Job Description P42592 Confidence 99.62% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 357 % Identity 18% Template c2vn4A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glucoamylase; PDBTitle: glycoside hydrolase family 15 glucoamylase from hypocrea2 jecorina Resolution 1.85 Å

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		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.					.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.		.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.																												.									.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.																												.									.	.	.	.
Query Sequence		P	E	Q	T	R	V	A	V	K	A	I	E	T	L	N	G	N	W	R	S	P	G	G	A	V	K	F	N	T	V	T	P	S	V	T	G	.	.	.	.	R	W	F	S	G	N	Q	T	W	P	W	D	T	W	K	Q	A	F	A	M	A	H	F	N	P	D	I	.	A	K	E	N	I	R	A	V	.	.	.	.
Query Conservation																																						.	.	.	.																												.									.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.					.	.	.	.																				.									.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.
Template Sequence		S	T	E	T	P	I	A	L	N	N	L	L	C	N	V	G	P	D	G	C	R	A	F	G	T	S	A	G	A	V	I	A	S	P	S	T	I	D	P	D	Y	Y	Y	M	.	.	.	.	W	T	R	D	S	A	L	V	F	K	N	L	I	D	R	F	T	E	T	Y	D	A	G	L	Q	R	R	I	E	Q	Y	I
Template Known Secondary structure														T	T	B	T	T	T		T	T	S	T	T	S		T	T		B		S		S			S	S	S				S		.	.	.	.																			S	B
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50					.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
					371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410		.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.					.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																						.	.	.				.																													.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																						.	.	.				.																													.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	F	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	.	.	.	W	N	E	.	R	N	T	K	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	W	V	A	E	M	.	.	.	.	Y
Query Conservation		.	.	.																																						.	.	.				.																													.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.								.	.	.	.	.	.																									.	.	.				.																													.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	Q	V	T	L	Q	G	L	S	.	.	.	.	.	.	N	P	S	G	S	L	A	D	G	S	G	L	G	E	P	K	F	E	L	T	L	K	P	F	T	G	N	W	G	R	P	Q	R	D	G	P	A	L	R	A	I	A	L	I	G	Y	S	K	W	L	I	N	N	N	Y	Q	S	T	V	S	N	V	I	W
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	.	B	T	T	B		S	T	T	S	G	G	G	G						T	T	S		B			S			S				T																				T	T									T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.							.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N	G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	V	R	N	D	L	N	Y	V	A	Q	Y	W	N	Q	T	G	F	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W
Template Known Secondary structure															T	T	S					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.																																																											.
		520			.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.
Query SS confidence			.	.
Query Sequence		E	.	.	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	K	P
Query Conservation			.	.
Alig confidence			.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	E	V	N	G	S	S	F	F	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	Q	H	R	A	L	V	E	G	A	T	L	A	A	T	L	G	Q	S
Template Known Secondary structure		S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		598	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.		.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.
Query SS confidence																															.
Query Sequence		E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T	C	M	F	D	P	T	T	Q	F	Y	.	Y	D	V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G	C	A	G	K	P	I	V	E	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	L	F	N	G	A	A	T	Q	A	N	A	D	A	V	V	K	V	M	L
Query Conservation																															.
Alig confidence		.	.																.												.
Template Conservation		.	.																.
Template Sequence		.	.	G	S	A	Y	S	S	V	A	P	Q	V	L	C	F	L	.	Q	R	F	W	V	S	S	G	G	Y	V	D	S	N	I	N	T	N	E	G	R	T	G	K	D	V	N	S	V	L	T	S	I	H	T	F	D	P	N	L	G	C	D	A	G	T	F	Q	P	C	S	D	K	A	L	S	N	L	K	V	V	V
Template Known Secondary structure		.	.																.	G	G	G			T	T	T	T				S			S	S								B	T									S			G	G	G	T	T		T	T	T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																.
Template SS confidence
				210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
		677	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.						.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	P	K	E	F	N	T	F	V	P	L	.	.	.	.	.	G	T	A	A	L	T	N	P	A	F	G	A	D	I	Y	W	R	G	R	V	W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R	Y	G	Y	R	D	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.										.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	D	S	F	R	S	I	Y	G	V	N	K	G	I	P	A	G	A	A	V	A	I	G	R	Y	A	E	D	V	Y	Y	N	G	N	P	W	Y	L	A	T	F	A	A	A	E	Q	L	Y	D	A	I	Y	V	W	K	K	T	G	S	I	T	V	T	A	T	S	L	A	F	F	Q	E	L	V	P	G	V	T	A
Template Known Secondary structure		.	.					T	T		G	G	G	T	T			T	T	S						S	B	T	T			G	G	G				B																						T						T	T	T								S	T	T			S
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
																			729	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.		.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	L	A	D	T	F	F	R	H	A	K	G	L	T	.	A	D	G	P	I	Q	E	N	Y	N	P	L	T	G	A	Q	Q	G	A	P	N	F	S	W	S	A	A	H	L	Y	M	L	Y	N	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	Y	S	S	S	S	S	T	F	T	N	I	I	N	A	V	S	T	Y	A	D	G	F	L	S	E	A	A	K	Y	V	P	A	D	G	S	L	A	E	Q	F	D	R	N	S	G	T	P	L	S	A	L	H	L	T	W	S	Y	A	S	F	L	T	A	T	A	R
Template Known Secondary structure						T	T	S																							T	T	S		T	T					S				T	T	T					S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.