Job Description P24555 Confidence 98.72% Date Thu Jan 5 11:41:42 GMT 2012 Rank 196 Aligned Residues 250 % Identity 14% Template c2rauA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative esterase; PDBTitle: crystal structure of a putative lipase (np_343859.1) from sulfolobus2 solfataricus at 1.85 a resolution Resolution 1.85 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.												.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.															.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	Y	A	A	N	Y	R	S	E	H	L	W	I	V	A	R	D	G	V	E	V	P	V	S	L	V	Y	H	R	K	H	F	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	H	N	P	L	L	V	Y	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	G	A	S	I	D	A	D	F
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	E	E	W	K	I	V	K	R	E	A	P	I	L	G	N	D	Q	L	I	E	N	I	W	K	X	K	R	E	D	S	P	Y	D	I	I	S	L	H	K	V	N	L	I	G	G	G	N	D	A	V	L	I	L	P	G	T	W	S	S	G	E	Q	L	V	T	I	S	W	N	G	V	H	Y	T	I	P	D	Y	R
Template Known Secondary structure				S											T	T														S	S	S	T	T											T	T												T	T									S			T	T				S				G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.					.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.
Query Sequence		S	F	S	R	L	S	L	L	D	R	G	F	V	Y	A	I	V	H	V	R	G	G	G	E	L	G	Q	Q	W	Y	E	D	G	K	F	L	K	K	K	N	T	F	.	.	.	.	N	D	Y	L	D	A	C	D	A	L	L	K	L	G	Y	G	S	P	S	L	C	Y	A	M	G	G	S	A	G	G	M	L	M	G
Query Conservation																																												.	.	.	.
Alig confidence																							.																					.	.	.	.															.	.
Template Conservation																							.																																							.	.
Template Sequence		K	S	I	V	L	Y	L	A	R	N	G	F	N	V	Y	T	I	D	Y	R	T	.	H	Y	V	P	P	F	L	K	D	R	Q	L	S	F	T	A	N	W	G	W	S	T	W	I	S	D	I	K	E	V	V	S	F	I	K	R	D	S	.	.	G	Q	E	R	I	Y	L	A	G	E	S	F	G	G	I	A	A	L
Template Known Secondary structure		G									T	T									G	G	.	G	G			T	T			G	G	G	G	G	G	G	T	T		S																				.	.			S	S							T
Template Predicted Secondary structure																							.																																							.	.
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140			.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		540	.	.	.	.	.		.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure								.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	I	N	Q	R	.	P	E	L	F	H	G	V	I	A	Q	V	P	F	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	Y	S	S	L	Y	W	K	N	D	I	K	G	L	I	L	L	D	G	G	P	T	K	H	G	I	R	F	Y	T	P	E	V	N	S	I	E	E	X	E	A	K	G	I	Y	V	I	P	S	R	G	G	P	N	N	P	I	W	S	Y	A	L	A	N	P	D	X	P	S	P	D	P	K	Y	K	S	I	S	D	F
Template Known Secondary structure																			S		S		B		T	T							S		S	S								T							S	S	S	T	T		T								S	T	T	S			S	S	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
										561	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	T	T	M	L	D	E	S	I	P	L	T	T	G	E	F	E	E	W	G	N	P	Q	D	P	Q	Y	Y	E	Y	M	K	S	Y	S	P	Y	D	N	V	T	A	Q	A	Y	P	H	L	L	V	T	T	G	L	H	D	S	Q	V	Q	Y	W	E	P	A	K	W	V	A	K	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	X	D	S	L	Y	V	T	G	S	A	N	P	Y	D	Y	P	Y	S	K	K	E	D	X	F	P	I	L	A	S	F	D	P	Y	W	P	Y	R	L	S	L	E	R	D	L	K	F	D	Y	E	G	I	L	V	P	.	T	I	A	F	V	S	E	R	F	G	I	Q	I	F	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T	S			T	T	S	T	T													T	S		S									T	T	T						T	T					.							T	T	T					B		G	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																									.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.		.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		633	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.				.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.
Query Sequence		R	E	L	K	T	D	D	H	L	L	L	L	C	T	D	M	D	S	G	H	.	.	.	G	G	K	S	G	R	F	K	S	Y	E	G	V	A	M	E	Y	A	F	L	V	A	L
Query Conservation																						.	.	.
Alig confidence														.	.	.						.	.	.											.	.
Template Conservation														.	.	.																			.	.
Template Sequence		K	I	L	P	S	N	S	E	I	I	L	L	.	.	.	K	G	Y	G	H	L	D	V	Y	T	G	E	N	S	E	K	D	V	.	.	N	S	V	V	L	K	W	L	S	Q	Q
Template Known Secondary structure		G	G	S		T	T							.	.	.	T	T			G	G	G	G	T	S	S	T	T					T	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.																			.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.				.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.			.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions