Job Description P77154 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:42 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 573 % Identity 13% Template c1v7wA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:chitobiose phosphorylase; PDBTitle: crystal structure of vibrio proteolyticus chitobiose phosphorylase in2 complex with glcnac Resolution 1.60 Å

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		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.		.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.							.	.	.	.	170	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	R	N	V	V	W	R	T	S	N	G	S	G	Y	T	I	A	S	R	R	F	V	S	A	D	Q	L	P	L	I	A	L	E	I	T	I	T	.	P	L	D	A	D	A	S	V	L	I	S	T	G	I	D	A	T	Q	T	N	H	G	R	Q	H	L	D	.	.	.	.	.	.	E	T	Q	V	R	V	F	G	Q
Query Conservation																																							.																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.															.										.																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.															.
Template Sequence		Y	S	K	F	Q	C	D	Y	N	G	.	.	.	I	H	A	R	K	T	L	F	V	P	K	G	E	D	.	A	E	I	W	D	V	V	I	K	N	T	S	D	Q	V	R	T	I	S	A	F	S	F	V	E	F	S	F	S	H	I	Q	S	D	N	Q	N	H	Q	M	S	L	Y	S	A	G	T	A	Y	R	P	G
Template Known Secondary structure										T	T	.	.	.											T	T	S	S	.												S	S	S											B	B			S	S						S						T	T	S							T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.															.
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.				.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	L	M	Q	G	S	Y	T	T	Q	D	G	R	S	D	V	A	I	S	C	C	C	K	V	S	G	D	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	C	Y	T	A	K	E	R	R	L	L	Q	H	T	S	A	Q	L	H	A	G	E	T	M	T
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	E	Y	D	L	Y	Y	N	T	D	D	F	E	G	F	Y	Y	L	A	S	T	F	D	P	D	S	Y	D	G	Q	R	D	R	F	L	G	L	Y	R	D	E	A	N	P	L	A	V	E	Q	G	R	C	S	N	S	A	Q	T	C	Y	N	H	C	G	S	L	H	K	Q	F	T	L	Q	P	G	E	E	I	R
Template Known Secondary structure								T	T				T	T	T	T							S	S			S												T	T			T	T	S							T	S				B			B	S	S														T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	K	L	V	W	I	D	W	R	D	D	R	Q	A	A	L	D	E	W	G	S	A	S	L	R	Q	L	E	M	C	A	Q	Q	S	Y	D	Q	L	L	A	A	S	T	E	N	W	R	Q	W	W	Q	K	R	R	I	T	V	N	G	G	E	A	H	D	Q	Q	A	L	D	Y	A	L	Y	H	L	R	I	M	T
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Sequence		F	A	Y	I	L	G	I	G	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	E	R	L	R	E	H	Y	Q	D	V	A	N	I	D	A	A	F	A	A	I	K	A	H	W	D	E	R	C	A	K	F	Q	V	K	S	P	.	.	N	Q	G	L	D	T	M	I	N	A	W	T	L	Y	Q	A	E	T	C
Template Known Secondary structure									S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	S																				T	T						S	.	.									T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template SS confidence
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.												.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	H	D	E	R	S	S	I	A	A	K	G	L	T	G	E	G	Y	K	G	H	V	F	W	D	T	E	V	F	L	L	P	F	H	L	F	S	D	P	T	V	A	R	S	L	L	R	Y	R	W	H	N	L	P	G	A	Q	E	K	A	R	R	N	G	W	Q	G	A	L	F	P	W	E	S	A	R	S	G	E
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.										.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.										.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	V	W	S	R	F	A	S	F	I	E	V	G	.	.	.	.	G	R	T	G	L	G	Y	R	D	.	T	A	Q	D	A	I	S	V	P	H	A	N	P	E	M	T	R	K	R	I	V	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	G	Q	V	K	A	G	Y	G	L	H	L	F	D	P	D	W	F	D
Template Known Secondary structure						S	S		S	S	S			S	.	.	.	.	S			S						.					T	T	S		T	T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	B		T	T	S		B		S				G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.										.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.					.	.	.	.	.	.	.	.	350		.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.											.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.											.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	E	T	P	E	F	A	A	I	N	I	R	T	G	L	R	Q	K	V	A	S	A	Q	A	E	H	H	L	V	A	D	I	A	W	A	V	I	Q	Y	W	Q	T	T	G	D	E	S	F	I	A	H	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	A	L	L	L	E	T	A	K	F	W	I	S	R	A	V	R
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.
Template Sequence		P	I	H	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	T	C	S	D	D	H	L	W	L	I	P	T	I	C	K	Y	V	M	E	T	G	E	T	S	F	F	D	Q	M	I	P	Y	A	D	G	G	E	A	S	V	Y	E	H	M	K	A	A	L	D	F	S	A	E	Y	.	V	G
Template Known Secondary structure						G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G		B	S	S	G	G	G	G															G	G	G	G	G						T	T	S																			S	.	B
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.
Template SS confidence
		394	.	.	.	.																	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.		.	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520						.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		V	N	D	R	L	E	I	H	D	V	I	G	P	D	E	Y	T	E	H	V	N	N	N	A	Y	T	S	Y	M	A	R	Y	N	V	Q	Q	A	L	N	I	A	R	Q	F	G	C	S	D	D	A	F	I	H	R	A	E	M	F	L	K	E	L	.	.	.	.	.	W	M	P	E	I	Q	P	D	G	V	L	P	Q
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.
Template Sequence		Q	T	G	I	C	K	G	L	R	A	D	W	N	D	C	L	N	L	G	G	G	E	S	S	M	V	S	F	L	H	F	W	A	L	Q	E	F	I	D	L	A	K	F	L	G	.	.	K	D	Q	D	V	N	T	Y	T	E	M	A	A	N	V	R	E	A	C	E	T	H	L	W	D	D	E	G	G	W	Y	I	R
Template Known Secondary structure		T	T	S		B				T		S	S	S	T	T																														T	.	.																							S			T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.
Template SS confidence
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.			.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.												580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	S	F	M	A	K	P	A	I	N	L	A	K	Y	K	A	A	A	G	K	Q	T	I	L	L	D	Y	S	R	A	E	V	N	E	M	Q	I	L	K	Q	A	D	V	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	Y	M	L	P	E	Q	F	S	A	A	S	C	L	A	N	L	Q	F	Y	E	P
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	T	K	N	G	D	K	I	G	T	A	Q	Q	Q	E	G	R	V	H	L	E	S	N	T	L	A	V	L	S	G	L	A	S	Q	E	R	G	E	Q	A	M	D	A	V	D	E	H	L	F	S	P	Y	G	L	H	L	N	A	P	S	F	S	T	P	N	D	D	I	G	F	V	T	R	V	Y	Q	G	V	K
Template Known Secondary structure					T	T	S				S		T	T		S	S														T	T		S																			T	T				S			S				S			T	T	T		G	G	G	G	S		T	T	B	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		557	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
		603	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	650	.				.	.	.	.	.	.	.	.	660
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Query Sequence		R	T	I	H	D	S	S	L	S	K	A	I	H	G	I	V	A	A	R	C	G	L	L	T	Q	S	Y	Q	F	W	R	E	G	T	E	I	D	L	G	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	H	S	C	D	D	G	I	.	.	.	H	A	A	A	T	G	A	I	W
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	N	G	A	I	F	S	H	P	N	P	W	A	W	V	A	E	T	K	L	G	R	G	D	R	A	M	K	F	Y	D	A	L	N	P	Y	N	Q	N	D	I	I	E	K	R	I	A	E	P	Y	S	Y	V	Q	F	I	M	G	R	D	H	Q	D	H	G	R	A	N	H	P	W	L	T	G	T	S	G	W	A	Y
Template Known Secondary structure		T	B	T	S			S	T	T											T	T														G	G	G	G	T	T							S		T	T	S								T	T	S	T	T	T	T						S	S		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.
		661	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	A	I	Q	G	F	A	G	V	S	V	R	D	G	E	L	H	L	N	P	A	L	P	E	Q	W	Q	Q	L	S	F	P	L	F	W	Q	G	C	E	L	Q	V	T	L	D	A	Q	R	I	A	I	R	T	S	A	P	V	S	L	R	L	N	G	Q	L	I
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.
Template Conservation																																																					.	.
Template Sequence		F	A	V	T	N	Y	I	L	G	V	Q	S	G	F	T	G	L	S	V	D	P	C	I	P	S	D	W	P	G	F	E	V	T	R	Q	W	R	G	A	T	Y	H	I	Q	V	E	N	P	D	H	V	.	.	S	K	G	V	K	S	I	T	L	N	G	A	P	I
Template Known Secondary structure							T	T	S						S	S		B					B			T	T											T	T										T	T			.	.	S	B								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.
Template SS confidence
		717	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.			.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.