Job Description P42592 Confidence 98.73% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 331 % Identity 15% Template d2nvpa1 SCOP info alpha/alpha toroid Six-hairpin glycosidases CPF0428-like Resolution 2.20

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		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.				.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.																																																																.	.	.
Query SS confidence													.	.	.																																																																.	.	.
Query Sequence		T	W	P	W	D	T	W	K	Q	A	F	.	.	.	A	M	A	H	F	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	S	.	.	.
Query Conservation													.	.	.																																																																.	.	.
Alig confidence													.	.	.												.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Conservation																											.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		X	W	L	R	D	S	T	S	Q	V	E	H	Y	L	P	F	V	K	E	Y	P	E	L	K	A	.	I	F	T	G	L	I	N	R	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	C	I	F	I	D	P	Y	A	N	A	F	N	K	E	P	N	G	Q	K	W	D	N	D	I	T	K	D	S	P	W	V
Template Known Secondary structure													T	T	G	G	G	T	T	T		G	G	G			.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T		S				S	S	S	S				S	S			B	S				T	T
Template Predicted Secondary structure																											.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.		.	.	.	.	90	.	.	.	.													.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
													417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.		.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.														.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	W	V	A	.	E	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	E	R	K	Y	E	I	D	S	L	C	Y	P	V	R	L	I	H	K	Y	W	K	E	S	G	D	E	T	F	F	N	D	D	I	K	K	A	F	N	X	I	I	D	L	W	R	V	E	Q	Y	H	R	E	K	S	D	Y	S	F	Q	R	L	N	C	S	V	T	D	T	L	S	H	E	G	L	G	T	P	V	T
Template Known Secondary structure																													S	S																			G	G	G										B			S		S	S	S				S	S	S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	T	G	X	T	W	S	G	F	R	P	S	D	D	A	C	E	Y	G	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	S				S	B		T	T	S		B		S	S	S		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.		.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.			620	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.																										.	.
Query SS confidence																																													.																										.	.
Query Sequence		V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	.	G	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T	C	M	F	.	.	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D
Query Conservation																																													.																										.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.																										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	A	N	X	F	A	V	V	A	L	R	Y	I	S	E	I	A	E	K	V	Y	K	D	E	E	L	K	E	K	A	D	S	L	R	E	E	I	D	N	A	I	E	K	H	G	K	V	Y	K	E	G	F	G	E	V	Y	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					T	S																						T	T	S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																								229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
		629	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.		.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.
Query SS confidence																															.
Query Sequence		V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G	C	A	G	K	P	I	V	E	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	.	L	F	N	G	A	A	T	Q	A	N	A	D	A	V	V	K	V	M	L	D	P	K	E	F	N	T	F	V	P	L	G	T	A	A	L	T	N	P	A	F	G	A	D	I	Y	W	R	G	R	V
Query Conservation																															.
Alig confidence																								.	.	.	.	.			.																																											.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	E	T	D	G	X	G	N	Y	N	F	X	D	D	A	N	V	P	S	L	L	S	.	.	.	.	.	I	P	Y	L	E	Y	K	G	I	E	D	E	V	Y	Q	N	T	R	K	F	I	L	S	K	N	N	R	F	F	F	E	G	K	A	A	K	G	I	G	S	P	H	T	P	D	.	.	.	.	.	Q	Y	I
Template Known Secondary structure		S	B			S	S	S								S	S	S	S		G	G	G	.	.	.	.	.					T	S	S		S	S												T	S	T	T	S	T	T					S	S							T	T	S		T	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.						.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.						.	.	.
		708	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R	Y	G	Y	R	D	D	A	L	K	L	A	D	T	F	F	R	H	A	K	G	L	T	A	D	G	P	I	Q	E	N	Y	N	P	L	T	G	A	Q	Q	G	A	P	N	F	S	W	S	A	A	H	L	Y	M	L	Y	N	D	F	F	R	K	Q
Query Conservation
Alig confidence				.	.																.	.	.	.
Template Conservation				.	.																.	.	.	.
Template Sequence		W	H	.	.	I	A	L	S	X	Q	G	L	T	T	N	N	Q	E	E	.	.	.	.	I	D	Q	L	I	K	L	L	K	E	T	D	A	G	T	G	Y	X	H	E	G	F	H	V	D	D	P	T	K	F	T	R	D	W	F	A	W	S	N	S	L	F	S	H	F	I	Y	E	K	V	I	N	K
Template Known Secondary structure				.	.									S							.	.	.	.											T	S	T	T	S	S	S			S				T	T						S		S																	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.																.	.	.	.
Template SS confidence
		357	.			.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.					.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.