Job Description P77154 Confidence 99.45% Date Thu Jan 5 12:25:42 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 391 % Identity 15% Template c1lf6A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glucoamylase; PDBTitle: crystal structure of bacterial glucoamylase Resolution 2.10 Å

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		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.		.	80	.	.	.	.	.	.	.			.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
Predicted Secondary structure																.										.	.
Query SS confidence																.										.	.
Query Sequence		L	V	N	L	P	D	V	V	G	M	E	I	A	I	.	N	G	E	V	F	S	L	S	H	.	.	E	A	W	Q	R	E	L	D	F	A	S	G	E	L	R	R	N	V	V	W	R	T	S	N	G	S	G	Y	T	I	A	S	R	R	F	V	S	A	D	Q	L	P	L	I	A	L	E	I	T	I	T	P	L	D
Query Conservation																.										.	.
Alig confidence																.										.	.																											.											.
Template Conservation																																																						.											.
Template Sequence		T	I	D	T	A	D	V	K	E	I	K	F	I	V	T	D	G	K	S	F	V	P	D	E	T	K	D	A	I	S	K	V	E	K	F	T	D	K	S	L	G	Y	K	L	V	N	T	D	K	K	G	R	.	Y	R	I	T	K	D	I	F	T	D	.	V	K	R	N	S	L	I	M	K	A	K	F	E	A	L	E
Template Known Secondary structure		S	T	T														S	S	S				B												S	S	T	T											T	T	S	S	.											.	S	S	S	S											S	S
Template Predicted Secondary structure																																																						.											.
Template SS confidence
		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.		.	.	120	.	.	.	.	.	.	.		.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
		142	.	.		.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.							.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200							.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.																					.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.																					.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	D	A	.	S	V	L	I	S	T	G	I	D	A	T	Q	T	N	H	G	R	Q	H	L	.	.	.	.	.	.	D	E	T	Q	V	R	V	F	G	Q	H	L	M	Q	G	S	Y	T	T	Q	D	G	R	S	D	V	A	I	S	C	C	C	K	V	S	G	.	.	.	.	.	.	D	V	Q	Q	C	Y	T	A
Query Conservation					.																					.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																					.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	S	I	H	D	Y	K	L	Y	L	A	Y	D	P	H	I	K	N	Q	G	S	Y	N	E	G	Y	V	I	K	A	N	N	N	E	M	L	M	A	K	R	D	N	V	Y	T	A	L	S	S	N	I	G	W	K	G	Y	S	I	G	Y	Y	K	V	N	D	I	M	T	D	L	D	E	N	K	Q	M	T	K	H	Y
Template Known Secondary structure		S		G	G	G											T	T	T	B	S	S	S									T	T									T	T								T	T			S							T	T	T	T	S									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	R	R	L	L	Q	H	T	S	A	Q	L	H	A	G	E	T	M	T	L	Q	K	L	V	W	I	D	W	R	D	D	R	Q	A	A	L	D	E	W	G	S	A	S	L	R	Q	L	E	M	C	A	Q	Q	S	Y	D	Q	L	L	A	A	S	T	E	N	W	R	Q	W	W	Q	K	R	R	I	T	V	N	G
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Sequence		D	S	A	R	G	N	I	I	E	G	A	E	I	D	L	T	K	N	S	E	F	E	I	V	L	S	F	G	Q	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	E	A	A	K	T	A	L	E	T	L	G	E	D	Y	N	N	L	K	N	N	Y	I	D	E	W	T	K	Y	C	N	T	.	.	.	.	L	N	N
Template Known Secondary structure							S									T	T	T		S										S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														S																		T	T	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.											.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.					.	.	.
		289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.										320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	E	A	H	D	Q	Q	A	L	D	Y	A	L	Y	H	L	R	I	M	T	P	A	H	D	E	R	S	S	I	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	L	T	G	E	G	Y	K	G	H	V	F	W	D	T	E	V	F	L	L	P	F	H	L	F	S	D	P	T	V	A	R	S	L	L	R	Y	R	W
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	N	G	K	A	N	S	L	Y	Y	N	S	M	M	I	L	K	A	S	E	D	K	T	N	K	G	A	Y	I	A	S	L	S	I	P	W	G	D	G	Q	R	D	D	N	T	G	G	Y	H	L	V	W	S	R	D	L	Y	H	V	A	N	A	F	I	A	A	G	D	V	D	S	A	N	R	S	L	D	Y	L	A
Template Known Secondary structure		T	T	T	T														T	T	B		S	S	S	T	T		B		S		S	S		T	T	G	G	G	S	B	S	B	S			G	G	G	S	B																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	N	L	P	G	A	Q	E	K	A	R	R	N	G	W	Q	G	A	L	F	P	W	E	S	A	R	S	G	E	E	E	T	P	E	F	A	A	I	N	I	R	T	G	L	R	Q	K	V	A	S	A	Q	A	E	H	H	L	V	A	D	I	A	W	A	V	I	Q	Y	W	Q	T	T	G	D	E	S	F	I	A	H
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	V	V	K	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	M	I	P	Q	N	T	W	I	S	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	W	T	G	I	Q	L	D	E	Q	A	D	P	I	I	L	S	Y	R	L	K	R	Y	D	L	Y	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S			S		B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B																				T	T		G	G	G	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.												.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	M	A	L	L	L	E	T	A	K	F	W	I	S	R	A	V	R	V	N	D	R	L	E	I	H	D	V	I	G	P	D	E	Y	T	E	H	V	N	N	N	A	Y	T	S	Y	M	A	R	Y	N	V	Q	Q	A	L	N	I	A	R	Q	F	G	C	S	D	D	A	F	I	H	R	A	E	M	F	L	K	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Conservation		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Sequence		.	.	D	S	L	V	K	P	L	A	D	F	I	I	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	K	T	G	Q	E	R	W	E	E	I	G	G	Y	S	P	A	T	M	A	A	E	V	A	G	L	T	C	A	A	Y	I	A	E	Q	N	K	.	.	D	Y	E	S	A	Q	K	Y	Q	E	K	A	D	N
Template Known Secondary structure		.	.	T	T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	B	S	S		T	T	S	S			B	B																						T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template SS confidence
				415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.											.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.			.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
		520
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		W
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		481