Job Description P77154 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:42 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 617 % Identity 14% Template c2cqtA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:cellobiose phosphorylase; PDBTitle: crystal structure of cellvibrio gilvus cellobiose phosphorylase2 crystallized from sodium/potassium phosphate Resolution 2.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.								.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.		.	140
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.																																																						.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.																																																						.
Query Sequence		P	D	V	V	G	M	E	I	A	I	N	G	E	V	F	S	L	.	.	.	.	.	.	.	S	H	E	A	W	Q	R	E	L	D	F	A	S	G	E	L	R	R	N	V	V	W	R	T	S	N	G	S	G	Y	T	I	A	S	R	R	F	V	S	A	D	Q	L	P	L	I	A	L	E	I	T	I	T	.	P	L
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.																																																						.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.																	.	.	.															.										.
Template Conservation																																.	.	.	.																	.	.	.															.
Template Sequence		A	G	G	R	Y	L	Y	V	N	D	G	G	D	V	W	T	P	S	W	L	P	V	K	A	D	L	D	H	F	E	.	.	.	.	A	R	H	G	L	G	Y	S	R	I	T	G	E	R	N	G	.	.	.	L	K	V	E	T	L	F	F	V	P	L	G	E	N	.	A	E	V	Q	K	V	T	V	T	N	T	S
Template Known Secondary structure				B	S							T	T					T	T		T	T	T	T				S				.	.	.	.					S	S									T	T	.	.	.											T	T		S	.												S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.																	.	.	.															.
Template SS confidence
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.					.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.				.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.		.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.								.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	D	A	S	V	L	I	S	T	G	I	D	A	T	Q	T	N	H	G	R	Q	H	L	D	E	.	.	.	.	.	.	.	T	Q	V	R	V	F	G	Q	H	L	M	Q	G	S	Y	T	T	Q	D	G	R	S	D	V	A	I	S	C	C	C	K	V	S	G	D	V	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	A	P	K	T	A	T	L	F	S	F	V	E	F	C	L	W	N	A	Q	D	D	Q	T	N	Y	Q	R	N	L	S	I	G	E	V	E	V	E	Q	D	G	P	H	G	S	A	I	Y	H	K	T	E	Y	R	E	R	R	D	H	Y	A	V	F	G	V	N	T	R	A	D	G	F	D	T	D	R	D	T	F	V
Template Known Secondary structure		S	S																												T	T	T							T	T		S	S	S							T	T	T	T	T	T										S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
																						205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.							.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	Y	T	A	K	E	R	R	L	L	Q	H	T	S	A	Q	L	H	A	G	E	T	M	T	L	Q	K	L	V	W	I	D	W	R	D	D	R	Q	A	A	L	D	.	.	.	.	.	.	E	W	G	S	A	S	L	R	Q	L	E	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	A	Y	N	S	L	G	E	A	S	V	P	R	A	G	K	S	A	D	S	V	A	S	G	W	Y	P	I	G	S	H	S	V	A	V	T	L	Q	P	G	E	S	R	D	L	V	Y	V	L	G	Y	L	E	N	P	D	E	E	K	W	A	D	D	A	H	Q	V	V	N	K	A	P	A	H	A	L	L	G	R	F
Template Known Secondary structure			T	T			G	G	G							T	S				B				S	S														T	T																G	G	G	S	B	S	S	T	T	S		S	B												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	A	Q	Q	S	Y	D	Q	L	L	A	A	S	T	E	N	W	R	Q	W	W	Q	K	R	R	I	T	V	N	G	G	E	A	H	D	Q	Q	A	L	D	Y	A	L	Y	H	L	R	I	M	T	P	A	H	D	E	R	S	S	I	A	A	K	G	L	T	G	E	G	Y	K	G	H	V	F	W	D	T	E	V	F
Query Conservation
Alig confidence																															.	.																													.	.	.	.														.
Template Conservation																															.	.																													.	.	.	.														.
Template Sequence		A	T	S	E	Q	V	D	A	A	L	E	A	L	N	S	Y	W	T	N	L	L	S	T	Y	S	V	S	S	T	.	.	D	E	K	L	D	R	M	V	N	I	W	N	Q	Y	Q	C	M	V	T	F	N	M	S	R	S	A	S	F	.	.	.	.	F	E	T	G	I	G	R	G	M	G	F	R	D	.	S	N	Q
Template Known Secondary structure		S	S																			T	T	S						S	.	.										T													T	T	S	B	S	S	.	.	.	.	S	S	B	S	S	S								.
Template Predicted Secondary structure																															.	.																													.	.	.	.														.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.			.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.					.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	370	.
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	P	F	H	L	F	S	D	P	T	V	A	R	S	L	L	R	Y	R	W	H	N	L	P	G	A	Q	E	K	A	R	R	N	G	W	Q	G	A	L	F	P	W	E	S	A	R	S	G	E	E	E	T	P	E	F	A	A	I	N	I	R	T	G	L	R	Q	K	V	A	S	A	Q	A	E	H	H	L	V	A
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	L	G	F	V	H	L	I	P	E	R	A	R	E	R	I	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	S	T	Q	F	A	D	G	S	A	Y	H	Q	Y	Q	P	L	T	K	R	G	N	N	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	G	F	N	D	D	P	L
Template Known Secondary structure					T	T	T	T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	B		T	T	S		B		S				T	T	T	T					T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		B	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390											.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	420	.	.	.	.	.
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.													.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	I	A	W	A	V	I	Q	Y	W	Q	T	T	G	D	E	S	F	I	A	H	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	A	L	L	L	E	T	A	K	F	W	I	S	R	A	V	R	V	N	D	R	L	E	I	H	D	V	I	G	P	D	E	Y	T	E	H	V	N	N	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.
Template Sequence		W	L	I	A	G	V	A	A	Y	I	K	E	S	G	D	W	G	I	L	D	E	P	V	P	F	D	N	E	P	G	S	E	V	P	L	F	E	H	L	T	R	S	F	Q	F	T	V	Q	N	R	G	P	H	G	.	.	.	.	.	L	P	L	I	G	R	A	D	W	N	D	C	L	N	L	N	C	F	S	T	T
Template Known Secondary structure																	G	G	G	G	G	S				S	T	T		T	T																		T		B		T	T	S	.	.	.	.	.	S	B	B		B	T		S	S	S	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.
Template SS confidence
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.						480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
																			481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.			.	.	.	.	.	540	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	Y	T	S	Y	M	A	R	Y	N	V	Q	Q	A	L	N	I	A	R	Q	F	G	C	S	D	D	A	F	I	H	R	A	E	M	F	L	K	E	L	W	M	P	E	I	Q	P	D	G	V	L	P	Q	D	.	.	D	S	F	M	A	K	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																		.												.	.
Template Conservation																																										.	.																		.
Template Sequence		P	G	E	S	F	Q	T	T	E	N	Q	A	G	G	V	A	E	S	V	F	I	A	A	Q	F	V	L	Y	G	A	E	Y	A	T	L	A	E	R	R	G	.	.	L	A	D	V	A	T	E	A	R	K	Y	V	D	E	V	R	A	.	A	V	L	E	H	G	W	D	G	Q	W	F	L	R	A	Y	D	Y	Y	G
Template Known Secondary structure		T	T	S		T	T	T	S				S																											T	T	.	.																		.						S	B		S	S	S	B						T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.																		.
Template SS confidence
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540			.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.		.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.										570	.	.	.	.	.	.	.	.												.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	N	L	A	K	Y	K	A	A	A	G	K	Q	T	I	L	L	D	Y	S	R	A	E	V	N	E	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	L	K	Q	A	D	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	L	N	Y	M	L	P	E	Q	F	S	A	A	S	C	L	A	N	L	Q	F	Y	E
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	P	V	G	T	D	A	K	P	E	G	K	I	W	I	E	P	Q	G	F	A	V	M	A	G	I	G	V	G	E	G	P	D	D	A	D	A	P	A	V	K	A	L	D	S	V	N	E	M	L	G	T	P	H	G	L	V	L	Q	Y	P	A	Y	T	T	Y	Q	I	E	L	G	E	V	S	T	Y	P	P	G	Y
Template Known Secondary structure					S		T	T	S	S	S	S													T	T	T	T			S		T	T		T	T	S																T	T				S			S			S	S			T	T	T	T	T	G	G	G	S		T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.
		602	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query Sequence		P	R	T	I	H	D	S	S	L	S	K	A	I	H	G	I	V	A	A	R	C	G	L	L	T	Q	S	Y	Q	F	W	R	E	G	T	E	I	D	L	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	H	S	C	D	D	G	I	H	A	.	.	.	A	A	T	G	A	I
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	N	G	G	I	F	C	H	N	N	P	W	V	I	I	A	E	T	V	V	G	R	G	A	Q	A	F	D	Y	Y	K	R	I	T	P	A	Y	R	E	D	I	S	D	T	H	K	L	E	P	Y	V	Y	A	Q	M	I	A	G	K	E	A	V	R	A	G	E	A	K	N	S	W	L	T	G	T	A	A	W	N
Template Known Secondary structure		T	T	B	T	S			G	G	G												T																		G	G	G						S		T	T	S								T	T	S	T	T	T	T						S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		658	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.
		660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	L	G	A	I	Q	G	F	A	G	V	S	V	R	D	G	E	L	H	L	N	P	A	L	P	E	Q	W	Q	Q	L	S	F	P	L	F	W	Q	G	C	E	L	Q	V	T	L	D	A	Q	R	I	A	I	R	T	S	A	P	V	S	L	R	L	N	G	Q	L	I	T	V	A	E	E	S	V	F	C	L	G	D
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.	.													.	.
Template Conservation																																																					.	.	.													.	.
Template Sequence		F	V	A	V	S	Q	Y	L	L	G	V	R	P	D	Y	D	G	L	V	V	D	P	Q	I	G	P	D	V	P	S	Y	T	V	T	R	V	A	R	G	A	T	Y	E	I	T	V	T	N	S	G	A	.	.	.	P	G	A	R	A	S	L	T	V	D	G	A	.	.	P	V	D	G	R	T	V	P	Y	A	P	A
Template Known Secondary structure								T	T	S						S	S										T	T											T	T													.	.	.	T	T								T	T		.	.			S	T	T							T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.													.	.
Template SS confidence
		738	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.				.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800			.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.