Job Description P77213 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:26:23 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 358 % Identity 18% Template c3nztA_ PDB info PDB header:ligase Chain: A: PDB Molecule:glutamate--cysteine ligase; PDBTitle: 2.0 angstrom crystal structure of glutamate--cysteine ligase (gsha)2 ftom francisella tularensis in complex with amp Resolution 2.00 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	H	V	S	E	P	F	T	L	G	I	E	L	E	M	Q	V	V	N	P	P	G	Y	D	L	S	Q	D	S	S	M	L	I	D	A	V	K	N	K	I	T	A	G	E	V	K	H	D	I	T	E	S	M	L	E	L	A	T	D	V	C	R	D	I	N	Q	A	A	G	Q	F	S	A	M	Q	K	V	V	L
Query Conservation
Alig confidence											.													.										.	.
Template Conservation											.													.										.	.
Template Sequence		D	F	K	K	I	N	N	L	R	.	G	I	E	R	E	T	L	R	V	T	D	C	.	G	N	L	A	T	S	N	H	P	.	.	D	G	L	G	H	K	L	T	N	N	S	I	T	V	D	F	S	E	N	L	L	E	L	I	T	K	P	H	D	S	I	D	K	A	I	G	E	L	Y	Q	L	S	A	F	T	L
Template Known Secondary structure				S	S						.											T	T	.	S		B			S		S		.	.	G	G	G			T	T	T		S	S				S	S	B	T	T									B	S	S
Template Predicted Secondary structure											.													.										.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.		.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.		.	.	.	.	.	.	30	.	.			.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.										.	.	.	.	.	.		.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	A	A	T	D	H	H	L	E	I	C	G	G	G	T	H	P	F	Q	K	W	Q	R	Q	E	V	C	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	R	Y	Q	R	.	T	L	E	N	F	G	Y	L	I	Q	Q	A	T	V	F	G	Q	H	V	H	V	G	C	A	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.							.								.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.																																														.	.
Template Sequence		D	N	M	H	S	.	D	E	I	I	L	N	T	S	M	P	L	S	A	N	D	N	D	I	Q	E	A	D	F	G	S	S	N	S	G	R	M	K	R	V	Y	R	K	G	L	S	A	R	Y	G	K	.	.	I	M	Q	I	I	S	G	I	H	Y	N	F	S	F	D	K	D	L	I	S	N	I	A	T	N	K	Q
Template Known Secondary structure				S		T	.	T						S	S	S			S			G	G	G			B					S	S																			S	.	.	G	G	G	G			B																				T
Template Predicted Secondary structure							.																																														.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.		.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.			.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
						145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.						170	.	.	.	.	.	.	.	.	.														180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																										.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																										.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	D	D	A	I	Y	L	L	H	G	L	S	R	F	V	P	H	F	I	A	L	S	A	A	S	P	.	.	.	.	.	Y	M	Q	G	T	D	T	R	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	R	P	N	I	F	S	A	F	P	D	N	G	P	M	P	W	V	S	N	W	Q
Query Conservation		.	.	.	.																										.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																										.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	S	I	S	D	I	Y	F	D	V	L	N	N	Y	F	E	F	M	W	L	L	P	Y	L	F	G	A	S	P	I	C	A	K	T	S	V	K	N	K	P	D	Y	L	S	V	L	D	D	K	F	Y	V	G	E	Y	A	T	S	L	R	M	S	D	L	G	S	P	A	Q	K	D	L	A	I	S	Y	D	N	V	K
Template Known Secondary structure																			T	T									B					G	G	G		S	S			T	T					S	S	S					T	T		S	B	G	G	G	S	S								T						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.																.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	E	A	L	F	R	C	L	S	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	M	I	D	S	I	K	D	L	H	W	D	I	R	P	S	P	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	T	V	E	V	R	V	M	D	T	P	L
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	Y	V	K	D	L	I	Q	A	T	D	D	T	F	A	D	Y	K	R	I	G	L	Y	N	S	Q	G	Q	R	I	Q	L	N	D	G	I	L	Q	I	E	N	E	Y	Y	S	A	I	R	P	K	Q	I	A	K	R	G	E	R	P	A	C	A	L	Y	N	R	G	V	E	Y	V	E	V	R	V	L	D	V	D	P
Template Known Secondary structure													S	B									S	B		T	T	S		B			S		S	B	S		S	S	G	G	G				S									T	T	S																				B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		246	.	.	.	250	.			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.			.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure								.	.																																																.	.
Query SS confidence								.	.																																																.	.
Query Sequence		T	L	S	H	A	V	.	.	N	M	A	G	L	I	Q	A	T	A	H	W	L	L	T	E	R	P	F	K	H	Q	E	K	D	Y	L	L	Y	K	F	N	R	F	Q	A	C	R	Y	G	L	E	G	V	I	T	D	.	.	P	H	T	G	D	R	R	P	L	T	E	D	T	L	R	L	L	E	K	I	A	P	S
Query Conservation								.	.																																																.	.
Alig confidence								.	.																																																.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	E	P	V	G	I	S	K	D	T	A	L	F	V	E	V	M	L	M	T	C	L	D	K	D	A	K	K	Y	H	K	D	I	I	K	Q	A	K	Q	N	L	T	A	V	A	I	Q	G	R	N	P	Q	L	K	L	K	K	L	D	D	D	S	E	I	L	L	K	D	Y	A	L	E	L	F	D	E	I	E	A	V
Template Known Secondary structure		T	S	T	T	S																			S																								T	T		T	T						T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.			.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.		.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure							.	.																	.
Query SS confidence							.	.																	.
Query Sequence		A	H	K	I	G	.	.	A	S	S	A	I	E	A	L	H	R	Q	V	V	S	G	L	.	N	E	A	Q	L	M	R	D	F	V	A	D	G	G	S	L	I	G	L	V	K	K	H	C	E	I	W	A
Query Conservation							.	.																	.
Alig confidence							.	.																	.															.
Template Conservation																																								.
Template Sequence		A	K	K	M	P	K	E	Y	L	D	A	V	E	I	Q	K	R	K	V	L	D	I	S	Q	T	P	S	A	K	I	I	E	L	A	R	Q	H	G	.	Y	K	K	F	I	L	D	I	S	R	R	V	S
Template Known Secondary structure			T	T	S																		G	G	G	S														.
Template Predicted Secondary structure																																								.
Template SS confidence
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.