Job Description P42592 Confidence 99.71% Date Thu Jan 5 12:01:39 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 516 % Identity 19% Template c1ug9A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glucodextranase; PDBTitle: crystal structure of glucodextranase from arthrobacter globiformis i42 Resolution 2.50 Å

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		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140				.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.					.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.						.	.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.														.	.	.	.																									.	.	.	.	.								.
Query SS confidence																									.	.	.														.	.	.	.																									.	.	.	.	.								.
Query Sequence		A	L	V	Q	K	L	T	A	K	D	V	Q	V	E	M	T	L	R	F	A	T	P	R	.	.	.	T	S	L	L	E	T	K	I	T	S	N	K	P	.	.	.	.	L	D	L	V	W	D	G	E	L	L	E	K	L	E	A	K	E	G	K	P	L	S	D	K	.	.	.	.	.	T	I	A	G	E	Y	P	.
Query Conservation																									.	.	.														.	.	.	.																									.	.	.	.	.								.
Alig confidence																									.	.	.														.	.	.	.																									.	.	.	.	.								.
Template Conservation
Template Sequence		S	Y	R	Q	T	T	T	D	N	A	G	R	W	R	L	T	K	T	Y	V	T	D	P	R	R	S	T	V	M	L	G	V	T	F	E	V	L	D	G	G	D	Y	Q	L	F	V	L	S	D	P	S	L	A	G	T	S	G	G	D	T	G	S	V	T	D	G	A	L	L	A	S	D	L	A	D	A	A	T	P	V
Template Known Secondary structure										T	T	S	S											T	T	S	S												S	S													G	G	G		S	S	S							T	T										S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.				.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.			.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.																										.	.
Query SS confidence																																		.	.	.																										.	.
Query Sequence		D	Y	Q	R	K	I	S	A	T	R	D	G	L	K	V	T	F	G	K	V	R	A	T	W	D	L	L	T	S	G	E	S	.	.	.	E	Y	Q	V	H	K	S	L	P	V	Q	T	E	I	N	G	N	R	F	T	S	K	A	H	I	.	.	N	G	S	T	T	L	Y	T	T	Y	S	H	L	L	T	A	Q	E
Query Conservation																																		.	.	.																										.	.
Alig confidence																																		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	T	A	L	V	S	S	V	G	F	G	A	V	A	N	G	Y	V	G	T	S	D	G	W	T	D	L	A	A	D	G	R	L	D	N	A	S	A	T	A	G	P	G	N	I	S	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	I	P	L	A	A	G	G	K	T	E	F	S	L	A	L	G	F	G	A	D	T	A	E
Template Known Secondary structure								T	T			S							T	T	T	T	S									S	S						S						S					.	.	.	.	.	.	.							S	S	S												S	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.								.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.		.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.																																														.
Query SS confidence																																			.																																														.
Query Sequence		V	S	K	E	Q	M	Q	I	R	D	I	L	A	R	P	A	F	Y	L	T	A	S	Q	Q	R	W	E	E	Y	L	K	K	G	.	L	T	N	P	D	A	T	P	E	Q	T	R	V	A	V	K	A	I	E	T	L	N	G	N	W	R	S	P	G	G	A	V	K	F	N	T	V	T	P	S	V	T	G	R	W	.
Query Conservation																																			.																																														.
Alig confidence													.	.																					.																												.	.	.	.															.
Template Conservation													.	.																																																	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	A	T	A	K	A	S	L	G	T	.	.	G	Y	K	K	V	S	K	S	Y	T	G	E	W	K	K	Y	L	N	S	L	D	A	P	A	T	S	L	T	G	A	L	R	T	Q	Y	D	V	S	L	M	T	V	K	S	H	E	D	K	.	.	.	.	T	F	P	G	A	F	I	A	S	L	T	I	P	W	G
Template Known Secondary structure													.	.																				S					T	T																			T	B		S	.	.	.	.	S	S	T	T		B		S		S	S		T	T	G
Template Predicted Secondary structure													.	.																																																	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.					300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		338	.	340	.	.										.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query Sequence		F	S	G	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	W	P	W	D	T	W	K	Q	A	F	A	M	.	A	H	F	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	Q	I	Q	P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																							.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	A	S	A	E	T	H	R	E	G	Y	H	A	V	W	A	R	D	M	Y	Q	S	V	T	A	L	L	A	A	G	D	E	E	A	A	A	R	G	V	E	W	L	F	T	Y	Q	Q	Q	P	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	H	F	P	Q	T	S	R	V	D	G	T	I	G	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	S	B		S	S				T	T		S	B																T																T			T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S				S		B		T	T			B		.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.									.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430		.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.
