Job Description P0A6W9 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:04:07 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 339 % Identity 19% Template c1tt4B_ PDB info PDB header:structural genomics, unknown function Chain: B: PDB Molecule:putative cytoplasmic protein; PDBTitle: structure of np459575, a predicted glutathione synthase from2 salmonella typhimurium Resolution 2.80 Å

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		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.		.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.			.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.		.
Predicted Secondary structure																.												.	.																																																		.		.
Query SS confidence																.												.	.																																																		.		.
Query Sequence		G	I	Q	R	G	L	E	R	E	T	L	R	V	N	.	A	D	G	T	L	A	T	T	G	H	P	.	.	E	A	L	G	S	A	L	T	H	K	W	I	T	T	D	F	A	E	A	L	L	E	F	I	T	P	V	D	G	D	I	E	H	M	L	T	F	M	R	D	L	H	R	Y	T	A	R	N	M	.	G	.
Query Conservation																.												.	.																																																		.		.
Alig confidence																.												.	.																																																		.		.
Template Conservation
Template Sequence		P	Y	T	L	G	I	E	L	E	M	Q	V	I	N	P	P	G	Y	D	L	S	Q	D	S	S	T	L	I	D	A	V	K	P	Q	L	T	A	G	E	I	K	H	D	I	T	E	S	M	L	E	M	A	T	G	V	C	R	D	I	D	Q	A	A	A	Q	L	S	A	M	Q	H	V	I	L	Q	A	A	S	E	H
Template Known Secondary structure		T	T													T	T	T			B		S										G	G	G		S	S							S	S	S	S								S	B	S	S																					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	E	R	M	W	P	L	S	M	P	C	Y	I	A	E	G	Q	D	I	E	L	A	Q	Y	G	T	S	N	T	G	R	F	K	T	L	Y	R	E	G	L	K	N	R	Y	G	A	L	M	Q	T	I	S	G	V	H	Y	N	F	S	L	P	M	A	F	W	Q	A	K	C	G	D	I	S	G	A	D	A	K	E	K
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	L	G	I	C	G	G	G	T	H	P	F	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	W	R	T	L	E	N	F	G	Y	L	I	Q	Q	A	T	V	F	G	Q	H	V	H	V	G	C	A	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T							S	S		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	G	G	G	T	S	S													S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	S	A	G	Y	F	R	V	I	R	N	Y	Y	R	F	G	W	V	I	P	Y	L	F	G	A	S	P	A	I	C	S	S	F	L	Q	G	K	P	T	S	L	P	F	E	K	T	E	C	G	M	Y	Y	L	P	Y	A	T	S	L	R	L	S	D	L	G	Y	T	N	K	S	Q	S	N	L	G	I	T	F	N	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.																										.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation		.	.																										.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Sequence		.	.	D	D	A	I	Y	L	L	H	G	L	S	H	F	V	P	H	F	I	A	L	S	A	A	S	P	.	.	.	.	.	Y	M	Q	G	A	D	T	R	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	A	R	L	N	I	F	S	A	F	.	.	P	D	N	G	P	M	P	W	V	S	N
Template Known Secondary structure		.	.												T	T											B		.	.	.	.	.			T	T				S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		G	G	G	G	G	T	T	S	.	.	T	T		B	S					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																										.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template SS confidence
				145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.						170	.	.	.	.	.	.	.	.	.																180	.	.	.	.	.	.	.	.	.			190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Y	E	Y	V	A	G	L	K	Q	A	I	K	T	P	S	E	E	Y	A	K	I	G	I	E	K	D	G	K	R	L	Q	I	N	S	N	V	L	Q	I	E	N	E	L	Y	A	P	I	R	P	K	R	V	T	R	S	G	E	S	P	S	D	A	L	L	R	G	G	I	E	Y	I	E	V	R	S	L	D	I	N
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	Q	E	F	A	G	L	F	R	R	L	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	M	I	D	S	I	K	D	L	H	W	D	I	R	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	F	G	T	V	E	V	R	V	M	D	T	P
Template Known Secondary structure													T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T		S	S	G	G	G			B	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230																.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	S	P	I	G	V	D	E	Q	Q	V	R	F	L	D	L	F	M	V	W	C	A	L	A	D	A	P	E	M	S	S	S	E	L	A	C	T	R	V	N	W	N	R	V	I	L	E	G	R	K	P	G	L	T	L	G	I	G	C	E	T	A	Q	F	P	L	P	Q	V	G	K	D	L	F	R	D	L	K	R
Query Conservation
Alig confidence									.	.																																											.	.
Template Conservation									.	.																																											.	.
Template Sequence		L	T	L	D	H	A	I	.	.	N	M	A	G	L	I	Q	A	T	A	H	W	L	L	T	E	R	P	F	K	P	Q	E	Q	D	Y	L	L	Y	K	F	N	R	F	Q	A	C	R	Y	G	L	E	.	.	G	V	L	T	D	A	Y	T	G	D	R	R	R	L	A	D	D	T	L	R	L	L	D	N	V	T	P
Template Known Secondary structure		S	S						.	.																							G	G	G	G	T	T											S	S	T	T	.	.	S					T	T	T																	T
Template Predicted Secondary structure									.	.																																											.	.
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.			.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.
Query SS confidence																																														.
Query Sequence		V	A	Q	T	L	D	S	I	N	G	G	E	A	Y	Q	K	V	C	D	E	L	V	A	C	F	D	N	P	D	L	T	F	S	A	R	I	L	R	S	M	I	D	T	G	.	I	G	G	T	G	K	A	F	A	E
Query Conservation																																														.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.													.																	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.													.
Template Sequence		S	A	R	K	L	G	A	D	.	.	.	.	.	.	.	S	A	I	D	A	L	R	L	Q	V	K	K	.	G	G	N	E	A	Q	Y	M	R	E	F	I	A	D	G	G	S	L	I	G	L	V	Q	K	H	C	E
Template Known Secondary structure							T			.	.	.	.	.	.	.												S	.														T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.								.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340		.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.