Job Description P77434 Confidence 99.94% Date Thu Jan 5 12:29:17 GMT 2012 Rank 167 Aligned Residues 382 % Identity 15% Template d1ax4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 2.10

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.						.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.
Query Sequence		R	I	D	R	L	P	P	Y	V	F	N	I	T	A	E	L	K	M	A	A	R	R	R	G	E	D	I	I	D	F	S	M	G	N	P	D	G	A	T	P	.	.	.	.	.	P	H	I	V	E	K	L	C	T	V	A	Q	R	P	D	T	H	G	Y	S	T	S	R	G	I	P	R	L	R	R	A	I	S	R	W
Query Conservation																																										.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																																																																.
Template Sequence		R	I	K	M	V	E	K	I	R	V	P	S	R	E	E	R	E	A	A	L	K	E	A	G	Y	N	P	F	L	L	P	S	S	A	V	Y	I	D	L	L	T	D	S	G	T	N	A	M	S	D	H	Q	W	A	A	M	I	T	G	D	E	A	.	Y	A	G	S	R	N	Y	Y	D	L	K	D	K	A	K	E	L
Template Known Secondary structure				S																				T	T	S		G	G	G	S		G	G	G		S				S		S	S	S														T					.	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.		.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.								.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Query Sequence		Y	Q	D	R	Y	D	V	E	I	D	P	E	S	E	A	I	V	T	I	G	S	K	E	G	L	A	H	L	M	L	A	T	L	D	H	G	D	T	.	.	.	.	.	.	.	V	L	V	P	N	P	S	Y	P	I	H	I	Y	G	A	V	I	A	G	A	Q	V	R	S	V	P	L	V	E	G	V	D	.	.	.
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	Y	I	I	P	A	H	Q	G	R	G	A	E	N	I	L	F	P	V	L	L	K	Y	K	Q	K	E	G	K	A	K	N	P	V	F	I	S	N	F	H	F	D	T	T	A	A	H	V	E	L	N	G	C	K	A	I	N	I	V	T	E	K	A	F	D	S	E	T
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S																			T	T			S	S						S	S												T	T							B		G	G	G	G		T	T	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		89	90										.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
							157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170					.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.		.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.								.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.															.	.	.	.															.																													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.															.	.	.	.															.																													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	F	F	N	E	L	E	R	A	I	R	E	S	Y	P	.	.	.	.	K	P	K	M	M	I	L	G	F	P	S	N	P	T	.	A	Q	C	V	E	L	E	F	F	E	K	V	V	A	L	A	K	R	Y	D	V	L	V	V	H	D	L	A	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	D	I	V	Y	D
Query Conservation		.	.	.	.	.															.	.	.	.															.																													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.															.	.	.	.															.																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	D	W	K	G	D	F	D	I	K	K	L	K	E	N	I	A	Q	H	G	A	D	N	I	V	A	I	V	S	T	V	T	C	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	M	S	N	L	K	E	V	Y	E	I	A	K	Q	H	G	I	F	V	V	M	D	S	A	R	F	C	E	N	A	Y	F	I	K	A	R	D	P
Template Known Secondary structure				T	T	T	T		B														G	G	G								S	S	B	T	T	T	T	S	B																		T								T	T													G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280					.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.
Query Sequence		G	W	K	A	P	S	I	M	Q	V	P	G	A	R	D	V	A	V	E	F	F	T	L	S	K	S	Y	N	M	A	G	W	R	I	G	F	M	V	G	N	K	T	L	V	S	A	L	A	R	I	K	S	Y	H	D	Y	G	T	F	T	P	.	.	.	.	L	Q	V	A	A	I	A	A	L	E	G	D	Q	Q	C
Query Conservation																																																															.	.	.	.
Alig confidence																																																															.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	Y	K	N	A	T	I	K	E	V	I	F	D	M	Y	K	Y	A	D	A	L	T	M	S	A	K	D	P	L	L	N	I	G	G	L	V	A	I	R	D	N	E	E	I	F	T	L	A	R	Q	R	C	V	P	M	E	G	F	V	T	Y	G	G	L	A	G	R	D	M	A	A	M	V	Q	G	L	E	E	G	T
Template Known Secondary structure		G	G	T	T											G	G	G		S												S	S							S	S																T		S	T	T	T	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.						.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	R	D	I	A	E	Q	Y	K	R	R	R	D	V	L	V	K	G	L	H	E	A	G	W	M	V	E	M	P	K	A	S	M	Y	V	W	A	K	I	P	E	P	Y	A	A	M	G	.	.	.	.	.	S	L	E	F	A	K	K	L	L	N	E	A	K	V	C	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	E	E	Y	L	H	Y	R	I	G	Q	V	K	Y	L	G	D	R	L	R	E	A	G	I	P	I	Q	Y	P	T	G	G	H	A	V	F	V	D	C	K	K	L	V	P	Q	I	P	G	D	Q	F	P	A	Q	A	V	I	N	A	L	Y	L	E	S	G	V	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P
Template Known Secondary structure																							T	T			B		S	S			S	S						S	T	T	T		T	T	S		G	G	G																						S						B		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
			360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.				.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																				.	.	.
Query SS confidence		.																				.	.	.
Query Sequence		.	P	G	I	G	F	G	D	Y	G	D	T	H	V	R	F	A	L	I	E	.	.	.	N	R	D	R	I	R	Q	A	I	R	G	I	K	A	M	F	R	A	D	G	L	L	P	A	S	S
Query Conservation		.																				.	.	.
Alig confidence		.									.											.	.	.
Template Conservation											.
Template Sequence		A	T	G	E	Q	K	H	A	D	.	M	E	F	M	R	L	T	I	A	R	R	V	Y	T	N	D	H	M	D	Y	I	A	D	A	L	I	G	L	K	E	K	F	A	T	L	K	G	L	E
Template Known Secondary structure		T	T		S	B				S	.										T	T	S	S														T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure											.
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.