Job Description P42592 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 563 % Identity 17% Template c2cqtA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:cellobiose phosphorylase; PDBTitle: crystal structure of cellvibrio gilvus cellobiose phosphorylase2 crystallized from sodium/potassium phosphate Resolution 2.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.		.	.	.	.	150			.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.															.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.						.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.						.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	G	A	L	V	Q	K	L	T	A	K	D	V	Q	V	E	M	T	L	R	F	A	T	P	R	T	S	L	L	E	.	T	K	I	T	S	.	.	N	K	P	L	D	L	V	W	D	G	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	K	L	E	A	K	E	G	K	P	L	S	D	K	T
Query Conservation																																.						.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.						.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	Y	S	R	I	T	G	E	R	N	G	L	K	V	E	T	L	F	F	V	P	L	G	E	N	A	E	V	Q	K	V	T	V	T	N	T	S	D	A	P	K	T	A	T	L	F	S	F	V	E	F	C	L	W	N	A	Q	D	D	Q	T	N	Y	Q	R	N	L	S	I	G	E	V	E	V	E	Q	D	G	P
Template Known Secondary structure		S	S									T	T											T	T		S												S	S	S																												T	T	T							T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	G	E	Y	P	D	Y	Q	R	K	I	S	A	T	R	D	G	L	K	V	T	F	G	K	V	R	A	T	W	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	T	S	G	E	S	E	Y	Q	V	H	K	S	L	P	V	Q	T	E	I	N	G	N	R	F	T	S	K	A	H	I
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.
Template Sequence		H	G	S	A	I	Y	H	K	T	E	Y	R	E	R	R	D	H	Y	A	V	F	G	V	N	T	R	A	D	G	F	D	T	D	R	D	T	F	V	G	A	Y	N	S	L	G	E	A	S	V	P	R	A	G	K	S	A	D	S	V	A	S	G	W	Y	P	I	G	S	.	.	.	H	S	V	A	V	T	L	Q	P
Template Known Secondary structure		S	S							T	T	T	T	T	T										S	S			S												T	T			G	G	G							T	S				B				S	S						.	.	.									T
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.
Template SS confidence
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.				.	250	.	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.											.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.			.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Query Sequence		N	G	S	T	T	L	Y	T	T	Y	S	H	L	L	T	A	Q	E	V	S	K	E	Q	M	Q	I	R	D	I	L	A	R	P	A	F	Y	L	T	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	R	W	E	E	Y	L	K	K	G	L	T	N	P	D	.	.	A	T	P	E	Q	T	R	V	A	V	K	A
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	E	S	R	D	L	V	Y	V	L	G	Y	L	E	N	P	D	E	E	K	W	A	D	D	A	H	Q	V	V	N	K	A	P	A	H	A	L	L	G	R	F	A	T	S	E	Q	V	D	A	A	L	E	A	L	N	S	Y	W	T	N	L	L	S	T	Y	S	V	S	S	T	D	E	.	.	.	.	.	.	.	K
Template Known Secondary structure		T																G	G	G	S	B	S	S	T	T	S		S	B												T	S	S																			T	T	S						S			.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.								330
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	E	T	L	N	G	N	W	R	S	P	G	G	A	V	K	F	N	T	V	T	P	S	V	T	G	R	W	F	S	G	N	Q	T	W	P	W	D	T	W	K	Q	A	F	A	M	A	H	F	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V
Query Conservation
Alig confidence																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	R	M	V	N	I	W	N	Q	Y	Q	C	M	V	T	F	N	M	S	R	S	A	S	F	F	E	T	G	I	G	R	G	M	G	F	R	D	S	N	Q	D	L	L	G	F	V	H	L	I	P	E	R	A	R	E	R	I	I	D	I	A	S	T	Q	F	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	A
Template Known Secondary structure								T													T	T	S	B	S	S	S	S	B	S	S	S														T	T	T	T	T														T	T	B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.										.	400	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.														.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	W	V	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation																						.	.	.																																																									.
Template Sequence		Y	H	Q	Y	Q	P	L	T	K	R	G	N	N	D	I	G	S	G	F	N	.	.	.	D	D	P	L	W	L	I	A	G	V	A	A	Y	I	K	E	S	G	D	W	G	I	L	D	E	P	V	P	F	D	N	E	P	G	S	E	V	P	L	F	E	H	L	T	R	S	F	Q	F	T	V	Q	N	R	G	P	.
Template Known Secondary structure			S				T	T	T	T					T	T		S		B	T	.	.	.	T																			G	G	G	G	G	S				S	T	T		T	T																		T		B		T	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.																																																									.
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.				.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q
Query Conservation
Alig confidence		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	H	G	L	P	L	I	G	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	W	N	D	C	L	N	L	N	C	F	S	T	T	P	G	E	S	F
Template Known Secondary structure		.	T	S	S	B	B		B	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	T	T			T	T						T	T	S		T
Template Predicted Secondary structure		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			478	.	480	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
		537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	T	T	E	N	Q	A	G	G	V	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	F	I	A	A	Q	F	V	L	Y	G	A	E	Y	A	T	L	A	E	R	R	G	L	A	D	V	A	T	E	A	R	K	Y	V	D	E	V	R	A	A	V	L	E
Template Known Secondary structure		T	T	S				S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
		617	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.								.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	M	F	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D	V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G	C	A	G	K	P	I	V	E	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	L	F	N	G	A	A	T	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	N	A	D	A	V	V	K	V	M	L	D	P	K	E	F	N	T	F	V	P	L	G	T
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation																													.	.	.	.																																					.	.
Template Sequence		H	G	W	D	G	Q	W	F	L	R	A	Y	D	Y	Y	G	N	P	V	G	T	D	A	K	P	E	G	.	.	.	.	K	I	W	I	E	P	Q	G	F	A	V	M	A	G	I	G	V	G	E	G	P	D	D	A	D	A	P	A	V	K	A	L	D	S	V	N	.	.	E	M	L	G	T	P	H	G	L	V	L
Template Known Secondary structure			S	B		S	S	S	B						T	T	S				S		T	T	S	S	S	S	.	.	.	.													T	T	T	T			S		T	T		T	T	S											.	.						T	T				S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.																																					.	.
Template SS confidence
		562	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.					.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.			.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
		690	.	.	.											.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	A	F	G	A	D	I	Y	W	R	G	R	V	W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R	Y	G	Y	R	D	D	A	L	K	L	A	D	T	F	F	R	H	A	K	G	L	T	A	D	G	P	I	Q	E	N	Y	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	Y	P	A	Y	T	T	Y	Q	I	E	L	G	E	V	S	T	Y	P	P	G	Y	K	E	N	G	G	I	F	C	H	N	N	P	W	V	I	I	A	E	T	V	V	G	R	G	A	Q	A	F	D	Y	Y	K	R	I	T	P	A	Y	R	E	D	I	S	D	T	H	K	L	E	P	Y	V	Y	A	Q	M	I	A
Template Known Secondary structure				S			S	S			T	T	T	T	T	G	G	G	S		T	T	B	T	T	B	T	S			G	G	G												T																		G	G	G						S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		636	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.
					753	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	N	P	L	T	G	A	Q	Q	G	A	P	N	F	S	W	S	A	A	H	L	Y	M	L	Y	N	D	F	F	R	K	Q
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	K	E	A	V	R	A	G	E	A	K	N	S	W	L	T	G	T	A	A	W	N	F	V	A	V	S	Q	Y	L	L	G	V	R
Template Known Secondary structure			T	T	S	T	T	T	T						S		S													T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		716	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.