K	N	S	G	Q	R	P	V	V	F	L	Q	H	G	L	L	A	S	A	T	N	W	I	S	N	L	P	N	N	S	L	A	F	I	L	A	D	A	G	Y	D	V	W	L	G	N	S	R	G	N	T	W	A	R
Template Known Secondary structure												T	T	S	B						.				S		S	S	T	T												T	T			G	G	G	G	G	S	S		T	T	S									T	T									T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.		.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
					487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.				.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure		.	.	.																																																														.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																																														.	.	.
Query Sequence		.	.	.	E	L	G	Q	Q	W	Y	E	D	G	K	F	L	K	K	K	N	T	F	N	D	Y	L	D	A	C	D	A	L	L	K	L	G	Y	G	S	P	S	L	C	Y	A	M	G	G	S	A	G	G	M	L	M	G	V	A	I	N	Q	R	P	E	.	.	.	L	F	H	G	V	I	A	Q	V	P	F	V	D
Query Conservation		.	.	.																																																														.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																	.	.																												.	.	.
Template Conservation																																					.	.
Template Sequence		R	N	L	Y	Y	S	P	D	S	V	E	F	W	A	F	S	F	D	E	M	A	K	Y	D	L	P	A	T	I	D	F	I	V	K	K	.	.	T	G	Q	K	Q	L	H	Y	V	G	H	S	Q	G	T	T	I	G	F	I	A	F	S	T	N	P	S	L	A	K	R	I	K	T	F	Y	A	L	A	P	V	A	T
Template Known Secondary structure			B	S	S	S		T	T	S	T	G	G	G										T													.	.				S								T																		T	T								S			S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.
Template SS confidence
		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.			.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
		561	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	M	L	D	E	S	I	P	L	T	T	G	E	F	E	E	W	G	N
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	K	Y	T	K	S	L	I	N	K	L	R	F	V	P	Q	S	L	F	K	F	I	F	G	D	K	I	F	Y	P	H	N	F	F	D	Q	F	L	A	T	E	V	C	S	R	E	M	L	N	L	L	C	S	N	A	L	F	I	I	C	G	F	D	S	K	N	F	N	T	S	R	L	D	V	Y	L	S	H	N	P
Template Known Secondary structure			S	S			S	G	G	G	G	G	G	G												S	S	B				T	T	T	T	T	T	S										S						T												T	T	S		G	G	G						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
		583		.	.	.	.	.	.	590	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	.	Q	D	P	Q	Y	Y	E	Y	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	Y	S	P	Y	D	N	V	T	A	Q	A	Y	P	H	L	L	V	T	T	G	L	H	D	S	Q	V	Q	Y	W	E	P	A	K	W	V	A	K	L	R	E	L	K
Query Conservation			.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																												.
Template Conservation																																																					.																												.
Template Sequence		A	G	T	S	V	Q	N	M	F	H	W	T	Q	A	V	K	S	G	K	F	Q	A	Y	D	W	G	S	P	V	Q	N	R	M	H	Y	D	Q	S	Q	P	P	Y	Y	N	V	T	A	M	N	V	P	.	I	A	V	W	N	G	G	K	D	L	L	A	D	P	Q	D	V	G	L	L	L	P	K	L	P	N	L	.
Template Known Secondary structure		S			B															S		B					S	S									S	S	S	S			B			G	G	G			S		.							T	T		S	S	S													T	T		.
Template Predicted Secondary structure																																																					.																												.
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
		637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.				.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.
Query Sequence		T	D	D	H	L	L	L	L	C	T	D	M	D	S	G	H	G	.	.	.	G	K	S	G	R	F	K	S	Y	E	G	V	A	M	E	Y	A	F	L
Query Conservation																			.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.													.	.	.										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	I	Y	H	K	E	I	P	F	Y	N	H	L	D	F	I	W	A	M	D	A	P	Q	E	V	.	.	Y	N	D	I	V	S	M	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.							T	T			T	T						T	T					T	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
							343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.			.	.	.	370	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions