Job Description P42592 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 385 % Identity 16% Template d2jg0a1 SCOP info alpha/alpha toroid Six-hairpin glycosidases Trehalase-like Resolution 1.50

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		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		V	K	F	N	T	V	T	P	S	V	T	G	R	W	F	S	G	N	Q	T	W	P	W	D	T	W	K	Q	A	F	A	M	A	H	F	N	.	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G
Query Conservation																																						.
Alig confidence											.	.	.				.	.																				.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.				.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	P	E	P	Y	V	V	P	G	.	.	.	G	R	F	.	.	R	E	V	Y	Y	W	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	G	H	W	D	K	V	A	D	M	V	A	N	F	A	H	E	I	D	T	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	I	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S						B	.	.	.	T	T	B	.	.		S		B														T	T																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.				.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150				.	.	.			.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.										.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	W	V	A	E	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N	G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V
Query Conservation
Alig confidence		.																													.																																.	.	.
Template Conservation		.																													.																																.	.	.
Template Sequence		.	G	N	R	S	Y	Y	L	S	R	S	Q	P	P	F	F	A	L	M	V	E	L	L	A	Q	H	E	G	D	.	A	A	L	K	Q	Y	L	P	Q	M	Q	K	E	Y	A	Y	W	M	D	G	V	E	N	L	Q	A	G	Q	Q	E	K	.	.	.	R	V	V	K	L	Q	D	G	T	L	L	N	R	Y	W	D
Template Known Secondary structure		.	B	S	B	G	G	G	T	T				S															T		.																		T	T	T		T	T			T	T				T	.	.	.	T					T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.																													.																																.	.	.
Template SS confidence
			197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.				.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G
Query Conservation
Alig confidence															.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	D	T	P	R	P	E	S	W	V	E	D	.	I	A	T	A	K	S	N	P	N	R	P	A	T	E	I	Y	R	D	L	R	S	A	A	A	S	G	W	D	F	S	S	R	W	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	P	Q	Q
Template Known Secondary structure		S			S			G	G	G					.						T		T	T	S															T	T			S		G	G	G	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure															.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	320	.	.	.
		563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T	C	M	F	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D	V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G	C	A	G
Query Conservation
Alig confidence																																																																													.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	T	L	R	T	T	S	I	V	P	V	D	L	N	S	L	M	F	K	M	E	K	I	L	A	R	A	S	K	A	A	G	D	N	A	M	A	N	Q	Y	E	T	L	A	N	A	R	Q	K	G	I	E	K	Y	L	W	N	D	Q	Q	G	W	Y	A	D	Y	D	L	K	S	H	K	V	R	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	B		G	G	G																									T																							S			T	T	T	T							T	T	T	T				.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		K	P	I	V	E	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	L	F	N	G	A	A	T	Q	A	N	A	D	A	V	V	K	V	M	L	D	P	K	E	F	N	T	F	V	P	L	G	T	A	A	L	T	N	P	A	F	G	A	D	I	Y	W	R	G	R	.	V	W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.																														.	.												.	.	.	.	.													.
Template Conservation		.	.	.	.	.																														.	.												.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	N	Q	L	T	A	A	A	L	F	P	L	Y	V	N	A	A	A	K	D	R	A	N	K	M	A	T	A	T	K	.	.	T	H	L	L	Q	P	G	G	L	N	T	.	.	.	.	.	T	S	V	K	S	G	Q	Q	W	D	A	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	V	A	T	E	G	L	Q	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.				B	G	G	G	G					T	T		S														.	.			T			T	T				S	.	.	.	.	.	B	S				S	S	S	S	S	T	T																T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																														.	.												.	.	.	.	.
Template SS confidence
							399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.			.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.						.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
		722	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.		.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.								.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.																										.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.																										.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	G	Y	R	D	D	A	L	K	L	A	D	T	F	F	R	.	H	A	K	G	L	T	A	D	G	P	I	Q	E	N	Y	N	P	L	T	G	A	Q	Q	G	A	.	.	.	.	.	.	.	P	N	F	S	W	S	A	A	H	L	Y	M	L	Y	N	D	F	F	R	K	Q
Query Conservation																		.																										.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.																										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	G	Q	K	E	V	A	M	D	I	S	W	H	F	L	T	N	V	Q	H	T	Y	D	R	E	K	K	L	V	E	K	Y	D	V	S	T	T	G	T	G	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	T	L	K	M	L	D	L	I	C	P	K	E
Template Known Secondary structure		T	T																								S	S		B	S				T	T	S	S	S		B				S	S	S				B	S																S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		467	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.