Query SS confidence																									.
Query Sequence		W	N	E	R	N	T	K	P	S	L	A	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	.	D	K	T	W	V	A	E	M	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L	R	N	R	D	H	N	G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D
Query Conservation																									.
Alig confidence					.	.																			.									.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.																												.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	N	G	.	.	I	Q	L	D	E	T	A	F	P	I	L	L	A	N	Q	I	G	R	T	D	A	G	F	Y	R	N	E	.	.	.	L	K	P	A	A	D	Y	L	V	A	A	G	P	K	T	P	Q	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					.	.			T														T										T	.	.	.													S		B	S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.																												.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		380	.	.			.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.				410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520			.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.
Query SS confidence																																				.	.
Query Sequence		K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	.	.	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G	F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L
Query Conservation																																				.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	E	E	T	G	G	Y	S	T	S	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S			B							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		565	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.						620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.
Query Sequence		L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q	Q	L	A	D	Y	I	N	T	C	M	F	.	.	.	.	.	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D	V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	Q	I	A	A	L	A	A	A	A	D	I	A	G	K	N	G	D	A	G	S	A	A	V	Y	R	A	T	A	D	E	W	Q	R	S	T	E	K	W	M	F	T	T	N	G	P	V	G	D	G	K	Y	Y	L	R	I	S	A	T	G	N	P	N	D	G	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T																	T	T								S	S		S	S	T	T	S					S			S	S	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
		640	.	.	.	.	.	.	.									.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.				.	700	.	.	.					.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.						.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.						.	.	.	.
Query Sequence		C	A	G	K	P	I	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	L	F	N	G	A	A	T	Q	A	N	A	D	A	V	V	K	V	M	L	D	P	K	E	F	N	T	F	V	P	L	G	T	A	A	L	T	N	P	A	F	G	.	.	.	A	D	I	Y	W	.	.	.	.	R
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.						.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	R	D	W	G	N	G	A	G	V	H	P	E	N	A	V	L	D	G	G	F	L	E	F	V	R	L	G	V	K	A	P	A	D	P	Y	V	A	D	S	L	A	E	T	D	A	S	I	S	Q	E	T	P	G	G	R	M	W	H	R	Y	T	Y	D	G	Y	G	E	K	A	D	G	S	P	W	D	G	T	G	I
Template Known Secondary structure						S	T	T						G	G	G			B	G	G	G	G					T	T	S	S		T	T																				T	T						S	B	T	T				S			T	T	S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
		705	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.		.	.	.	.	.	.	750	.	.											.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	R	V	W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R	Y	G	Y	R	D	D	A	L	K	L	A	D	T	F	F	R	H	A	K	G	L	T	.	A	D	G	P	I	Q	E	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	L	T	G	A	Q	Q	G	A	P	N	F	S	W	S	A	A	H	L	Y
Query Conservation																																									.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.													.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	R	L	W	P	L	L	S	G	E	R	G	E	Y	A	L	A	N	G	Q	D	.	.	.	.	.	.	A	L	P	Y	L	E	T	M	H	S	A	A	N	A	G	Y	M	I	P	E	Q	V	W	D	R	D	E	P	T	S	Y	G	H	E	L	G	R	S	T	G	S	A	S	P	L	S	W	A	M	A	Q	Y	V
Template Known Secondary structure				B		T													T	T			.	.	.	.	.	.											T			T	T					S		B				S	S			S	S				T	T	S	B		S	S		B
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		588	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.							.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
		774	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	Y	N	D	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	L	A	A	G	V
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		662	.	.	.	.	.