Job Description P77154 Confidence 97.46% Date Thu Jan 5 12:25:42 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 295 % Identity 15% Template d2jg0a1 SCOP info alpha/alpha toroid Six-hairpin glycosidases Trehalase-like Resolution 1.50

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		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.			.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.
Query SS confidence																																																					.	.
Query Sequence		G	E	G	Y	K	G	H	V	F	W	D	T	E	V	F	L	L	P	F	H	L	F	S	D	P	T	V	A	R	S	L	L	R	Y	R	W	H	N	L	P	G	A	Q	E	K	A	R	R	N	G	W	.	.	Q	G	A	L	F	P	W	E	S	A	R	S	G	E	E	E	T	P	E	F	A	A	I	N	I	R	T
Query Conservation																																																					.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.					.	.			.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	R	F	R	E	V	Y	Y	W	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	G	H	W	D	K	V	A	D	M	V	A	N	F	A	H	E	I	D	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	G	H	I	P	N	G	.	.	.	.	N	R	S	Y	Y	L	S	R	S	Q	P	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		B	T	T	B		S		B														T	T																		.	.	.	.	.	.	.			S	S			S	B	.	.	.	.	S	B	G	G	G	T	T				S			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.								190	.	.	.	.	.	.	.					.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	L	R	Q	K	V	A	S	A	Q	A	E	H	H	L	V	A	D	I	A	W	A	V	I	Q	Y	W	Q	T	T	G	D	E	S	F	I	A	H	E	G	M	A	L	L	L	E	T	A	K	F	W	I	S	R	A	V	R	V	N	D	R	L	E	I	H	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.							.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.							.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	L	M	V	E	L	L	A	Q	H	E	G	D	.	A	A	L	K	Q	Y	.	L	P	Q	M	Q	K	E	Y	A	Y	W	M	D	G	V	E	N	L	Q	A	G	Q	Q	E	K	R	V	V	K	L	Q	D	G	T	L	L	N	R	Y	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T		.							.												T	T	T		T	T			T	T				T	T					T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.							.
Template SS confidence
																				211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230		.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
																																								469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.														.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	P	D	E	Y	T	E	H	V	N	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	T	S	Y	M	A	R	Y	N	V	Q	Q	A	L	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	D	R	D	T	P	R	P	E	S	W	V	E	D	I	A	T	A	K	S	N	P	N	R	P	A	T	E	I	Y	R	D	L	R	S	A	A	A	S	G	W	D	F	S	S	R	W	M	D	N	P	Q	Q	L	N	T	L	R	T	T	S	I	V	P	V	D	L	N	S	L	M	F	K	M	E	K	I	L	A	R
Template Known Secondary structure			S			S			G	G	G										T		T	T	S															T	T			S		G	G	G	B	S	S	T	T		G	G	G	B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	R	Q	F	G	C	S	D	D	A	F	I	H	R	A	E	M	F	L	K	E	L	W	M	P	E	I	Q	P	D	G	V	L	P	Q	D	D	S	F	M	A	K	P	A	I	N	L	A	K	Y	K	A	A	A	G	K	Q	T	I	L	L	D	Y	S	R	A	E	V	N	E	M	Q	I	L	K	Q	A	D	V
Query Conservation
Alig confidence								.	.																		.																								.	.
Template Conservation								.	.																		.																								.	.
Template Sequence		A	S	K	A	A	G	.	.	D	N	A	M	A	N	Q	Y	E	T	L	A	N	A	R	Q	K	.	G	I	E	K	Y	L	W	N	D	Q	Q	G	W	Y	A	D	Y	D	L	K	S	H	K	.	.	V	R	N	Q	L	T	A	A	A	L	F	P	L	Y	V	N	A	A	A	K	D	R	A	N	K	M	A	T	A
Template Known Secondary structure							T	.	.																		.						S			T	T	T	T							T	T	T	T		.	.						B	G	G	G	G					T	T		S
Template Predicted Secondary structure								.	.																		.																								.	.
Template SS confidence
		351	.	.	.	.	.			.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.		.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.			.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.		.	610	.	.	.	.	.	.	.	.			.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.											.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.											.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	M	L	N	Y	M	L	P	E	Q	F	S	A	A	S	C	L	A	N	L	Q	F	Y	E	P	R	T	I	H	D	S	.	S	L	S	K	A	I	H	G	I	V	.	.	A	A	R	C	G	L	L	T	Q	S	Y	Q	F	W	R	E	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	D
Query Conservation																																	.											.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.				.											.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	K	T	H	L	L	Q	P	G	G	L	N	T	T	S	V	K	S	G	Q	Q	W	.	.	.	.	.	.	D	A	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	V	A	T	E	G	L	Q	N	Y	G	Q	K	E	V	A	M	D	I	S	W	H	F	L	T	N	V	Q	H	T	Y	D	R	E	K	K	L	V	E	K	Y	D
Template Known Secondary structure						T			T	T				S	B	S				S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	S	T	T																T	T	T																								S	S		B	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.							.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650						.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.
Query Sequence		L	G	A	D	P	H	S	C	D	D	G	.	.	.	.	.	I	H	A	A	A	T	G	A	I	W	L	G	A	I	Q	G	F	A
Query Conservation													.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	S	T	T	G	T	G	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	T	L	K	M	L	D	L	I	C
Template Known Secondary structure		T	T	S	S	S		B				S	S	S				B	S																S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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