Job Description P42592 Confidence 99.92% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 282 % Identity 18% Template c3cihA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative alpha-rhamnosidase; PDBTitle: crystal structure of a putative alpha-rhamnosidase from2 bacteroides thetaiotaomicron Resolution 2.33 Å

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		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	W	K	Q	A	F	A	M	A	H	F	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	S	Y	L	X	N	Y	Y	L	F	F	D	S	E	S	V	K	R	T	I	W	L	L	R	G	K	D	P	V	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	H	S	N	T	I	X	D	Y	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	W	F	L	S	V	Y	D	Y	Y	X
Template Known Secondary structure									T	T	T																	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	G	G	G	B						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.										.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	Q	D	K	T	W	V	A	E	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N	G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	S	G	D	R	H	F	V	N	Q	L	Y	P	R	X	Q	T	X	X	D	Y	V	L	G	R	T	N	K	N	G	X	V	E	G	X	S	G	D	W	V	F	V	D	W	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																									T	T	B		T	T	S		B				T	T		B			S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	Y	L	D	K	K	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	F	E	Q	V	L	F	C	R	S	L	E	T	X
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T					S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														444	.	.	.	.	.	450	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
		588	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	M	A	T	I	L	G	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T	C	M	F	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D	V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G	C	A	G	K	P	I	V	E	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	L	F	N	G	A	A	T	Q	A	N
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	C	A	D	L	V	G	D	K	D	G	Q	Q	K	Y	E	K	L	A	S	A	L	K	A	K	L	E	P	T	F	W	N	N	Q	K	Q	A	F	V	H	N	C	V	D	G	R	Q	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	T	R	Y	A	N	X	F	S	V	F	F	D	Y	L	N	A	D	K
Template Known Secondary structure									T																										T	T	T	T				S				T	T				S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.											.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	A	V	V	K	V	M	L	D	P	K	E	F	N	T	F	V	P	L	G	T	A	A	L	T	N	P	A	F	G	A	D	I	Y	W	R	G	R	V	W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R	Y	G	Y	R	D	D	A	L	K	L	A	D	T	F	F	R	H	A	K	G	L	T	A	D	G	P
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Sequence		Q	Q	A	I	K	Q	S	V	L	L	N	D	E	I	L	K	I	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	X	R	F	Y	E	L	E	A	L	C	A	L	G	E	Q	E	T	V	X	K	E	.	.	.	X	K	A	Y	W	G	G	X	L	K	A	G	A
Template Known Secondary structure									T	T	T		T	T	S					S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T									.	.	.										T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template SS confidence
		538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.				580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
				748	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.											.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	I	Q	E	N	Y	N	P	L	T	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	G	A	P	N	F	S	W	S	A	A	H	L	Y	M	L	Y	N	D	F	F	R	K	Q
Query Conservation		.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	S	F	W	E	K	Y	N	P	E	E	S	G	T	Q	H	L	A	X	Y	G	R	P	Y	G	K	S	L	C	H	A	W	G	A	S	P	I	Y	L	L	G	K	Y	Y	L	G	V	K
Template Known Secondary structure		S	S			S				T	T			G	G	G	G	G		B	T	T	B	T	T		S		S	S	B	G	G	G		T									T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		593	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640