Job Description Q46820 Confidence 99.53% Date Thu Jan 5 12:34:45 GMT 2012 Rank 150 Aligned Residues 226 % Identity 26% Template c1qo8A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:flavocytochrome c3 fumarate reductase; PDBTitle: the structure of the open conformation of a flavocytochrome2 c3 fumarate reductase Resolution 2.15 Å

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		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	V	V	P	R	S	E	K	V	A	V	I	G	A	G	P	A	G	L	G	C	A	D	I	L	A	R	A	G	V	Q	V	D	V	F	D	R	H	P	E	I	G	G	M	L	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	P	S	E	T	T	Q	V	L	V	V	G	A	G	S	A	G	F	N	A	S	L	A	A	K	K	A	G	A	N	V	I	L	V	D	K	A	P	F	S	G	G	N	S	M	I	S	A	G	G	M	N	A	V	G	T	K	Q	Q	T	A	H	G	V	E	D	K	V	E	W	F	I	E	D	A	M	K	G	G
Template Known Secondary structure		T			S											S														T								S	S	S	S	S		T	T	G	G	G			S					S	S							T	T																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
			352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.				.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.														.	.	.
Query SS confidence		.														.	.	.
Query Sequence		.	G	I	P	P	F	K	L	D	K	T	V	L	S	.	.	.	Q	R	R	E	I	F	T	A	M	G	I	D	F	H	L	N	C	E	I	G	R	D	I	T	F	S	D	L	T	S	E	Y	D	A	V	F	I	G	V	G	T	Y	G	M	M	R	A	D	L	P	H	E	D	A	P	G	V	I	Q	A	L	P	F
Query Conservation		.														.	.	.
Alig confidence		.														.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Q	Q	N	D	I	K	L	V	T	I	L	A	E	Q	S	A	D	G	V	Q	W	L	E	S	L	G	A	N	L	D	D	L	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T		S																						T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	A	H	T	R	Q	L	M	G	L	P	E	S	E	E	Y	P	L	T	D	V	E	G	K	R	V	V	V	L	G	G	G	D	T	T	M	D	C	L	R	T	S	I	R	L	N	A	A	S	V	T	C	A	Y	R	R	D	E	V	S	M	P	G	S	R	K	E	V	V	N	A	R	E	E	G	V	E	F	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	A	R	V	D	R	T	H	R	P	H	G	G	K	S	S	G	P	E	I	I	D	T	L	R	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	E	Q	G	I	D	T	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T		S	S							S	S	S	S														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										260	.	.	.	.	.	.	.	.
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		F	N	V	Q	P	Q	Y	I	A	C	D	E	D	G	R	L	T	A	V	G	L	I	R	T	A	M	G	E	P	G	P	D	G	R	R	R	P	R	P	V	A	G	S	E	F	E	L	P	A	D	V	L	I	M	A	F	G	F	Q	A	H	A	M	P	W	L	Q	G	S	G	I	K	L	D	K	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	S	R	V	V	K	L	V	V	N	D	D	H	S	V	V	G	A	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	K	H	T	G	Y	Y	M	I	G	A	K	S	V	V	L	A	T	G	G	Y	G	M	N	K	E	M	I	A	Y	Y	R	P	T	M	K	D	M	T	S	S	N
Template Known Secondary structure			S										T	T	S	B							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T																		T	T										G	G	G	T	T					S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	I	T	A	T	G	D	G	V	L	M	A	K	E	I	G	A	S	M	T	D	I	D	W	V	Q	A	H	P	T	V	G	K	D	S	R	I	L	I	S	E	T	V	R	G	V	G	A	V	M	V	N	K	D	G	N	R	F	I	S	E	L	T	T	R	D	K	A	S	D	A	I	L	K	Q	P	G	Q	F	A
Template Known Secondary structure			T	T		S										T	T	B				S	T	T										S	S	S		S	B			T					T	T						T	T	S				S		T	T	S											T	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	I	I	F	D	N	Q	L	Y	K	K	A	K	M	V	R	G	Y	D	H	L	E	M	L	Y	K	G	D	T	V	E	Q	L	A	K	S	T	G	M	K	V	A	D	L	A	K	T	V	S	D	Y	N	G	Y	V	A	S	G	K	D	T	A	F	G	R	A	D	M	P	L	N	M	T	Q	S	P	Y	Y	A	V
Template Known Secondary structure																						T	T						S	S								T	T																				S			T	T	T			S						S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
											583	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.			.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.									.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	L	I	Q	T	G	D	V	G	Y	.	.	L	P	T	Q	T	H	L	K	K	V	F	A	G	G	D	A	V	H	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	V	V	T	A	M	A	A	G	R	Q	A	A	R	D	M	L	T	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	V	A	P	G	I	H	H	T	M	G	G	V	A	I	N	T	T	A	S	V	L	D	L	Q	S	K	P	I	D	G	L	F	A	A	G	E	V	T	G	G	V	H	G	Y	N	R	L	G	G	N	A	I	A	D	T	V	V	F	G	R	I	A	G	D	N	A	A	K	H
Template Known Secondary structure																B		T	T					B	T	T	S										S	T	T	B		S	S	S	T	T				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.