Job Description P42592 Confidence 98.74% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 456 % Identity 17% Template c2ww1B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:putative alpha-1,2-mannosidase; PDBTitle: structure of the family gh92 inverting mannosidase bt39902 from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 in complex with3 thiomannobioside Resolution 2.25 Å

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		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	I	S	F	S	A	H	A	A	N	A	D	N	Y	K	N	V	I	N	R	T	G	A	P	Q	Y	M	K	D	Y	D	Y	D	D	H	Q	R	F	N	P	F	F	D	L	G	A	W	H	G	H	L	L	P	D	G	P	N	T	M	G	G	F	P	G	V	A	L	L	T	E	E	Y	I	N	F	M	A	S	N
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Template Sequence		V	N	P	L	M	G	S	Q	S	T	F	E	L	S	T	G	N	T	Y	P	A	I	A	R	P	W	G	M	N	F	W	T	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	T	G	K	M	G	D	G	W	Q	Y	T	Y	T	A	N	K	I	R	G	.	.	.	.	.	F	K	Q	T	H	Q	P	S	P	W	I	N	D	Y
Template Known Secondary structure				T	T	T	T		S		B	T	T	B		S							B	S	S	T	T		S	S				.	.	.	.	.	.	.	.				S		T	T		S					T	T							.	.	.	.	.							S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.									.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.						.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.										.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	D	R	L	T	V	W	Q	D	G	K	K	V	D	F	T	L	E	A	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	G	A	L	V	Q	K	L	T	A	K	D	V	Q	V	E	M	T	L	R	F	A	T	P	R	T	S	L	L	E	T	K	I	T	S	N	K	P	L	D	L	V	W	D	G	E	L	L	E
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.																										.	.
Template Conservation																																																				.	.	.																										.	.
Template Sequence		G	Q	F	S	I	M	P	I	V	G	Q	P	V	F	D	E	E	K	R	A	S	W	F	A	H	K	G	E	V	A	T	P	Y	Y	Y	K	V	Y	L	A	E	H	D	I	V	T	E	M	T	P	.	.	.	T	E	R	A	V	L	F	R	F	T	F	P	E	N	D	H	S	Y	V	V	V	D	A	F	D	.	.
Template Known Secondary structure		S									S	S					T	T	T	T						G	G	G					T	T							T	T	T	T								.	.	.		S	S										S												S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.																										.	.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.				.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.															.	.	.	230
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	L	E	A	K	E	G	K	P	L	S	D	K	T	I	A	G	E	Y	P	D	Y	Q	R	K	I	S	A	T	R	D	G	L	K	V	T	F	G	K	V	R	A	T	W	D	L	L	T	S	G	E	S	E	Y	Q	V	H	K	S	L	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	E	I
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	S	Y	I	K	I	I	P	E	E	N	K	I	I	G	Y	T	T	R	N	S	G	G	V	P	E	N	F	K	N	Y	F	I	I	E	F	D	K	P	F	T	Y	K	A	T	V	E	N	G	N	L	Q	E	N	V	A	E	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S							G	G	G	T											S				T	T										S	S			S							T	T					T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.		.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.
Query SS confidence																																													.
Query Sequence		N	G	N	R	F	T	S	K	A	H	I	N	G	S	T	T	L	Y	T	T	Y	S	H	L	L	T	A	Q	E	V	S	K	E	Q	M	Q	I	R	D	I	L	A	R	.	P	A	F	Y	L	T	A	S	Q	Q	R	W	E	E	Y	L	K	K	G	L	T	N	P	D	A	T	P	E	Q	T	R	V	A	V	K	A
Query Conservation																																													.
Alig confidence																																													.																			.
Template Conservation																																																																.
Template Sequence		T	T	D	H	A	G	A	I	I	G	F	K	T	R	K	G	E	Q	V	N	A	R	I	A	S	S	F	I	S	F	E	Q	A	A	A	N	M	N	E	L	G	K	D	N	I	E	Q	L	A	Q	K	G	K	D	A	W	N	Q	V	L	G	K	.	I	E	V	E	G	G	N	L	D	Q	Y	R	T	F	Y	S	C
Template Known Secondary structure				S	S											T	T											S	S										G	G	G	T	T																			T	T	.					S
Template Predicted Secondary structure																																																																.
Template SS confidence
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
		310	.	.	.											.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Query Sequence		I	E	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	N	W	R	S	P	G	G	A	V	K	F	N	T	V	T	P	S	V	T	G	R	W	F	S	G	N	Q	T	W	P	W	D	T	W	K	Q	A	F	A	M	.	A	H	F	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	Q	I	Q	P	G
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.												.																				.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	R	S	L	L	F	P	R	K	F	Y	E	L	D	A	N	G	Q	P	I	H	Y	S	P	Y	N	G	Q	V	L	P	G	Y	M	F	T	D	T	G	.	.	.	.	.	F	W	D	T	F	R	C	L	F	P	L	L	N	L	M	Y	P	S	V	N	K	E	M	Q	E	G	L	I	N	T	Y	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	S	S	S								T	T	S							T	T	T	S					S								.	.	.	.	.					T	T	T																									.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Template SS confidence
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.						.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	W	V	A	E	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N	G	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.												.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.												.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	L	E	S	G	F	F	P	E	W	A	S	P	G	H	R	G	C	M	V	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	A	S	I	L	V	D	A	Y	M	K	G	V	K	V	D	D	.	I	K	T	L	Y	E	G	L	I	H	G	.	.	.	.	.	T	E	N	V	H	P	E	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.				S	S			S			S	S	S	B				S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T											T	T				S		.												.	.	.	.	.	T	S		B		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.												.	.	.	.	.
Template SS confidence
							377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.												.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.						.	.	.	430	.	.	.	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	S	T	G	R	L	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	B	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.		.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.
Query SS confidence																																																												.
Query Sequence		K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	K	.	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T	C
Query Conservation																																																												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	Y	N	K	L	G	Y	V	P	Y	D	V	K	I	N	E	N	A	A	R	T	L	E	Y	A	Y	D	D	W	C	I	Y	R	L	A	K	E	L	K	R	P	K	K	E	I	S	L	F	A	K	R	A	M	N	Y	K	N	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S			S	S	S	S		T	T																						T	T													T	T	G	G	G	G	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
		618	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	F	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D	V	R	I	E	D	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	F	D	K	E	S	K	L	M	R	G	R	N	E	D	G	T
Template Known Secondary structure		G			T	T	T	T					B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.