Job Description P42592 Confidence 98.90% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 329 % Identity 13% Template c3qspB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:putative uncharacterized protein; PDBTitle: analysis of a new family of widely distributed metal-independent alpha2 mannosidases provides unique insight into the processing of n-linked3 glycans, streptococcus pneumoniae sp_2144 non-productive substrate4 complex with alpha-1,6-mannobiose Resolution 2.10 Å

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		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.				.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.																																																										.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.																																																										.	.	.	.
Query Sequence		T	W	P	W	D	T	W	K	Q	A	F	A	M	A	H	F	.	.	.	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	.	.	.	.
Query Conservation																		.	.	.																																																										.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.							.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation																											.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	W	L	R	D	S	T	A	Q	L	R	P	Y	L	H	V	A	K	R	D	A	L	L	R	Q	.	T	I	A	G	L	V	K	R	Q	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	L	K	D	P	Y	A	N	S	F	N	I	E	E	N	W	K	G	H	H	E	T	D	H	T	D	L
Template Known Secondary structure												G	G	G					T	T							.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T		S				S	S	S				S	S	G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure																											.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.		.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.																.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
																416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.		.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460													.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	.	W	V	A	E	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N	G	N	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	Y	G	A	T	R	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	W	I	W	E	R	K	Y	E	V	D	S	L	C	Y	P	L	Q	L	A	Y	L	L	W	K	E	T	G	E	T	S	Q	F	D	E	I	F	V	A	A	T	K	E	I	L	H	L	W	T	V	E	Q	D	H	K	N	S	P	Y	R	F	V	R	D	T	D	R	K	E	D	T	L	V	N	D	G	F	G	P
Template Known Secondary structure			T	T																													T	T	S	S																	G	G	G	G	G	G										S		G	G	G	S						T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	F	A	V	T	G	M	T	W	S	A	F	R	P	S	D	D	C	C	Q	Y	S	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S	S				S	B		T	T	S	S	B		S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
		549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.				.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.																																.	.
Query SS confidence																																														.	.	.																																.	.
Query Sequence		D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	.	.	.	I	L	G	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T	C	M	F	D	P	T	T	.	.
Query Conservation																																														.	.	.																																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.																																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	S	N	M	F	A	V	V	V	L	G	Y	V	Q	E	I	F	A	A	L	N	L	A	D	S	Q	S	V	I	A	D	A	K	R	L	Q	D	E	I	Q	E	G	I	K	N	Y	A	Y	T	T	N	S	K	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						T		T	T																							S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																											227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
		624	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	Y	Y	D	V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G	C	A	G	K	P	I	V	E	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	L	F	N	G	A	A	T	Q	A	N	A	D	A	V	V	K	V	M	L	D	P	K	E	F	N	T	F	V	P	L	G	T	A	A	L	T	N	P	A	F	G	A	D	I	Y	W
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	I	Y	A	F	E	V	D	G	L	G	N	A	S	I	M	D	D	P	N	V	P	S	L	L	A	A	P	Y	.	.	.	.	L	G	Y	C	S	V	D	D	E	V	Y	Q	A	T	R	R	T	I	L	S	S	E	N	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	F	Y	Q	G	E	Y	A	S	G	L	G	S	S	H
Template Known Secondary structure							S				S	S	S		B						S	S	S	S		S	T	T	T	T	T	.	.	.	.	T	T	S	S		T	T												T	S	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	T	T					S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.					.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.								.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
		704	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	R	V	W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R	Y	G	Y	R	D	D	A	L	K	L	A	D	T	F	F	R	H	A	K	G	L	T	A	D	G	P	I	Q	E	N	Y	N	P	L	T	G	A	Q	Q	G	A	P	N	F	S	W	S	A	A	H	L	Y	M	L	Y	N	D	F	F	R	K	Q
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.
Template Sequence		T	F	Y	R	Y	I	W	P	I	A	L	S	I	Q	G	L	T	T	R	D	K	A	E	.	.	.	.	K	K	F	L	L	D	Q	L	V	A	C	D	G	G	T	G	V	M	H	E	S	F	H	V	D	D	P	T	L	Y	S	R	E	W	F	S	W	A	N	M	M	F	C	E	L	V	L	D	Y	L	D	I	R
Template Known Secondary structure		S		T	T													T		S					.	.	.	.											T	S	T	T	S	S	S			S				T	T								S		B															T		.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.
Template SS confidence
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.					.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.