Job Description P42592 Confidence 98.85% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 521 % Identity 17% Template c2eacB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-fucosidase; PDBTitle: crystal structure of 1,2-a-l-fucosidase from2 bifidobacterium bifidum in complex with3 deoxyfuconojirimycin Resolution 2.10 Å

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		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	L	V	Q	K	L	T	A	K	D	V	Q	V	E	M	T	L	R	F	A	T	P	R	T	S	L	L	E	T	K	I	T	S	N	K	P	L	D	L	V	W	D	G	E	L	L	E	K	L	E	A	K	E	G	K	P	L	S	D	K	T	I	A	G	E	Y	P	D	Y	Q	R	K	I	S	A	T	R	D	G
Query Conservation
Alig confidence																				.																												.	.
Template Conservation																				.																												.	.
Template Sequence		G	K	A	D	V	T	F	K	H	D	G	V	T	Y	T	R	E	Y	.	F	A	S	N	P	D	N	V	M	V	A	R	L	T	A	S	K	A	G	K	L	N	F	N	V	S	M	.	.	P	T	N	T	N	Y	S	K	T	G	E	T	T	T	V	K	G	D	T	L	T	V	K	G	A	L	G	N	N	G	L	L
Template Known Secondary structure		T									T	T								.				T	T	T	T									S	S	T	T									.	.		B		T	T	S											T	T									T	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.																												.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.		.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.			.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.		.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.																																																												.
Query SS confidence																					.																																																												.
Query Sequence		L	K	V	T	F	G	K	V	R	A	T	W	D	L	L	T	S	G	E	.	S	E	Y	Q	V	H	K	S	L	P	V	Q	T	E	I	N	G	N	R	F	T	S	K	A	H	I	N	G	S	T	T	L	Y	T	T	Y	S	H	L	L	T	A	Q	E	V	S	K	E	Q	M	Q	I	R	D	I	L	A	R	P	.
Query Conservation																					.																																																												.
Alig confidence																					.															.	.	.	.	.	.	.																																							.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	N	S	Q	I	K	V	V	L	D	N	G	T	L	S	E	G	S	D	G	A	S	L	K	V	S	D	A	K	A	V	T	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	I	A	A	A	T	D	Y	K	Q	K	Y	P	S	Y	R	T	G	E	T	A	A	E	V	N	T	R	V	A	K	V	V	Q	D	A	A	N	K	G	Y
Template Known Secondary structure																			T	T	S	S	S							S						.	.	.	.	.	.	.						S	B				T	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.								.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290									.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.												310	.	.	.	.	.	.	.	.	.			320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Query Sequence		A	F	Y	L	T	A	S	Q	Q	R	W	E	E	Y	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	L	T	N	P	D	A	T	P	E	Q	T	R	V	A	V	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	T	L	N	G	N	W	R	S	.	.	P	G	G	A	V	K	F	N	T	V	T	P	S	V
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	V	K	K	A	H	I	D	D	H	S	A	I	Y	D	R	V	K	I	D	L	G	Q	S	G	H	S	S	D	G	A	V	A	T	D	A	L	L	K	A	Y	Q	R	G	S	A	T	T	A	Q	K	R	E	L	E	T	L	V	Y	K	Y	G	R	Y	L	T	I	G	S	S	R	E	N	S	Q	L	P	S	N
Template Known Secondary structure																	T	T					S	S				T	T	S	T	T														T																												T	T		S	S			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
			334	.	.	.	.	.	340				.	.	.	.	.			.	.	.	.	350	.	.										.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.											.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.								.	.	.						.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query SS confidence		.								.	.	.						.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query Sequence		.	T	G	R	W	F	S	G	.	.	.	N	Q	T	W	P	.	.	W	D	T	W	K	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	M	A	H	F	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	.	.	.
