Job Description P25552 Confidence 97.51% Date Thu Jan 5 11:42:09 GMT 2012
Rank 37 Aligned Residues 102
% Identity 14% Template c3ccgA_
PDB info
PDB header: hydrolaseChain: A: PDB Molecule: hd superfamily hydrolase;
PDBTitle: crystal structure of predicted hd superfamily hydrolase involved in2 nad metabolism (np_347894.1) from clostridium acetobutylicum at 1.503 a resolution
Resolution 1.50 Å
Show / Hide SS confidence
Show / Hide Conservation and Alignment quality
   
324 . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360 . . . . . . . . . 370 .
. . . . . . . . 380
Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Query SS confidence  
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
Query Sequence  
I D Q A Q R V A K V A A N F F D Q V E N E W H L E A I S R D L L I S A C Q L H E I G L S V D F K .
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
Q A P Q H A A Y L
Query Conservation  
                                                          . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .        
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
              . . . .         . . .                                                                              
Template Sequence  
Y K H S L G V X D T A V R L .
.
.
.
A G I Y N E D .
.
.
T E K A R I A G L V H D C A K K L P G E K I I E I C T N E G Y E L G D E D I R N S Y L L H G L A G R I L
Template Known Secondary structure  
. . . . T . . . T T T T T T S T T T T T T .
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . .
Template SS confidence  
   
20 . . . . . . . . . 30 . . .
. . . . . . 40
. . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60 . . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . .
 
   
381 . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420 . . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
V R N L D L P G F T P A Q K K L L A T L L L N Q T N P V D L S S L H Q Q N A V P P R V A E Q L C R L L R L A I I F A S R R R D D L V P E M T
Query Conservation  
                                                                                               
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
    . .             . . .                         . . . . . . . . . . . . .                                    
Template Sequence  
A K K .
.
V I G I D D E .
.
.
D V L N A I E F H T T G R P N X S .
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
L L E K I I Y I A D Y I E P G R E F K G V D E L R
Template Known Secondary structure  
. . T T . . . T T T T S S . . . . . . . . . . . . . S T T T T
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template SS confidence  
   
93 . .
. . . . 100 . .
. . . . . . . 110 . . . . . . . . .
120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]