Job Description P0A6V1 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:03:59 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 333 % Identity 23% Template c2ggqA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:401aa long hypothetical glucose-1-phosphate PDBTitle: complex of hypothetical glucose-1-phosphate thymidylyltransferase from2 sulfolobus tokodaii Resolution 2.00 Å

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	K	S	V	A	L	I	L	A	G	G	R	G	T	R	L	K	D	L	T	N	K	R	A	K	P	A	V	H	F	G	G	K	F	R	I	I	D	F	A	L	S	N	C	I	N	S	G	I	R	R	M	G	V	I	T	Q	Y	Q	S	H	T	L	V	Q	H	I	Q	R	G	W	S	F	F	N	E	E	M	N	E
Query Conservation
Alig confidence				.	.																														.																																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.																														.																																								.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	.	.	A	F	I	L	A	A	G	S	G	E	R	L	E	P	I	T	H	T	R	P	K	A	F	V	P	I	L	S	K	.	P	L	I	E	Y	Q	I	E	Y	L	R	K	C	G	I	R	D	I	T	V	I	V	S	S	K	N	K	E	Y	F	E	K	K	L	K	E	I	S	I	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				.	.										G	G	G	T	T	G	G	G	T	S		G	G	G				T	T		.													T	T										G	G	G									T	T	S			.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.																														.																																								.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.			.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.		.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	V	D	L	L	P	A	Q	Q	R	M	K	G	E	N	W	Y	R	G	T	A	D	A	V	T	Q	N	L	D	I	I	R	R	Y	K	A	E	Y	V	V	I	L	A	G	D	H	I	Y	K	Q	D	Y	S	R	M	L	I	D	H	V	E	K	G	A	R	C	T	V	A	C	M	P	V	P	I	E	E	A	S	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	Q	K	D	D	I	K	G	T	G	A	A	I	L	.	.	.	.	.	.	S	A	K	F	N	D	E	A	L	I	I	Y	G	D	L	F	F	S	N	E	K	E	I	C	N	I	I	T	L	K	E	N	A	I	I	G	V	K	V	.	.	.	.	.	S	N	P	K	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T			S						T	.	.	.	.	.	.	T				S	S							T	T				S		S							T	T		S	S									.	.	.	.	.	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.
Template SS confidence
												71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.							.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.						.	.	.	.	.
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	G	V	M	A	V	D	E	N	D	K	I	I	E	F	V	E	K	P	A	N	P	P	S	M	P	N	D	P	S	K	S	L	A	S	M	G	I	Y	V	F	D	A	D	Y	L	Y	E	L	L	E	E	D	D	R	D	E	N	S	S	H	D	F	G	K	D	L	I	P	K	I	T	E	A	G	L	A	Y	A	H
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Sequence		Y	G	V	L	V	L	D	N	Q	N	N	L	S	K	I	I	E	K	P	E	I	P	P	.	.	.	.	.	.	.	S	N	L	I	N	A	G	I	Y	K	L	N	S	D	I	F	T	Y	L	D	K	I	.	.	S	I	S	E	R	G	E	L	E	L	T	D	A	I	N	L	M	A	K	D	H	R	V	K	V	I
Template Known Secondary structure		S							T	T	S	B							S		S	S		S	.	.	.	.	.	.	.		S											T	T									.	.				T	T	S	S														S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.								.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.			.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.				300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	F	P	L	S	C	V	Q	S	D	P	D	A	E	P	Y	W	R	D	V	G	T	L	E	A	Y	W	K	A	N	L	D	L	A	S	V	V	P	E	L	D	M	.	.	.	Y	D	R	N	W	P	I	R	T	Y	N	E	S	L	P	P	A	K	F	V	Q	D	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	Y	W	M	D	I	G	K	P	W	N	I	I	D	V	N	K	W	A	L	D	N	L	V	F	S	Q	N	L	G	N	V	E	D	N	V	K	I	K	G	K	V	I	I	E	E	D	A	E	I	K	S	G	T	Y	I	E	G	P	V	Y	I	G	K	G	S
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S							S															T							S				S	S					S						T	T					T	T					S	S					T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.												.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																													324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	H	G	M	T	L	N	S	L	V	S	G	G	C	V	I	S	G	S	V	V	V	Q	S	V	L	F	S	R	V	R	V	N	S	F	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.
Template Sequence		E	I	G	P	N	S	Y	L	R	P	Y	T	I	L	V	E	K	N	K	I	G	A	S	V	E	V	K	E	S	V	I	M	E	G	S	K	I	P	H	L	S	Y	V	G	D	S	V	I	A	E	D	V	N	F	G	A	G	T	L	I	A	N	.	.	.	.	L	R	F	D	E	K	E	V	K	V	N	V	K	G
Template Known Secondary structure					S	S					T	T					S	S											S					T	T											S					T	T					T	T						.	.	.	.	S		T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Template SS confidence
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.					.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		361	.	.	.	.		.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.															.
Query SS confidence							.															.
Query Sequence		N	I	D	S	A	.	V	L	L	P	E	V	W	V	G	R	S	C	R	L	.	R	R	C	V	I	D	R	A	C	V	I	P	E	G	M	V	I	G	E	N	A	E	E	D	A	R
Query Conservation							.															.
Alig confidence							.															.
Template Conservation
Template Sequence		K	R	I	S	S	G	R	R	K	L	G	A	F	I	G	G	H	V	R	T	G	I	N	V	T	I	L	P	G	V	K	I	G	A	Y	A	R	I	Y	P	G	A	V	V	N	R	D
Template Known Secondary structure							S		S	S							T	T					T	T					T	T					T	T					T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.