Job Description P02943 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:57:48 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 381 % Identity 29% Template d1a0tp_ SCOP info Transmembrane beta-barrels Porins Maltoporin-like Resolution 2.40

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		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.						.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	D	F	H	G	Y	A	R	S	G	I	G	W	T	G	S	G	.	.	.	.	.	G	E	Q	Q	C	F	Q	T	T	G	A	Q	S	K	Y	R	L	G	N	E	C	E	T	Y	A	E	L	K	L	G	Q	E	V	W	K	E	G	D	K	S	F	Y	F	D	T	N	V	A	Y	S	V	A	Q	Q	N	D	W
Query Conservation																				.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	E	F	H	G	Y	A	R	S	G	V	I	M	N	D	S	G	A	S	T	K	S	G	A	Y	I	T	P	A	G	E	T	G	G	A	I	G	R	L	G	N	Q	A	D	T	Y	V	E	M	N	L	E	H	K	Q	T	L	D	N	G	A	T	T	R	F	K	V	M	V	A	D	G	Q	T	S	Y	N	D	W
Template Known Secondary structure																	T	T	S	S						T	T		S	G	G	G	G	G	T						T	T				S														T	T	S																	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
				100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120				.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.		.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																						.	.	.																.
Query SS confidence		.	.																						.	.	.																.
Query Sequence		.	.	E	A	T	D	P	A	F	R	E	A	N	V	Q	G	K	N	L	I	E	W	L	.	.	.	P	G	S	T	I	W	A	G	K	R	F	Y	Q	R	H	.	D	V	H	M	I	D	F	Y	Y	W	D	I	S	G	P	G	A	G	L	E	N	I	D	V	G	F	G	K	L	S	L	A	A	T	R	S	S	E
Query Conservation		.	.																						.	.	.																.
Alig confidence		.	.																						.	.	.																.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	S	T	S	D	L	N	V	R	Q	A	F	V	E	L	G	N	L	P	T	F	A	G	P	F	K	G	S	T	L	W	A	G	K	R	F	D	R	D	N	F	D	I	H	W	I	D	S	D	V	V	F	L	A	G	T	G	G	G	I	Y	D	V	K	W	N	D	G	L	R	S	N	F	S	L	Y	G	R	N
Template Known Secondary structure			G	G	G														S		T	T			G	G	G	T	T											T	T					G	G	G	T					B														T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.							.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	G	S	S	S	F	A	S	N	N	I	Y	D	Y	T	N	E	T	A	N	D	V	F	D	V	R	L	A	Q	M	E	I	N	P	G	G	T	L	E	L	G	V	D	Y	G	R	A	N	L	R	D	N	Y	R	L	V	D	.	.	.	.	.	.	G	A	S	K	D	G	W	L	F	T	A	E	H	T	Q	S
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	D	D	S	S	N	S	V	Q	N	Y	I	L	T	M	N	H	F	A	G	P	.	.	.	.	.	.	L	Q	M	M	V	S	G	L	R	A	K	D	N	D	E	R	K	D	S	N	G	N	L	A	K	G	D	A	A	N	T	G	V	H	A	L	L	G	L	H	N	D
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.		T	T		G	G	G														T	T	.	.	.	.	.	.											T	T	G	G	G		B		S	S	S	S	B	S		S	S			S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		232	.									.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.							.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
						248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																																											.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																																																											.	.
Query Sequence		.	.	.	.	V	L	K	G	F	N	K	F	V	V	Q	Y	A	T	D	S	M	T	S	Q	G	K	G	L	S	Q	G	S	G	V	A	F	D	N	E	K	F	A	Y	N	I	N	N	N	G	H	M	L	R	I	L	D	H	G	A	I	S	M	G	D	N	W	D	M	M	Y	V	G	M	Y	Q	D	I	N	.	.
Query Conservation		.	.	.	.																																																																											.	.
Alig confidence		.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	F	Y	G	L	R	D	G	S	S	K	T	A	L	L	Y	G	H	G	L	G	A	E	V	K	G	I	G	S	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	R	P	G	A	D	T	W	R	I	A	S	Y	G	T	T	P	L	S	E	N	W	S	V	A	P	A	M	L	A	Q	R	S	K	D	R
Template Known Secondary structure			S	T	T	S	S														T	T		S		S	B	T	T			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			T	T														S	S	S	S														S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.													.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.							360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380			.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.																						.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.																						.	.
Query Sequence		W	D	N	D	N	G	T	K	W	W	T	V	G	I	R	P	M	Y	K	W	T	P	I	M	S	T	V	M	E	I	G	Y	D	N	V	E	S	Q	.	.	.	.	.	.	R	T	G	D	K	N	N	Q	Y	K	I	T	L	A	Q	Q	W	Q	A	G	D	.	.	S	I	W	S	R	P	A	I	R	V	F	A	T
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.																						.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	D	G	D	S	Y	Q	W	A	T	F	N	L	R	L	I	Q	A	I	N	Q	N	F	A	L	A	Y	E	G	S	Y	Q	Y	M	D	L	K	P	E	G	Y	N	D	R	Q	A	V	N	G	S	F	Y	K	L	T	F	A	P	T	F	K	V	G	S	I	G	D	F	F	S	R	P	E	I	R	F	Y	T	S
Template Known Secondary structure		S	S	T	T																S	S	S	S																	T	T	G	G	G																			S	S		T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	A	K	W	D	E	K	W	G	Y	D	Y	T	G	N	A	D	N	N	A	N	F	G	K	A	V	P	A	D	F	N	G	G	S	F	G	R	G	D	S	D	E	W	T	F	G	A	Q	M	E	I	W	W
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	M	D	W	S	K	K	L	N	N	Y	A	S	D	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	S	D	G	F	N	S	G	G	E	W	S	F	G	V	Q	M	E	T	W	F
Template Known Secondary structure							G	G	G	G	G	S		S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	B	T	T	B		S	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.																.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.