Job Description P77154 Confidence 99.13% Date Thu Jan 5 12:25:42 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 555 % Identity 11% Template c3c67B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:uncharacterized protein ygjk; PDBTitle: escherichia coli k12 ygjk in a complexed with glucose Resolution 1.90 Å

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.							.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	V	V	G	M	E	I	A	I	N	G	E	V	F	S	L	S	H	.	.	.	.	.	.	E	A	W	Q	R	E	L	D	F	A	S	G	E	L	R	R	N	V	V	W	R	T	S	N	G	S	G	Y	T	I	A	S	R	R	F	V	S	A	D	Q	L	P	L	I	A	L	E	I	T	I	T	P	L	D	A	D
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.																									.	.	.														.	.	.	.	.	.	.			.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.			.	.	.
Template Sequence		N	F	D	R	L	T	V	W	Q	D	G	K	K	V	D	F	T	L	E	A	Y	S	I	P	G	A	L	V	Q	K	L	T	A	K	D	V	Q	V	E	M	T	L	R	F	A	T	P	R	.	.	.	T	S	L	L	E	T	K	I	T	S	N	K	P	.	.	.	.	.	.	.	L	D	.	.	.	L	V	W	D
Template Known Secondary structure											T	T													T	T									S	S												T	T	.	.	.											S	S		.	.	.	.	.	.	.			.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.			.	.	.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.				.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130								.	.				.	.	.	.
		144	.	.					.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.
Query Sequence		A	S	V	.	.	.	.	L	I	S	T	G	I	D	A	T	Q	T	N	H	G	R	Q	H	L	D	E	T	Q	V	R	V	F	G	Q	H	L	M	Q	G	S	Y	T	T	Q	D	G	R	S	D	V	A	I	S	C	C	C	K	V	S	G	D	V	Q	Q	C	Y	T	A	K	E	R	R	L	L	Q	H	T	S	A
Query Conservation					.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	E	L	L	E	K	L	E	A	K	E	G	K	P	L	S	D	K	T	I	A	G	E	Y	P	D	Y	Q	R	K	I	S	A	T	R	D	G	L	K	V	T	F	G	K	V	R	A	T	W	D	L	L	T	S	G	E	S	E	Y	Q	V	H	K	S	L	P	V	Q	T	E	I	N	G	N	R	F	T	S	K	A
Template Known Secondary structure												T	T			S		S		B						T	T	T								T	T												T	T	T					S									S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	L	H	A	G	E	T	M	T	L	Q	K	L	V	W	I	D	W	R	D	D	R	Q	A	A	L	D	E	W	G	S	A	S	L	R	Q	L	E	M	C	A	Q	Q	S	Y	D	Q	L	L	A	A	S	T	E	N	W	R	Q	W	W	Q	K	R	R	I	T	V	N	G	G	E	A	H	D	Q	Q	A	L	D	Y
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Sequence		H	I	N	G	S	T	T	L	Y	T	T	Y	S	H	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	Q	E	V	S	K	E	Q	M	Q	I	R	D	I	L	A	R	P	A	F	Y	L	T	A	S	Q	Q	R	W	E	E	Y	L	K	K	G	.	L	T	N	P	D	A	T	P	E	Q	T	R	V	A	V	K
Template Known Secondary structure				S	S	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																																					.				T	T	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.											.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.						.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.									.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.									.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	Y	H	L	R	I	M	T	P	A	H	D	E	R	S	S	I	A	A	K	G	L	T	.	G	E	G	Y	K	G	H	V	.	.	.	.	.	F	W	D	T	E	V	F	L	L	P	F	H	L	F	S	D	P	T	V	A	R	S	L	L	R	Y	R	W	H	N	L	P	G	A	Q	E	K	A	R	R	N	G
Query Conservation																										.									.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.					.									.	.	.	.	.				.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.																						.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	I	E	T	L	N	G	N	W	R	S	P	G	G	A	V	K	F	.	.	N	T	V	T	P	S	V	T	G	R	W	F	S	G	N	Q	T	W	P	W	D	.	T	W	K	Q	A	F	A	M	A	H	F	N	P	D	I	A	K	E	N	I	R	A	V	F	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	Q
Template Known Secondary structure									T					B	T	T	B		S	.	.					S		T	T		T	T	T		T	T		B					.									T	T	T														T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.																						.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.			.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.		.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350										.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	Q	G	A	L	F	P	W	E	S	A	R	S	G	E	E	E	T	P	E	F	A	A	I	N	I	R	T	G	L	R	Q	K	V	A	S	A	Q	A	E	H	H	L	V	A	D	I	A	W	A	V	I	Q	Y	W	Q	T	T	G	D	E	S	F	I	A	H	E	G	M	A	L	L	L	E	T	A	K	F	W	I
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.																					.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.																					.