Query Conservation		.								.	.	.						.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Alig confidence		.								.	.	.						.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	Q	G	I	W	S	V	T	A	G	D	N	A	H	G	N	T	P	W	G	S	D	F	H	M	N	V	N	L	Q	M	N	Y	W	P	T	Y	S	A	N	M	G	E	L	A	E	P	L	I	E	Y	V	E	G	L	V	K	P	G	R	V	T	A	K	V	Y	A	G	A	E	T	T	N	P	E	T	T	P	I	G
Template Known Secondary structure		T	T	B	T							S	S	T	T	S	S	S	G	G	G	G				T	T	T						T	S	S	T	T	T	T	T		G	G	G	G										T																	S	S	T	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
				386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.					.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																																																							.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																																																							.	.	.	.
Query Sequence		.	.	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	W	V	A	E	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	.	.	.	.	N	G	N	G
Query Conservation		.	.																																																																							.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																																																							.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	E	G	Y	M	A	H	T	E	N	T	A	Y	G	W	T	A	P	G	Q	S	F	S	W	G	W	S	P	A	A	V	P	W	I	L	Q	N	V	Y	E	A	Y	E	Y	S	G	D	P	A	L	L	D	R	V	Y	A	L	L	K	E	E	S	H	F	Y	V	N	Y	M	L	H	K	A	G	S	S	S	G	D
Template Known Secondary structure		S	S	S						S				S	S				S			S	S							T	T																																								T						G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.
		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	T	T	G	V	A	Y	S	P	E	Q	G	P	L	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	N	T	Y	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S									T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		556	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	L	V	W	Q	M	L	N	D	A	I	E	A	A	K	A	K	G	D	P	D	G	L	V	G	N	T	T	D	C	S	A	D	N	W	A	K	N	D	S	G	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		T	T		T	T						S	T	T			G	G	G	G		B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																							579	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.
				596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.								.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660					.	.
Predicted Secondary structure		.	.																		.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																		.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	.	.	.	.	.	.	.	Y	I	N	T	C	M	F	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D	V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G	C	A	G	K	P	I	V	E	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	L	F	N	.	.	.	.	G	A
Query Conservation		.	.																		.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																		.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	T	D	A	N	A	N	R	S	W	S	C	A	K	S	L	L	K	P	I	E	V	G	D	S	G	Q	I	K	E	W	Y	F	E	G	A	L	G	K	K	K	D	G	S	T	I	S	G	Y	Q	A	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	H	R	H	M	S	H	L	L	G	L	F	P	G	D	L	I	T	I
Template Known Secondary structure		B	S		T	T	S																B		T	T	S	S	B		S	S	T	T	B		S	T	T	B	B	T	T	S		B		T	T			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.			S			G	G	G	T	T	T	T	T	S	S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		622	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.									.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.
		663	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	Q	A	N	A	D	A	V	V	K	V	M	L	D	P	K	E	F	N	T	F	V	P	L	G	T	A	A	L	T	N	P	A	F	G	A	D	I	Y	W	R	G	R	V	W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R	Y	G	Y	R	D	D	A	L	K	L	A	D	T	F	F	R	H	A	K	G	L
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		D	N	S	E	Y	M	D	A	A	K	T	S	L	R	Y	R	C	F	K	G	N	V	L	Q	S	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	A	I	G	Q	R	I	N	S	W	A	.	.	R	T	G	D	G	N	T	T	Y	Q	L	V	E	L	Q	L	K	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S		T	T															T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.			T															.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		694	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.			.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		743	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	A	D	G	P	I	Q	E	N	Y	N	P	L	T	G	A	Q	Q	G	A	P	N	F	S	W	S	A	A	H	L	Y	M	L	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	N	A	M	Y	A	N	L	F	D	Y	H	A	P	F	Q	I	D	G	N	F	G	N	T	S	G	V	D	E	M	L	L
Template Known Secondary structure		.	.	.		S	B		T	T			B	B	S	S	S	B		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780