Job Description P77434 Confidence 99.86% Date Thu Jan 5 12:29:17 GMT 2012 Rank 210 Aligned Residues 380 % Identity 17% Template d2v1pa1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 1.9

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.							.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	I	D	R	L	P	P	Y	V	F	N	I	T	A	E	L	K	M	A	A	R	R	R	G	E	D	I	I	D	F	S	M	G	N	P	.	.	.	.	.	.	D	G	A	T	P	P	H	I	V	E	K	L	C	T	V	A	Q	R	P	D	T	H	G	Y	S	T	S	R	G	I	P	R	L	R	R	A	I	S	R
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.							.																.
Template Conservation																																																	.																.
Template Sequence		R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	.	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	R	G	D	E	A	.	F	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A	E	S	V	K	N
Template Known Secondary structure																								T	T	S		G	G	G	S		G	G	G		S				S			T	T		S		.									T	T	S					.	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																	.																.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.		.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.										.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Y	Q	D	R	Y	D	V	E	I	D	P	E	S	E	A	I	V	T	I	G	S	K	E	G	L	A	H	L	M	L	A	T	L	D	H	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	L	V	P	N	P	S	Y	P	I	H	I	Y	G	A	V	I	A	G	A	Q	V	R	S	V	P	L	V	E	G	V	D
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D
Template Known Secondary structure			T		.	.	.	.	.	.	.	.	.		S							S	S	T	T	T																				T	T	T						S	S												T	T							B		T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.										.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
										157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170					.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.		.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.								.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.															.																																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.															.																																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	F	F	N	E	L	E	R	A	I	R	E	S	Y	P	.	.	.	.	K	P	K	M	M	I	L	G	F	P	S	N	P	T	.	A	Q	C	V	E	L	E	F	F	E	K	V	V	A	L	A	K	R	Y	D	V	L	V	V	H	D	L	A	Y	A	D	.	.	.	.	.	.	.	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.															.																																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.															.																																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F	I	K	Q
Template Known Secondary structure		T	T	S			T	T	T	T		B														G	G	G								S	S	B		G	G	G		B																	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.							.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Y	D	G	W	K	A	P	S	I	M	Q	V	P	G	A	R	D	V	A	V	E	F	F	T	L	S	K	S	Y	N	M	A	G	W	R	I	G	F	M	V	G	N	K	T	L	V	S	A	L	A	R	I	K	S	Y	H	D	Y	G	.	.	.	.	.	.	T	F	T	P	L	Q	V	A	A	I	A	A	L	E
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L	A	V	G
Template Known Secondary structure				G	G	G	T	T	S										G	G	G		S						S	S	S	T	T			S	S								S	G	G	G													T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.						.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.																						.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.																						.
Query Sequence		G	D	Q	Q	C	V	R	D	I	A	E	Q	Y	K	R	R	R	D	V	L	V	K	G	L	H	E	A	G	W	M	V	E	M	P	K	A	S	M	Y	V	W	A	K	I	P	E	P	Y	A	A	M	G	S	.	.	.	.	.	L	E	F	A	K	K	L	L	N	E	A	K	V	C	V	S	P	G	I	G	F	.
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.																						.
Alig confidence																															.	.																							.	.	.	.	.																						.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		L	Y	D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	G	V	.	.	V	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L
Template Known Secondary structure					T	T																						T	T		.	.						S	S										S	T	T	S		G	G	G																						S
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350			.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
												365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.				.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	Y	G	D	T	H	V	R	F	A	L	I	E	.	.	.	N	R	D	R	I	R	Q	A	I	R	G	I	K	A	M	F	R	A	D	G	L	L	P	A	S	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N	I	K	G	L	T
Template Known Secondary structure				B		T	T	T		S	B				S										T	T	T																			T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.