Template Sequence		P	G	D	S	V	R	P	Q	D	V	G	F	V	P	D	L	I	A	W	N	L	S	P	E	R	G	G	D	G	G	N	W	N	E	R	N	T	K	P	S	L	A	.	.	.	.	.	A	W	S	V	M	E	V	Y	N	V	T	Q	D	K	T	W	V	A	E	M	.	Y	P	K	L	V	A	Y	H	D	W	W	L
Template Known Secondary structure		T	T		S	S		G	G	G	T	T				S	B	B		S	S			G	G	G	T	S			S	S		B		S								.	.	.	.	.																					.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.																					.
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.						.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	480
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.
Query Sequence		S	R	A	V	R	V	N	D	R	L	E	I	H	D	V	I	G	P	D	E	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	H	V	N	N	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	N	R	D	H	N	G	N	G	V	P	E	Y	G	A	T	R	D	K	A	H	N	T	E	S	G	E	M	L	F	T	V	K	K	G	D	K	E	E	T	Q	S	G	L	N	N	Y	A	R	V	V	E	K	G	Q	Y	D	S	L	E	I	P	A	Q	V	A	A	S	W	E	S	G	R	D	D	A	A	V	F	G
Template Known Secondary structure				S		T	T		S	S										T	T	T	B		T	T			B							T	T																				S	S															T		T	T		G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
																																												481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	Y	T	S	Y	M	A	R	Y	N	V	Q	Q	A	L	N	I	A	R	Q	F	G	C	S	D	D	A	F	I	H	R	A	E	M	F	L	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																																																																			.	.
Template Sequence		F	I	D	K	E	Q	L	D	K	Y	V	A	N	G	G	K	R	S	D	W	T	V	K	F	A	E	N	R	S	Q	D	G	T	L	L	G	Y	S	L	L	Q	E	S	V	D	Q	A	S	Y	M	Y	S	D	N	H	Y	L	A	E	M	A	T	I	L	G	.	.	K	P	E	E	A	K	R	Y	R	Q	L	A	Q
Template Known Secondary structure														T	T			G	G	G	G										T	T									S																								T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Template SS confidence
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.			.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.									.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	W	M	P	E	I	Q	P	D	G	V	L	P	Q	D	D	S	F	M	A	K	P	A	I	N	L	A	K	Y	K	A	A	A	G	K	Q	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	D	Y	S	R	A	E	V	N	E	M	Q	I	L	K	Q	A	D	V	V	M	L	N	Y	M	L	P	E	Q	F	S	A
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.
Template Sequence		Q	L	A	D	.	Y	I	N	T	C	M	F	D	P	T	T	Q	F	Y	Y	D	V	R	I	E	D	K	P	L	A	N	G	C	A	G	K	P	I	V	E	R	G	K	G	P	E	G	W	S	P	L	F	N	G	A	A	T	Q	A	N	A	D	A	V	V	K	V	M	L	D	P	K	E	F	N	T	F	V	P	L
Template Known Secondary structure						.						S			T	T	T	T									S	S			T	T	S		S	S		B		G	G	G				G	G	G	G					T	T		S													T		T	T	T	T			S	S		S
Template Predicted Secondary structure						.
Template SS confidence
		586	.	.	.		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
		591	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.		.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.			620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.													.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.														.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.														.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	S	C	L	A	N	L	Q	F	Y	E	P	R	T	I	H	.	D	S	S	L	S	K	A	I	H	G	I	V	A	.	.	A	R	C	G	L	L	T	Q	S	Y	Q	F	W	R	E	G	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	L	G	A	D	P	H	S	C	D	D	G	I	H	A	A	A
Query Conservation																		.														.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.														.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	A	A	L	T	N	P	A	F	G	A	D	I	Y	W	R	G	R	V	W	V	D	Q	F	W	F	G	L	K	G	M	E	R	Y	G	Y	R	D	D	A	L	K	L	A	D	T	F	F	R	H	A	K	G	L	T	A	D	G	P	I	Q	E	N	Y	N	P	L	T	G	A	Q	Q	G	A	P	N	F	S	W
Template Known Secondary structure			S	S		T	T		T	T			T	T		T	T	T	T																	T	T																S	T	T	T	T	S	S	S				S				T	T	T					S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.
		656	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	A	I	W	L	G	A	I	Q	G	F	A	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	A	A	H	L	Y	M	L	Y	N	D	F	F	R
Template Known Secondary structure													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		745	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.