Job Description P42592 Confidence 99.73% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 353 % Identity 18% Template d1gaia_ SCOP info alpha/alpha toroid Six-hairpin glycosidases Glucoamylase Resolution 1.70

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		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.					.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.								360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	E	Q	T	R	V	A	V	K	A	I	E	T	L	N	G	N	W	R	S	P	G	G	A	V	K	F	N	T	V	T	P	S	V	T	G	.	.	.	.	R	W	F	S	G	N	Q	T	W	P	W	D	T	W	K	Q	A	F	A	M	A	H	F	N	.	.	.	.	.	.	.	P	D	I	A	K	E	N	I	R
Query Conservation																																						.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.					.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.
Template Sequence		S	N	E	A	T	V	A	R	T	A	I	L	N	N	I	G	A	D	G	A	W	V	S	G	A	D	S	G	I	V	V	A	S	P	S	T	D	N	P	D	Y	F	Y	T	.	.	.	.	W	T	R	D	S	G	L	V	I	K	T	L	V	D	L	F	R	N	G	D	T	D	L	L	S	T	I	E	H	Y	I	S
Template Known Secondary structure															T	B	T	T	T		T	T		T	T			T	T		B		S		S		B	S	S	S	B			S		.	.	.	.																		T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.					.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.				.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.				.	430	.	.	.	.	.	.	.	.		.	440	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.															.	.	.											.
Query SS confidence																																																.	.	.															.	.	.											.
Query Sequence		A	V	F	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	.	.	.	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	.	.	.	T	Q	D	K	T	W	V	A	E	M	.	Y	P	K
Query Conservation																																																.	.	.															.	.	.											.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.																																.	.	.															.	.	.											.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	Q	A	I	I	Q	G	V	S	.	.	.	.	.	.	N	P	S	G	D	L	S	S	G	G	L	G	E	P	K	F	N	V	D	E	T	A	Y	T	G	S	W	G	R	P	Q	R	D	G	P	A	L	R	A	T	A	M	I	G	F	G	Q	W	L	L	D	N	G	Y	T	S	A	A	T	E	I	V	W	P	L
Template Known Secondary structure											.	.	.	.	.	.	B	T	T	B		T	T	T	T	G	G	G						T	T	S		B			S			S				T																				T	T								T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.							.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N	G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	R	N	D	L	S	Y	V	A	Q	Y	W	N	Q	T	G	Y	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	E	E
Template Known Secondary structure													T	T	S					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	180
			521	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	K	P	E	E
Query Conservation		.
Alig confidence		.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Sequence		V	N	G	S	S	F	F	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	Q	H	R	A	L	V	E	G	S	A	F	A	T	A	V	G	S	S	.	.
Template Known Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T			.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template SS confidence
		181	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T	C	M	F	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D	V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G	C	A	G	K	P	I	V	E	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	L	F	N	G	A	A	T	Q	A	N	A	D	A	V	V	K	V	M	L	D	P	K
Query Conservation
Alig confidence																			.						.	.	.																																																				.	.
Template Conservation																			.						.	.	.																																																				.	.
Template Sequence		C	S	W	C	D	S	Q	A	P	Q	I	L	C	Y	L	Q	S	.	F	W	T	G	S	.	.	.	Y	I	L	A	N	F	D	S	S	R	S	G	K	D	T	N	T	L	L	G	S	I	H	T	F	D	P	E	A	G	C	D	D	S	T	F	Q	P	C	S	P	R	A	L	A	N	H	K	E	V	V	.	.	D
Template Known Secondary structure																	G	G	.	G	B		S	S	.	.	.	S	B		S			S			S					T								T	T			T	T			S		T	T	T	T		T	T	S												.	.
Template Predicted Secondary structure																			.						.	.	.																																																				.	.
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.				.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.			.
		680	.	.	.	.	.	.	.						.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	F	N	T	F	V	P	L	.	.	.	.	.	G	T	A	A	L	T	N	P	A	F	G	A	D	I	Y	W	R	G	R	V	W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R	Y	G	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	F	R	S	I	Y	T	L	N	D	G	L	S	D	S	E	A	V	A	V	G	R	Y	P	E	D	S	Y	Y	N	G	N	P	W	F	L	C	T	L	A	A	A	E	Q	L	Y	D	A	L	Y	Q	W	D	K	Q	G	S	L	E	I	T	D	V	S	L	D	F	F	K	A	L	Y	S	G	A	A	T	G	T	Y
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T		G	G	G	T	T			T	T	S						S		T	T			G	G	G	S			B																						T						T	T	T									T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
													726	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.		.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	A	L	K	L	A	D	T	F	F	R	H	A	K	G	L	T	.	A	D	G	P	I	Q	E	N	Y	N	P	L	T	G	A	Q	Q	G	A	P	N	F	S	W	S	A	A	H	L	Y	M	L	Y	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		S	S	S	S	S	T	Y	S	S	I	V	S	A	V	K	T	F	A	D	G	F	V	S	I	V	E	T	H	A	A	S	N	G	S	L	S	E	Q	F	D	K	S	D	G	D	E	L	S	A	R	D	L	T	W	S	Y	A	A	L	L	T	A	N	N
Template Known Secondary structure			T	T	S																									S		T	T					S				T	T	T					S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.