Job Description P42592 Confidence 98.18% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 398 % Identity 13% Template c2rdyB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:bh0842 protein; PDBTitle: crystal structure of a putative glycoside hydrolase family2 protein from bacillus halodurans Resolution 2.03 Å

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		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	L	V	Q	K	L	T	A	K	D	V	Q	V	E	M	T	L	R	F	A	T	P	R	T	S	L	L	E	T	K	I	T	S	N	K	P	L	D	L	V	W	D	G	E	L	L	E	K	L	E	A	K	E	G	K	P	L	S	D	K	T	I	A	G	E	Y	P	D	Y	Q	R	K	I	S	A	T	R	D	G
Query Conservation
Alig confidence																		.																																		.
Template Conservation																		.																																		.
Template Sequence		G	I	V	T	V	T	Y	T	I	G	G	V	Q	Y	T	R	.	E	L	F	V	T	Y	P	D	R	A	I	V	V	R	L	T	A	S	K	E	G	F	L	S	F	R	A	K	L	D	S	L	L	.	R	H	V	S	S	V	E	H	Y	T	I	S	G	T	A	P	E	H	V	S	P	S	Y	Y	D	E	E	N	P
Template Known Secondary structure		T									T	T						.						T	T	T	T									S	S	T	T											S	S	.																	S					T	T				S	S
Template Predicted Secondary structure																		.																																		.
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.		.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.				.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.
Query Sequence		L	K	V	T	F	G	K	V	R	A	T	W	D	L	L	T	S	G	E	S	E	Y	.	.	.	Q	V	H	K	S	L	P	V	Q	T	E	I	N	G	N	R	F	T	S	K	A	H	I	N	G	S	T	T	L	Y	T	T	Y	S	H	L	L	T	A	Q	E	V	S	K	E	Q	M	Q	I	R	D	I	L	A	R
Query Conservation																								.	.	.
Alig confidence																								.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	R	Y	G	H	P	D	X	S	Q	G	X	T	F	H	G	R	L	A	A	V	N	E	G	G	S	L	K	V	D	A	D	G	L	H	V	X	G	A	T	C	A	T	L	Y	F	S	A	S	T	S	F	D	P	S	T	G	A	S	C	L	E	R	D	P	S	L	R	T	I	E	T	I	K	A	I	C	K	R	G
Template Known Secondary structure							T	T	T			S													S	S						T	T								S											S			T	T	T	T				T	T																T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	F	Y	L	T	A	S	Q	Q	R	W	E	E	Y	L	K	K	G	L	T	N	P	D	A	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	R	V	A	V	K	A	I	E	T	L	N	G	N	W	R	S	P	G	G	A	V	K	F	N	T	V	T	P	S	V
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	K	E	I	V	N	R	H	L	E	D	Y	T	K	L	F	N	R	V	S	L	H	L	G	E	S	I	A	P	A	D	X	S	T	D	Q	R	I	K	E	Y	G	S	R	D	L	G	L	V	E	L	L	F	Q	Y	G	R	Y	L	X	I	A	S	S	R	P	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Q	P	A	N	L
Template Known Secondary structure																		T	T						S				S		T	T											G	G	G	S																					T	.	.	.	.	.	.	.	T	S				B	T
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.								.	.	.	350	.	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.		.	.					.	.				.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.			.	.	.	.	.	.	380	.	.		.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.					.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.			.	.	.	.			.	.	.																											.	.										.												.	.	.	.
Query SS confidence												.			.	.	.	.			.	.	.																											.	.										.												.	.	.	.
Query Sequence		T	G	R	W	F	S	G	N	Q	T	.	W	P	.	.	.	.	W	D	.	.	.	T	W	K	Q	A	F	A	M	A	H	F	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	.	.	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	.	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	.	.	.	.	A	W	N	L	S
Query Conservation												.			.	.	.	.			.	.	.																											.	.										.												.	.	.	.
Alig confidence												.			.	.	.	.			.	.	.																											.	.										.												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	G	I	W	N	E	E	T	R	A	P	W	S	S	N	Y	T	L	N	I	N	A	E	X	N	Y	W	P	A	E	T	C	N	L	A	E	L	H	K	P	L	I	H	F	I	E	R	L	A	A	N	G	K	K	T	A	E	I	N	Y	G	A	R	G	W	V	A	H	H	N	A	D	L	W	G	Q	T	A	P	V
Template Known Secondary structure		T	B	T					T	T		G	G	G	G				T	T	T						T	T	T	T	T	T	T	T		G	G	G	G																									S	S					S				T	T				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.		.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.
Query SS confidence																																								.
Query Sequence		P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	W	V	A	.	E	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N	G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E
Query Conservation																																								.
Alig confidence																																								.																																									.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		G	D	F	G	H	G	D	P	V	W	A	F	W	P	X	G	G	V	W	L	T	Q	H	L	W	E	H	Y	T	F	G	E	D	E	A	Y	L	R	D	T	A	Y	P	I	X	K	E	A	A	L	F	C	L	D	W	L	I	E	N	E	A	G	Y	L	V	T	S	P	S	T	S	P	E	Q	R	F	R	I	G	.
Template Known Secondary structure		B	T	T	T	T	S								T	T																									T																				T	T	S					S	S	B		B	T	T	B					T	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	G	Y	A	V	S	S	A	T	T	X	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T						B	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																										513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.
		558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.		.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
Predicted Secondary structure																																								.
Query SS confidence																																								.
Query Sequence		R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	.	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L
Query Conservation																																								.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	L	I	A	E	C	F	D	N	C	I	Q	A	A	K	R	L	S	I	D	E	D	F	V	K	A	L	S	D	A	K	Q	R	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T																B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																					526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560