Job Description P42592 Confidence 98.62% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 463 % Identity 16% Template c2wvyA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-1,2-mannosidase; PDBTitle: structure of the family gh92 inverting mannosidase bt21992 from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 Resolution 2.26 Å

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		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.			.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.
Query SS confidence																													.	.
Query Sequence		S	A	H	A	A	N	A	D	N	Y	K	N	V	I	N	R	T	G	A	P	Q	Y	M	K	D	Y	D	.	.	Y	D	D	H	Q	R	F	N	P	F	F	D	L	G	A	W	H	G	H	L	L	P	D	G	P	N	T	M	G	G	F	P	G	V	A	L	L	T	E	E	Y	I	N	F	M	A	S	N	F	D	R
Query Conservation																													.	.
Alig confidence																					.								.	.																														.	.	.	.	.
Template Conservation																					.																																							.	.	.	.	.
Template Sequence		S	K	K	T	V	E	F	V	D	Y	V	N	P	L	M	G	T	E	S	.	T	N	T	Y	P	A	V	A	V	P	W	G	M	N	F	W	S	P	Q	T	G	E	N	G	S	G	W	M	Y	T	Y	T	D	S	L	M	R	G	.	.	.	.	.	F	R	Q	T	H	Q	P	S	P	W	I	N	D	Y	G	T	F
Template Known Secondary structure					S	S		G	G	G	G			T	T	T	T		S		.							B			T	T		S	S							S		T	T		S					T	T							.	.	.	.	.							S		T	T	T				S
Template Predicted Secondary structure																					.																																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.						.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.										.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	V	W	Q	D	G	K	K	V	D	F	T	L	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	I	P	G	A	L	V	Q	K	L	T	A	K	D	V	Q	V	E	M	T	L	R	F	A	T	P	R	T	S	L	L	E	T	K	I	T	S	N	K	P	L	D	L	V	W	D	G	E	L	L	E	K	L	E
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.								.	.	.																								.	.	.
Template Conservation																																								.								.	.	.																								.	.	.
Template Sequence		S	I	M	P	L	A	G	E	L	K	M	S	H	K	E	R	L	V	P	F	S	H	Q	Q	E	K	A	T	P	Y	N	Y	S	V	T	F	N	N	.	G	L	Q	T	S	L	S	.	.	.	A	T	S	R	G	A	V	F	E	V	S	F	P	E	K	E	D	Q	Y	V	V	V	D	.	.	.	A	Y	N	G	G
Template Known Secondary structure								S	S				S	T	T	T														S	S							T	T	.	S							.	.	.			S	S										T	T	S								.	.	.			S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																								.								.	.	.																								.	.	.
Template SS confidence
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.		140	.	.	.	.	.	.				.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.				170	.	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.		.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.			.	.
Predicted Secondary structure																															.																																															.	.
Query SS confidence																															.																																															.	.
Query Sequence		A	K	E	G	K	P	L	S	D	K	T	I	A	G	E	Y	P	D	Y	Q	R	K	I	S	A	T	R	D	G	.	L	K	V	T	F	G	K	V	R	A	T	W	D	L	L	T	S	G	E	S	E	Y	Q	V	H	K	S	L	P	V	Q	T	E	I	N	G	N	R	F	T	S	K	A	H	I	N	.	.	G	S
Query Conservation																															.																																															.	.
Alig confidence																															.																						.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	S	I	T	I	E	P	E	K	R	L	V	K	G	A	T	R	Y	N	N	G	G	V	P	D	N	F	A	N	Y	F	M	M	E	F	S	H	P	V	I	E	Y	G	T	Y	N	G	D	T	L	L	.	.	.	.	.	.	.	H	H	Q	T	D	V	A	A	D	Y	T	C	A	Y	L	K	F	D	V	P	A	G
Template Known Secondary structure								G	G	G	T										S	S				T	T										S	S										S	S				.	.	.	.	.	.	.		T							S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.								.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	T	L	Y	T	T	Y	S	H	L	L	T	A	Q	E	V	S	K	E	Q	M	Q	I	R	D	I	L	A	R	P	A	F	Y	L	T	A	S	Q	Q	R	W	E	E	Y	L	K	K	G	L	T	N	P	D	A	T	P	E	Q	T	R	V	A	V	K	A	I	E	T	L	N	G	N	W	R	S	P	G	G	A	V
Query Conservation
Alig confidence																																																	.																			.	.	.	.	.	.				.	.	.	.
Template Conservation																																																	.																			.	.	.	.	.	.				.	.	.	.
Template Sequence		E	K	L	T	I	R	T	A	S	S	F	I	S	P	E	Q	A	A	I	N	F	N	R	E	V	A	D	A	D	V	Q	L	I	S	G	K	A	R	E	Q	W	N	N	Y	L	G	R	.	V	E	A	E	G	G	T	D	E	Q	L	R	T	F	Y	S	C	L	.	.	.	.	.	.	Y	R	T	.	.	.	.	L
Template Known Secondary structure												S	S													T	T	T																			T	T	.					S	S													.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.																			.	.	.	.	.	.				.	.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.							.	.	.					.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.					.	.	.	340	.	.												.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query SS confidence														.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query Sequence		K	F	N	T	V	T	P	S	V	T	G	R	.	.	.	.	W	F	S	G	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	W	P	W	D	T	W	K	Q	A	F	A	M	.	A	H	F	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F
Query Conservation														.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Alig confidence														.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	P	R	E	F	Y	E	F	D	S	Q	G	N	P	V	Y	Y	S	P	Y	D	G	N	V	H	D	G	Y	M	Y	T	D	N	G	F	W	D	T	F	R	A	V	H	P	L	F	T	L	L	Y	P	E	V	S	E	R	V	T	Q	S	I	I	N	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	S	G	F
Template Known Secondary structure		T	S	S								T	T	S							T	T	T	S					S					S							T	T	T																									.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.										.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	W	V	A	E	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N	G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.												.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.												.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Sequence		M	P	E	W	A	S	P	G	H	R	G	C	M	I	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	V	S	L	L	V	D	A	W	M	K	G	I	Q	T	V	D	.	A	E	K	A	L	E	A	M	I	H	Q	.	.	.	.	.	T	Q	A	R	H	A	E	I	A	S	V	G	R	D	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S			S	S	S	B				S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T				S		.												.	.	.	.	.		S		B		S	S		T	T	T	B	T	T	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.												.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.												.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.		.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.						.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	E	Y	Y	D	K	L	G	Y	V	P	Y	P	E	V	P	E	A	T	A	K	T	L	E	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								S	S			T	T	T	S	T	T								.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
																																																							447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
		549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T	C	M	F	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	Y	A	D	W	C	I	A	R	F	A	E	S	L	G	K	Q	D	I	A	D	Q	Y	Y	Q	K	A	P	N	Y	R	N	.	.	.	.	.	L	Y	Y	P	E	H	G	F	M	W	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T										T	T	G	G	G	G	G	G	.	.	.	.	.	G			T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																	472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.						.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
		629	630	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	R	I	E	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	D	A	K	G
Template Known Secondary structure		B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		516	.	.	.	520